Changes between Initial Version and Version 1 of Ticket #18189


Ignore:
Timestamp:
Jul 14, 2025, 9:43:03 AM (3 months ago)
Author:
pett
Comment:

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified
  • Ticket #18189

    • Property Component UnassignedThird Party
    • Property Owner set to Hanjin Liu
    • Property Platformall
    • Property ProjectChimeraX
    • Property Status newassigned
    • Property Summary ChimeraX bug report submissionCliX: path completion: File name too long
  • Ticket #18189 – Description

    initial v1  
    14471447> hide #!1 models
    14481448
    1449 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1450 > Fingerprint_Final/02_mC3a-mC3aR-
    1451 > Go/cryosparc_P467_J79_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc
    1452 
    1453 Opened cryosparc_P467_J79_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1454 #28, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at level 0.000993, step 1,
    1455 values float32 
    1456 
    1457 > rename #28 02_Density_mC3a-mC3aR-Go
    1458 
    1459 > select add #2
    1460 
    1461 7975 atoms, 8155 bonds, 5 pseudobonds, 1110 residues, 2 models selected 
    1462 
    1463 > select add #14
    1464 
    1465 8072 atoms, 8253 bonds, 5 pseudobonds, 1122 residues, 3 models selected 
    1466 
    1467 > graphics selection width 0.5
    1468 
    1469 > view position #28 sameAsModels #2
    1470 
    1471 > volume #28 level 0.1983
    1472 
    1473 > hide #!28 models
    1474 
    1475 > hide #!2 models
    1476 
    1477 > hide #!14 models
    1478 
    1479 > select subtract #14
    1480 
    1481 7975 atoms, 8155 bonds, 5 pseudobonds, 1110 residues, 2 models selected 
    1482 
    1483 > select subtract #2
    1484 
    1485 Nothing selected 
    1486 
    1487 > show #!4 models
    1488 
    1489 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1490 > Fingerprint_Final/04_mC5a-mC5aR1-Go/cryosparc_P133_J3092_006_volume_map_sharp_deepEMhancer-
    1491 > sharpened.mrc
    1492 
    1493 Opened cryosparc_P133_J3092_006_volume_map_sharp_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1494 #29, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at level 0.000387, step 1,
    1495 values float32 
    1496 
    1497 > rename #29 04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    1498 
    1499 > view position #29 sameAsModels #4
    1500 
    1501 > volume #29 level 0.1127
    1502 
    1503 > show #!28 models
    1504 
    1505 > hide #!28 models
    1506 
    1507 > hide #!29 models
    1508 
    1509 > show #!29 models
    1510 
    1511 > show #!1 models
    1512 
    1513 > hide #!1 models
    1514 
    1515 > show #!1 models
    1516 
    1517 > hide #!1 models
    1518 
    1519 > show #!2 models
    1520 
    1521 > hide #!29 models
    1522 
    1523 > hide #!4 models
    1524 
    1525 > hide #!2 models
    1526 
    1527 > show #!4 models
    1528 
    1529 > show #!2 models
    1530 
    1531 > hide #!4 models
    1532 
    1533 > hide #!2 models
    1534 
    1535 > show #!5 models
    1536 
    1537 > hide #!5 models
    1538 
    1539 > show #!5 models
    1540 
    1541 > show #!29 models
    1542 
    1543 > hide #!29 models
    1544 
    1545 > show #!29 models
    1546 
    1547 > hide #!5 models
    1548 
    1549 > show #!4 models
    1550 
    1551 > hide #!4 models
    1552 
    1553 > show #!5 models
    1554 
    1555 > hide #!29 models
    1556 
    1557 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1558 > Fingerprint_Final/05_hTLQP-mC3aR-
    1559 > Go/cryosparc_P133_J4401_007_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1560 > sharpened_inverse.mrc
    1561 
    1562 Opened cryosparc_P133_J4401_007_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1563 sharpened_inverse.mrc as #30, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at
    1564 level 0.00314, step 1, values float32 
    1565 
    1566 > rename #30 05_Density_hTLQP-mC3aR-Go
    1567 
    1568 > hide #!30 models
    1569 
    1570 > show #!30 models
    1571 
    1572 > volume #30 level 0.1716
    1573 
    1574 > volume #30 level 0.08574
    1575 
    1576 > view position #30 sameAsModels #5
    1577 
    1578 > volume #30 level 0.07582
    1579 
    1580 > hide #!30 models
    1581 
    1582 > hide #!5 models
    1583 
    1584 > show #!6 models
    1585 
    1586 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1587 > Fingerprint_Final/06_mTLQP-mC3aR-
    1588 > Go/cryosparc_P133_J3925_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1589 > sharpened_inverse.mrc
    1590 
    1591 Opened cryosparc_P133_J3925_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1592 sharpened_inverse.mrc as #31, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at
    1593 level 0.00125, step 1, values float32 
    1594 
    1595 > rename #31 06_Density_mTLQP-mC3aR-Go
    1596 
    1597 > volume #31 level 0.1492
    1598 
    1599 > view position #31 sameAsModels #6
    1600 
    1601 > hide #!31 models
    1602 
    1603 > hide #!6 models
    1604 
    1605 > show #!7 models
    1606 
    1607 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1608 > Fingerprint_Final/07_EP67-hC5aR1-Go/cryosparc_P13_J141_014_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1609 > sharpened.mrc
    1610 
    1611 Opened cryosparc_P13_J141_014_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1612 #32, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00354, step 1, values
    1613 float32 
    1614 
    1615 > rename #32 07_Density_EP67-hC5aR1-Go
    1616 
    1617 > volume #32 level 0.1542
    1618 
    1619 > view position #32 sameAsModels #7
    1620 
    1621 > hide #!32 models
    1622 
    1623 > show #!8 models
    1624 
    1625 > hide #!7 models
    1626 
    1627 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1628 > Fingerprint_Final/08_EP67-mC5aR1-Go/cryosparc_P4_J487_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1629 > sharpened.mrc
    1630 
    1631 Opened cryosparc_P4_J487_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1632 #33, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.000959, step 1,
    1633 values float32 
    1634 
    1635 > volume #33 level 0.173
    1636 
    1637 > rename #33 08_Density_EP67-mC5aR1-Go
    1638 
    1639 > view position #33 sameAsModels #8
    1640 
    1641 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1642 > Fingerprint_Final/09_EP67-hC3aR-
    1643 > Go/cryosparc_P467_J475_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc
    1644 
    1645 Opened cryosparc_P467_J475_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1646 #34, grid size 256,256,256, pixel 1.28, shown at level 0.000973, step 1,
    1647 values float32 
    1648 
    1649 > hide #!33 models
    1650 
    1651 > show #!9 models
    1652 
    1653 > hide #!8 models
    1654 
    1655 > rename #34 09_Density_EP67-hC3aR-Go
    1656 
    1657 > view position #34 sameAsModels #9
    1658 
    1659 > volume #34 level 0.1824
    1660 
    1661 > hide #!34 models
    1662 
    1663 > hide #!9 models
    1664 
    1665 > show #!10 models
    1666 
    1667 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1668 > Fingerprint_Final/10_EP67-mC3aR-
    1669 > Go/cryosparc_P467_J645_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc
    1670 
    1671 Opened cryosparc_P467_J645_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1672 #35, grid size 256,256,256, pixel 1.28, shown at level 0.000834, step 1,
    1673 values float32 
    1674 
    1675 > volume #35 level 0.1993
    1676 
    1677 > rename #10 09_EP67-hC3aR-Go
    1678 
    1679 > undo
    1680 
    1681 [Repeated 9 time(s)]
    1682 
    1683 > rename #10 10_EP67-mC3aR-Go
    1684 
    1685 > rename #35 10_EP67-mC3aR-Go
    1686 
    1687 > hide #!32 models
    1688 
    1689 > hide #!33 models
    1690 
    1691 > hide #!34 models
    1692 
    1693 > show #!10 models
    1694 
    1695 > rename #35 10_Density_EP67-mC3aR-Go
    1696 
    1697 > view position #35 sameAsModels #10
    1698 
    1699 > hide #!10 models
    1700 
    1701 > hide #!35 models
    1702 
    1703 > show #!11 models
    1704 
    1705 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1706 > Fingerprint_Final/11_JR14a-hC3aR-Go/J209_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1707 > sharpened.mrc
    1708 
    1709 Opened J209_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as #36, grid size
    1710 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00107, step 1, values float32 
    1711 
    1712 > volume #36 level 0.2007
    1713 
    1714 > rename #36 11_Density_JR14A-hC3aR-Go
    1715 
    1716 > view position #36 sameAsModels #11
    1717 
    1718 > volume #36 level 0.1143
    1719 
    1720 > hide #!36 models
    1721 
    1722 > hide #!11 models
    1723 
    1724 > show #!12 models
    1725 
    1726 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1727 > Fingerprint_Final/12_JR14a-mC3aR-
    1728 > Go/cryosparc_P5_J435_006_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc
    1729 
    1730 Opened cryosparc_P5_J435_006_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1731 #37, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00132, step 1, values
    1732 float32 
    1733 
    1734 > rename #37 12_Density_JR14-mC3aR-Go
    1735 
    1736 > view position #37 sameAsModels #12
    1737 
    1738 > volume #37 level 0.09771
    1739 
    1740 > hide #!37 models
    1741 
    1742 > hide #!12 models
    1743 
    1744 > show #!13 models
    1745 
    1746 > hide #!13 models
    1747 
    1748 > show #!27 models
    1749 
    1750 > hide #!27 models
    1751 
    1752 > show #!27 models
    1753 
    1754 > show #!28 models
    1755 
    1756 > hide #!28 models
    1757 
    1758 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1759 > Fingerprint_Final/13_SB219057-hC3aR-
    1760 > Go/Overall/cryosparc_P32_J111_008_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1761 > sharpened.mrc
    1762 
    1763 Opened cryosparc_P32_J111_008_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    1764 #38, grid size 220,220,220, pixel 1.06, shown at level 0.00642, step 1, values
    1765 float32 
    1766 
    1767 > rename #38 13_Density_SB-hC3aR-Go_Overall
    1768 
    1769 > view position #38 sameAsModels #27
    1770 
    1771 > volume #38 level 0.1714
    1772 
    1773 > hide #!27 models
    1774 
    1775 > show #!15 models
    1776 
    1777 > hide #!38 models
    1778 
    1779 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1780 > Fingerprint_Final/14_mC5a-hC5aR1-Go/cryosparc_P133_J2856_007_volume_map_sharp.mrc
    1781 
    1782 Opened cryosparc_P133_J2856_007_volume_map_sharp.mrc as #39, grid size
    1783 360,360,360, pixel 0.92, shown at level 0.0281, step 2, values float32 
    1784 
    1785 > rename #39 14_Density_mC5a-hC5aR1-Go
    1786 
    1787 > view position #39 sameAsModels #15
    1788 
    1789 > volume #39 level 0.1335
    1790 
    1791 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1792 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    1793 
    1794 > hide #!15 models
    1795 
    1796 > show #!16 models
    1797 
    1798 > hide #!39 models
    1799 
    1800 > volume #39 step 1
    1801 
    1802 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1803 > Fingerprint_Final/17_mC5adesArg-
    1804 > mC5aR1-Go/cryosparc_P133_J5422_006_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1805 > sharpened.mrc
    1806 
    1807 Opened cryosparc_P133_J5422_006_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc
    1808 as #40, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at level 0.0027, step 1,
    1809 values float32 
    1810 
    1811 > volume #40 level 0.1122
    1812 
    1813 > rename #40 17_Density_mC5adesArg-mC5aR1-Go
    1814 
    1815 > show #!18 models
    1816 
    1817 > hide #!16 models
    1818 
    1819 > view position #40 sameAsModels #18
    1820 
    1821 > hide #!18 models
    1822 
    1823 > show #!19 models
    1824 
    1825 > hide #!40 models
    1826 
    1827 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1828 > Fingerprint_Final/18_hC5adesArg-
    1829 > mC5aR1-Go/cryosparc_P133_J5081_008_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1830 > sharpened_inverse.mrc
    1831 
    1832 Opened cryosparc_P133_J5081_008_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    1833 sharpened_inverse.mrc as #41, grid size 288,288,288, pixel 1.15, shown at
    1834 level 0.00435, step 2, values float32 
    1835 
    1836 > show #!20 models
    1837 
    1838 > hide #!19 models
    1839 
    1840 > rename #41 18_Density_hC5adesArg-mC5aR1-Go
    1841 
    1842 > volume #41 level 0.1431
    1843 
    1844 > view position #41 sameAsModels #20
    1845 
    1846 > volume #41 level 0.1119
    1847 
    1848 > hide #!20 models
    1849 
    1850 > show #!21 models
    1851 
    1852 > hide #!41 models
    1853 
    1854 > hide #!21 models
    1855 
    1856 > show #!20 models
    1857 
    1858 > hide #!20 models
    1859 
    1860 > show #!20 models
    1861 
    1862 > show #!41 models
    1863 
    1864 > hide #!41 models
    1865 
    1866 > hide #!20 models
    1867 
    1868 > show #!28 models
    1869 
    1870 > show #!29 models
    1871 
    1872 > show #!30 models
    1873 
    1874 > show #!31 models
    1875 
    1876 > show #!32 models
    1877 
    1878 > show #!33 models
    1879 
    1880 > show #!34 models
    1881 
    1882 > show #!35 models
    1883 
    1884 > show #!36 models
    1885 
    1886 > show #!37 models
    1887 
    1888 > show #!38 models
    1889 
    1890 > show #!39 models
    1891 
    1892 > show #!40 models
    1893 
    1894 > show #!41 models
    1895 
    1896 > hide #!41 models
    1897 
    1898 > hide #!40 models
    1899 
    1900 > hide #!39 models
    1901 
    1902 > hide #!38 models
    1903 
    1904 > hide #!37 models
    1905 
    1906 > hide #!35 models
    1907 
    1908 > hide #!36 models
    1909 
    1910 > hide #!34 models
    1911 
    1912 > hide #!33 models
    1913 
    1914 > hide #!32 models
    1915 
    1916 > show #!32 models
    1917 
    1918 > hide #!31 models
    1919 
    1920 > hide #!32 models
    1921 
    1922 > hide #!30 models
    1923 
    1924 > hide #!29 models
    1925 
    1926 > show #!29 models
    1927 
    1928 > hide #!28 models
    1929 
    1930 > hide #!29 models
    1931 
    1932 > show #!28 models
    1933 
    1934 > show #!2 models
    1935 
    1936 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    1937 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    1938 
    1939 > ui tool show "Hide Dust"
    1940 
    1941 > ui tool show "Color Zone"
    1942 
    1943 > surface dust #28 size 7.76
    1944 
    1945 > surface dust #28 size 9.84
    1946 
    1947 > volume #28 level 0.1478
    1948 
    1949 > surface dust #28 size 12.72
    1950 
    1951 > volume #28 level 0.1254
    1952 
    1953 > surface dust #28 size 14.46
    1954 
    1955 > volume #28 level 0.1422
    1956 
    1957 > color #2/E #ca2727
    1958 
    1959 > color #14/D #aeaeae
    1960 
    1961 > color zone #28 near #2 distance 7.76
    1962 
    1963 > color zone #28 near #14 distance 7.76
    1964 
    1965 > color zone #28 near #14 distance 1.58
    1966 
    1967 > color single #28
    1968 
    1969 [Repeated 1 time(s)]
    1970 
    1971 > color zone #28 near #14 distance 1.49
    1972 
    1973 > color zone #28 near #2 distance 1.49
    1974 
    1975 > color zone #28 near #2 distance 5.14
    1976 
    1977 > color zone #28 near #2 distance 3.93
    1978 
    1979 > color zone #28 near #2 distance 12.82
    1980 
    1981 > color zone #28 near #14 distance 20.68
    1982 
    1983 > undo
    1984 
    1985 [Repeated 2 time(s)]
    1986 
    1987 > color zone #28 near #2 distance 20.68
    1988 
    1989 > color zone #28 near #2 distance 15.17
    1990 
    1991 > color zone #28 near #2 distance 14.96
    1992 
    1993 > color zone #28 near #14 distance 14.96
    1994 
    1995 > color zone #28 near #2 distance 14.96
    1996 
    1997 > color zone #28 near #2 distance 10.09
    1998 
    1999 > color zone #28 near #2 distance 10.02
    2000 
    2001 > color zone #28 near #2 distance 9.95
    2002 
    2003 > color zone #28 near #2 distance 6.34
    2004 
    2005 > hide #!28 models
    2006 
    2007 > hide #!2 models
    2008 
    2009 > show #!4 models
    2010 
    2011 > show #!29 models
    2012 
    2013 > color zone #29 near #4 distance 7.76
    2014 
    2015 > volume #29 level 0.1242
    2016 
    2017 > surface dust #29 size 3.18
    2018 
    2019 > surface dust #29 size 2.39
    2020 
    2021 > surface dust #29 size 2.41
    2022 
    2023 > surface dust #29 size 2.43
    2024 
    2025 > surface dust #29 size 2.45
    2026 
    2027 > surface dust #29 size 2.47
    2028 
    2029 > surface dust #29 size 2.49
    2030 
    2031 > surface dust #29 size 2.51
    2032 
    2033 > surface dust #29 size 2.53
    2034 
    2035 [Repeated 1 time(s)]
    2036 
    2037 > surface dust #29 size 4.07
    2038 
    2039 [Repeated 1 time(s)]
    2040 
    2041 > surface dust #29 size 4.35
    2042 
    2043 > surface dust #29 size 6.18
    2044 
    2045 > color #4/F #f277b5
    2046 
    2047 > color zone #29 near #4 distance 7.76
    2048 
    2049 > hide #!29 models
    2050 
    2051 > show #!30 models
    2052 
    2053 > show #!5 models
    2054 
    2055 > hide #!4 models
    2056 
    2057 > volume #30 level 0.08985
    2058 
    2059 > surface dust #30 size 7.76
    2060 
    2061 > volume #30 level 0.04497
    2062 
    2063 > volume #30 level 0.08985
    2064 
    2065 > volume #30 level 0.08704
    2066 
    2067 > surface dust #30 size 26.61
    2068 
    2069 > surface dust #30 size 40.92
    2070 
    2071 > hide #!30 models
    2072 
    2073 > show #!30 models
    2074 
    2075 > show #!31 models
    2076 
    2077 > hide #!30 models
    2078 
    2079 > show #!30 models
    2080 
    2081 > hide #!31 models
    2082 
    2083 > volume #30 level 0.06741
    2084 
    2085 > surface dust #30 size 39.86
    2086 
    2087 > volume #30 level 0.08985
    2088 
    2089 > color zone #30 near #5 distance 7.76
    2090 
    2091 > select ~sel & ##selected
    2092 
    2093 Nothing selected 
    2094 
    2095 > color #5/D #e76c95
    2096 
    2097 > color zone #30 near #5 distance 7.76
    2098 
    2099 > hide #!5 models
    2100 
    2101 > hide #!30 models
    2102 
    2103 > show #!31 models
    2104 
    2105 > show #!6 models
    2106 
    2107 > surface dust #31 size 7.76
    2108 
    2109 > volume #31 level 0.1083
    2110 
    2111 > volume #31 level 0.0792
    2112 
    2113 > surface dust #31 size 25.6
    2114 
    2115 > volume #31 level 0.08211
    2116 
    2117 > color zone #31 near #6 distance 7.76
    2118 
    2119 > color #6/B #ffff00
    2120 
    2121 > color zone #31 near #6 distance 7.76
    2122 
    2123 > color #6/D #e103e1
    2124 
    2125 > color zone #31 near #6 distance 7.76
    2126 
    2127 > hide #!6 models
    2128 
    2129 > show #!7 models
    2130 
    2131 > hide #!31 models
    2132 
    2133 > show #!32 models
    2134 
    2135 > volume #32 level 0.1137
    2136 
    2137 > volume #32 level 0.2041
    2138 
    2139 > surface dust #32 size 7.26
    2140 
    2141 > volume #32 level 0.1729
    2142 
    2143 > volume #32 level 0.1168
    2144 
    2145 > volume #32 level 0.09186
    2146 
    2147 > surface dust #32 size 11.68
    2148 
    2149 > volume #32 level 0.08874
    2150 
    2151 > color zone #32 near #7 distance 7.26
    2152 
    2153 > color #7/A #b366ff
    2154 
    2155 > color zone #32 near #7 distance 7.26
    2156 
    2157 > color #7,8,9,10/D #bf9000
    2158 
    2159 > color zone #32 near #7 distance 7.26
    2160 
    2161 > select clear
    2162 
    2163 > hide #!7 models
    2164 
    2165 > show #!8 models
    2166 
    2167 > show #!33 models
    2168 
    2169 > hide #!32 models
    2170 
    2171 > volume #33 level 0.1276
    2172 
    2173 > volume #33 level 0.1087
    2174 
    2175 > surface dust #33 size 7.26
    2176 
    2177 > volume #33 level 0.08222
    2178 
    2179 > color zone #32 near #7 distance 7.26
    2180 
    2181 > color zone #33 near #8 distance 7.26
    2182 
    2183 > color #8/A #4c19f8
    2184 
    2185 > color zone #33 near #8 distance 7.26
    2186 
    2187 > hide #!33 models
    2188 
    2189 > show #!34 models
    2190 
    2191 > show #!9 models
    2192 
    2193 > hide #!8 models
    2194 
    2195 > volume #34 level 0.1263
    2196 
    2197 > surface dust #34 size 7.67
    2198 
    2199 > volume #34 level 0.08776
    2200 
    2201 > surface dust #34 size 9.76
    2202 
    2203 > color zone #33 near #8 distance 7.26
    2204 
    2205 > color zone #34 near #9 distance 7.67
    2206 
    2207 > color #9/C #e56666
    2208 
    2209 > color zone #34 near #9 distance 7.67
    2210 
    2211 > hide #!34 models
    2212 
    2213 > show #!35 models
    2214 
    2215 > hide #!9 models
    2216 
    2217 > show #!10 models
    2218 
    2219 > color zone #35 near #10 distance 7.67
    2220 
    2221 > color #10/C #ccccff
    2222 
    2223 > color zone #35 near #10 distance 7.67
    2224 
    2225 > select #10/D
    2226 
    2227 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    2228 
    2229 > hide sel atoms
    2230 
    2231 > surface dust #35 size 7.67
    2232 
    2233 > surface dust #35 size 6.86
    2234 
    2235 > volume #35 level 0.1427
    2236 
    2237 > surface dust #35 size 11.75
    2238 
    2239 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2240 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    2241 
    2242 > hide #!10 models
    2243 
    2244 > show #!11 models
    2245 
    2246 > select add #10
    2247 
    2248 8173 atoms, 8359 bonds, 6 pseudobonds, 1122 residues, 2 models selected 
    2249 
    2250 > select subtract #10
    2251 
    2252 Nothing selected 
    2253 
    2254 > show #!36 models
    2255 
    2256 > hide #!35 models
    2257 
    2258 > volume #36 level 0.06639
    2259 
    2260 > surface dust #36 size 7.26
    2261 
    2262 > surface dust #36 size 18.1
    2263 
    2264 > volume #36 level 0.05534
    2265 
    2266 > surface dust #36 size 30.49
    2267 
    2268 > color zone #35 near #10 distance 7.67
    2269 
    2270 > color zone #36 near #11 distance 7.26
    2271 
    2272 > surface dust #36 size 30.7
    2273 
    2274 > surface dust #36 size 59.71
    2275 
    2276 > surface dust #36 size 21.42
    2277 
    2278 > volume #36 level 0.0627
    2279 
    2280 [Repeated 1 time(s)]
    2281 
    2282 > color zone #36 near #11 distance 34.22
    2283 
    2284 > volume #36 level 0.0848
    2285 
    2286 > volume #36 level 0.04429
    2287 
    2288 > surface dust #36 size 31.52
    2289 
    2290 > color 11/C:JR1 #7030a0
    2291 
    2292 Expected a color or one of 'byatom', 'bychain', 'byelement', 'byhetero',
    2293 'byidentity', 'bymodel', 'bynucleotide', 'bypolymer', 'fromatoms',
    2294 'fromcartoons', 'fromribbons', or 'random' or a keyword 
    2295 
    2296 > color #11/C:JR1 #7030a0
    2297 
    2298 > color zone #36 near #11 distance 34.22
    2299 
    2300 > color #11/C #831616
    2301 
    2302 > color zone #36 near #11 distance 34.22
    2303 
    2304 [Repeated 1 time(s)]
    2305 
    2306 > hide #!36 models
    2307 
    2308 > show #!37 models
    2309 
    2310 > show #!12 models
    2311 
    2312 > hide #!11 models
    2313 
    2314 > volume #37 level 0.1089
    2315 
    2316 > surface dust #37 size 7.26
    2317 
    2318 > volume #37 level 0.1573
    2319 
    2320 > surface dust #37 size 7.26
    2321 
    2322 > surface dust #37 size 10.22
    2323 
    2324 > volume #37 level 0.1312
    2325 
    2326 > color zone #37 near #12 distance 7.26
    2327 
    2328 > hide #!12 models
    2329 
    2330 > show #!13 models
    2331 
    2332 > hide #!37 models
    2333 
    2334 > show #!38 models
    2335 
    2336 > color zone #38 near #27 distance 6.34
    2337 
    2338 > color #12/E #99ccff
    2339 
    2340 > color zone #38 near #27 distance 6.34
    2341 
    2342 > color #13/C #993366
    2343 
    2344 > color zone #38 near #27 distance 6.34
    2345 
    2346 > color #27/C #993366
    2347 
    2348 > color zone #38 near #27 distance 6.34
    2349 
    2350 > volume #38 level 0.1243
    2351 
    2352 > volume #38 level 0.07444
    2353 
    2354 > surface dust #38 size 11.19
    2355 
    2356 > hide #!38 models
    2357 
    2358 > show #!38 models
    2359 
    2360 > hide #!13 models
    2361 
    2362 > hide #!38 models
    2363 
    2364 > show #!39 models
    2365 
    2366 > show #!15 models
    2367 
    2368 > volume #39 level 0.1134
    2369 
    2370 > surface dust #39 size 5.52
    2371 
    2372 > volume #39 level 0.1295
    2373 
    2374 > surface dust #39 size 9.1
    2375 
    2376 > volume #39 level 0.09735
    2377 
    2378 > surface dust #39 size 13.84
    2379 
    2380 > surface dust #39 size 21.01
    2381 
    2382 > volume #39 level 0.1134
    2383 
    2384 > color zone #39 near #15 distance 5.52
    2385 
    2386 > select #15/F
    2387 
    2388 492 atoms, 497 bonds, 2 pseudobonds, 71 residues, 2 models selected 
    2389 
    2390 > hide sel atoms
    2391 
    2392 > volume #39 level 0.09333
    2393 
    2394 > color zone #39 near #15 distance 5.52
    2395 
    2396 [Repeated 1 time(s)]
    2397 
    2398 > color #15/F #f277b5
    2399 
    2400 > color zone #39 near #15 distance 5.52
    2401 
    2402 > volume #39 level 0.1174
    2403 
    2404 > hide #!15 models
    2405 
    2406 > hide #!39 models
    2407 
    2408 > show #!40 models
    2409 
    2410 > show #!16 models
    2411 
    2412 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2413 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    2414 
    2415 ——— End of log from Mon Feb 3 23:49:44 2025 ———
    2416 
    2417 opened ChimeraX session 
    2418 
    2419 > ui tool show "Color Zone"
    2420 
    2421 > ui tool show "Hide Dust"
    2422 
    2423 > color zone #40 near #18 distance 7.76
    2424 
    2425 > surface dust #40 size 7.76
    2426 
    2427 > surface dust #40 size 15.22
    2428 
    2429 > volume #40 level 0.1931
    2430 
    2431 > hide #!16 models
    2432 
    2433 > show #!18 models
    2434 
    2435 > volume #40 level 0.08
    2436 
    2437 > volume #40 level 0.0283
    2438 
    2439 > color zone #40 near #18 distance 7.78
    2440 
    2441 > surface dust #40 size 84.98
    2442 
    2443 [Repeated 1 time(s)]
    2444 
    2445 > surface dust #40 size 134.44
    2446 
    2447 > color zone #40 near #18 distance 7.08
    2448 
    2449 > volume #40 level 0.04769
    2450 
    2451 > color zone #40 near #18 distance 16.18
    2452 
    2453 > volume #40 level 0.04769
    2454 
    2455 > color #15/F #ff33ff
    2456 
    2457 > color zone #40 near #18 distance 16.18
    2458 
    2459 [Repeated 1 time(s)]
    2460 
    2461 > color #18/F #ff33ff
    2462 
    2463 > color zone #40 near #18 distance 16.18
    2464 
    2465 > hide #!40 models
    2466 
    2467 > show #!41 models
    2468 
    2469 > show #!20 models
    2470 
    2471 > hide #!18 models
    2472 
    2473 > volume #41 step 1
    2474 
    2475 > volume #41 level 0.2282
    2476 
    2477 > surface dust #40 size 134.44
    2478 
    2479 > color zone #41 near #20 distance 6.9
    2480 
    2481 > color #20/D #99ff33
    2482 
    2483 > color zone #41 near #20 distance 6.9
    2484 
    2485 > volume #41 level 0.1141
    2486 
    2487 > volume #41 level 0.0883
    2488 
    2489 > surface dust #41 size 6.9
    2490 
    2491 > surface dust #41 size 16.8
    2492 
    2493 > volume #41 level 0.06621
    2494 
    2495 > surface dust #41 size 64.22
    2496 
    2497 > surface dust #41 size 129.21
    2498 
    2499 [Repeated 1 time(s)]
    2500 
    2501 > surface dust #41 size 127.34
    2502 
    2503 > volume #41 level 0.09934
    2504 
    2505 > color zone #41 near #20 distance 16.05
    2506 
    2507 > volume #41 level 0.09566
    2508 
    2509 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2510 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    2511 
    2512 > hide #!20 models
    2513 
    2514 > select add #15
    2515 
    2516 8623 atoms, 8799 bonds, 7 pseudobonds, 1199 residues, 2 models selected 
    2517 
    2518 > select subtract #15
    2519 
    2520 Nothing selected 
    2521 
    2522 > show #!40 models
    2523 
    2524 > show #!39 models
    2525 
    2526 > show #!38 models
    2527 
    2528 > show #!37 models
    2529 
    2530 > show #!36 models
    2531 
    2532 > show #!35 models
    2533 
    2534 > show #!34 models
    2535 
    2536 > show #!33 models
    2537 
    2538 > show #!32 models
    2539 
    2540 > show #!31 models
    2541 
    2542 > show #!30 models
    2543 
    2544 > show #!29 models
    2545 
    2546 > show #!28 models
    2547 
    2548 > hide #!28 models
    2549 
    2550 > hide #!29 models
    2551 
    2552 > hide #!30 models
    2553 
    2554 > hide #!31 models
    2555 
    2556 > hide #!32 models
    2557 
    2558 > hide #!33 models
    2559 
    2560 > hide #!40 models
    2561 
    2562 > hide #!39 models
    2563 
    2564 > hide #!41 models
    2565 
    2566 > hide #!38 models
    2567 
    2568 > hide #!37 models
    2569 
    2570 > hide #!36 models
    2571 
    2572 > hide #!35 models
    2573 
    2574 > hide #!34 models
    2575 
    2576 > show #!28 models
    2577 
    2578 > volume #28 level 0.1391
    2579 
    2580 > show #!29 models
    2581 
    2582 > show #!30 models
    2583 
    2584 > show #!31 models
    2585 
    2586 > show #!32 models
    2587 
    2588 > show #!34 models
    2589 
    2590 > show #!33 models
    2591 
    2592 > show #!35 models
    2593 
    2594 > show #!36 models
    2595 
    2596 > show #!37 models
    2597 
    2598 > show #!38 models
    2599 
    2600 > show #!39 models
    2601 
    2602 > show #!40 models
    2603 
    2604 > show #!41 models
    2605 
    2606 > hide #!41 models
    2607 
    2608 > hide #!40 models
    2609 
    2610 > hide #!39 models
    2611 
    2612 > hide #!38 models
    2613 
    2614 > hide #!37 models
    2615 
    2616 > hide #!36 models
    2617 
    2618 > hide #!35 models
    2619 
    2620 > hide #!34 models
    2621 
    2622 > hide #!33 models
    2623 
    2624 > hide #!32 models
    2625 
    2626 > hide #!31 models
    2627 
    2628 > hide #!30 models
    2629 
    2630 > hide #!29 models
    2631 
    2632 > hide #!28 models
    2633 
    2634 > show #!28 models
    2635 
    2636 > view name fig2_density
    2637 
    2638 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2639 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height
    2640 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2641 
    2642 > hide #!28 models
    2643 
    2644 > show #!29 models
    2645 
    2646 > rename #29 "nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2647 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height
    2648 > 1245 supersample 4 transparentBackground true"
    2649 
    2650 > rename #29 04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    2651 
    2652 > show #!29 models
    2653 
    2654 > hide #!28 models
    2655 
    2656 > show #!28 models
    2657 
    2658 > hide #!28 models
    2659 
    2660 > nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2661 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000
    2662 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2663 
    2664 Unknown command: nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2665 Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 height
    2666 1245 supersample 4 transparentBackground true 
    2667 
    2668 > save nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2669 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000
    2670 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2671 
    2672 Directory "nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2673 Fingerprint_Final/Fig2_Images" does not exist 
    2674 
    2675 > cd nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2676 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/
    2677 
    2678 Expected name of a folder to open/read; a name of 'browse' will bring up a
    2679 file browser or a keyword 
    2680 
    2681 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2682 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000
    2683 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2684 
    2685 > hide #!29 models
    2686 
    2687 > show #!30 models
    2688 
    2689 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2690 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_Density_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000
    2691 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2692 
    2693 > show #!31 models
    2694 
    2695 > hide #!30 models
    2696 
    2697 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2698 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_Density_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000
    2699 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2700 
    2701 > hide #!31 models
    2702 
    2703 > show #!32 models
    2704 
    2705 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2706 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_Density_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000
    2707 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2708 
    2709 > show #!33 models
    2710 
    2711 > hide #!32 models
    2712 
    2713 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2714 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_Density_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000
    2715 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2716 
    2717 > show #!34 models
    2718 
    2719 > hide #!33 models
    2720 
    2721 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2722 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/09_Density_EP67-hC3aR-Go.png width 2000 height
    2723 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2724 
    2725 > show #!35 models
    2726 
    2727 > hide #!34 models
    2728 
    2729 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2730 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_Density_EP67-mC3aR-Go.png width 2000 height
    2731 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2732 
    2733 > show #!36 models
    2734 
    2735 > hide #!35 models
    2736 
    2737 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2738 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_Density_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000
    2739 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2740 
    2741 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2742 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_Density_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height
    2743 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2744 
    2745 > show #!37 models
    2746 
    2747 > hide #!36 models
    2748 
    2749 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2750 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_Density_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height
    2751 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2752 
    2753 > show #!38 models
    2754 
    2755 > hide #!37 models
    2756 
    2757 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2758 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_Density_SB-hC3aR-Go_Overall.png width 2000
    2759 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2760 
    2761 > show #!39 models
    2762 
    2763 > hide #!38 models
    2764 
    2765 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2766 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_Density_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000
    2767 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2768 
    2769 > show #!40 models
    2770 
    2771 > hide #!39 models
    2772 
    2773 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2774 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/17_Density_mC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000
    2775 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2776 
    2777 > show #!41 models
    2778 
    2779 > hide #!40 models
    2780 
    2781 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2782 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/18_Density_hC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000
    2783 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2784 
    2785 > view fig2_density
    2786 
    2787 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2788 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    2789 
    2790 > hide #!41 models
    2791 
    2792 > show #!28 models
    2793 
    2794 > show #!29 models
    2795 
    2796 > hide #!28 models
    2797 
    2798 > show #!30 models
    2799 
    2800 > hide #!29 models
    2801 
    2802 > select ~sel & ##selected
    2803 
    2804 Nothing selected 
    2805 
    2806 > show #!31 models
    2807 
    2808 > hide #!30 models
    2809 
    2810 > show #!32 models
    2811 
    2812 > hide #!31 models
    2813 
    2814 > show #!33 models
    2815 
    2816 > hide #!32 models
    2817 
    2818 > show #!34 models
    2819 
    2820 > hide #!33 models
    2821 
    2822 > show #!35 models
    2823 
    2824 > hide #!34 models
    2825 
    2826 > show #!36 models
    2827 
    2828 > hide #!35 models
    2829 
    2830 > show #!37 models
    2831 
    2832 > hide #!36 models
    2833 
    2834 > show #!38 models
    2835 
    2836 > hide #!37 models
    2837 
    2838 > show #!39 models
    2839 
    2840 > hide #!38 models
    2841 
    2842 > color #15/F #f277b5
    2843 
    2844 > color zone #39 near #15 distance 5.52
    2845 
    2846 > view fig2_density
    2847 
    2848 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2849 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_Density_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000
    2850 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2851 
    2852 > show #!40 models
    2853 
    2854 > hide #!39 models
    2855 
    2856 > hide #!40 models
    2857 
    2858 > show #!40 models
    2859 
    2860 > show #!39 models
    2861 
    2862 > hide #!40 models
    2863 
    2864 > show #!41 models
    2865 
    2866 > show #!40 models
    2867 
    2868 > hide #!39 models
    2869 
    2870 > hide #!40 models
    2871 
    2872 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2873 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    2874 
    2875 > hide #!41 models
    2876 
    2877 > show #!28 models
    2878 
    2879 > hide #!28 models
    2880 
    2881 > show #!28 models
    2882 
    2883 > hide #!28 models
    2884 
    2885 > show #!28 models
    2886 
    2887 > show #!14 models
    2888 
    2889 > help help:user
    2890 
    2891 > select #6/D
    2892 
    2893 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected 
    2894 
    2895 > hide #!28 models
    2896 
    2897 > show #!2 models
    2898 
    2899 > show #!28 models
    2900 
    2901 > hide #!28 models
    2902 
    2903 > view fig2_density
    2904 
    2905 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2906 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height
    2907 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    2908 
    2909 > hide #!14 models
    2910 
    2911 > hide #!2 models
    2912 
    2913 > show #!4 models
    2914 
    2915 > show #!1 models
    2916 
    2917 > hide #!1 models
    2918 
    2919 > show #!1 models
    2920 
    2921 > hide #!1 models
    2922 
    2923 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2924 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    2925 > supersample 4 transparentBackground true
    2926 
    2927 > show #!5 models
    2928 
    2929 > hide #!4 models
    2930 
    2931 > select add #6
    2932 
    2933 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected 
    2934 
    2935 > select subtract #6
    2936 
    2937 Nothing selected 
    2938 
    2939 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2940 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    2941 > supersample 4 transparentBackground true
    2942 
    2943 > show #!6 models
    2944 
    2945 > hide #!5 models
    2946 
    2947 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2948 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    2949 > supersample 4 transparentBackground true
    2950 
    2951 > show #!7 models
    2952 
    2953 > hide #!6 models
    2954 
    2955 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2956 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    2957 > supersample 4 transparentBackground true
    2958 
    2959 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2960 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    2961 > supersample 4 transparentBackground true
    2962 
    2963 > hide #!7 models
    2964 
    2965 > show #!7 models
    2966 
    2967 > show #!8 models
    2968 
    2969 > hide #!7 models
    2970 
    2971 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    2972 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    2973 > supersample 4 transparentBackground true
    2974 
    2975 > show #!9 models
    2976 
    2977 > hide #!8 models
    2978 
    2979 > show #!8 models
    2980 
    2981 > hide #!8 models
    2982 
    2983 > hide #!9 models
    2984 
    2985 > show #!7 models
    2986 
    2987 > hide #!7 models
    2988 
    2989 > show #!8 models
    2990 
    2991 > hide #!8 models
    2992 
    2993 > show #!9 models
    2994 
    2995 > hide #!9 models
    2996 
    2997 > show #!10 models
    2998 
    2999 > select #10/D
    3000 
    3001 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    3002 
    3003 > show sel atoms
    3004 
    3005 > select clear
    3006 
    3007 > hide #!10 models
    3008 
    3009 > show #!10 models
    3010 
    3011 > hide #!10 models
    3012 
    3013 > show #!10 models
    3014 
    3015 > hide #!10 models
    3016 
    3017 > show #!9 models
    3018 
    3019 > view fig2_density
    3020 
    3021 > show #!10 models
    3022 
    3023 > hide #!9 models
    3024 
    3025 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3026 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_EP67-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3027 > supersample 4 transparentBackground true
    3028 
    3029 > show #!11 models
    3030 
    3031 > hide #!10 models
    3032 
    3033 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3034 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3035 > supersample 4 transparentBackground true
    3036 
    3037 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3038 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3039 > supersample 4 transparentBackground true
    3040 
    3041 > show #!12 models
    3042 
    3043 > hide #!11 models
    3044 
    3045 > show #!11 models
    3046 
    3047 > hide #!12 models
    3048 
    3049 > show #!12 models
    3050 
    3051 > hide #!11 models
    3052 
    3053 > hide #!12 models
    3054 
    3055 > show #!11 models
    3056 
    3057 > color #11/C:JR1 #7030a0
    3058 
    3059 > color #11 byhetero
    3060 
    3061 > show #!12 models
    3062 
    3063 > hide #!12 models
    3064 
    3065 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3066 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3067 > supersample 4 transparentBackground true
    3068 
    3069 > show #!12 models
    3070 
    3071 > hide #!11 models
    3072 
    3073 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3074 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3075 > supersample 4 transparentBackground true
    3076 
    3077 > show #!13 models
    3078 
    3079 > hide #!12 models
    3080 
    3081 > hide #!13 models
    3082 
    3083 > show #!27 models
    3084 
    3085 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3086 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_SB-hC3aR-Go_Overall.png width 2000 height
    3087 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3088 
    3089 > hide #!27 models
    3090 
    3091 > show #!15 models
    3092 
    3093 > show #!28 models
    3094 
    3095 > hide #!15 models
    3096 
    3097 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3098 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height
    3099 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3100 
    3101 > hide #!28 models
    3102 
    3103 > show #!1 models
    3104 
    3105 > hide #!1 models
    3106 
    3107 > show #!2 models
    3108 
    3109 > show #!4 models
    3110 
    3111 > show #!5 models
    3112 
    3113 > show #!6 models
    3114 
    3115 > show #!7 models
    3116 
    3117 > show #!8 models
    3118 
    3119 > show #!9 models
    3120 
    3121 > show #!10 models
    3122 
    3123 > show #!11 models
    3124 
    3125 > show #!12 models
    3126 
    3127 > show #!15 models
    3128 
    3129 > show #!16 models
    3130 
    3131 > show #!17 models
    3132 
    3133 > show #!18 models
    3134 
    3135 > hide #!17 models
    3136 
    3137 > hide #!16 models
    3138 
    3139 > show #!19 models
    3140 
    3141 > hide #!19 models
    3142 
    3143 > show #!20 models
    3144 
    3145 > hide #!20 models
    3146 
    3147 > show #!20 models
    3148 
    3149 > hide #!20 models
    3150 
    3151 > show #!20 models
    3152 
    3153 > show #!27 models
    3154 
    3155 > cartoon style width 1
    3156 
    3157 > cartoon style helix width 1
    3158 
    3159 Drag select of 15955 residues, 62 pseudobonds, 432 atoms, 393 bonds 
    3160 
    3161 > help help:user
    3162 
    3163 > cartoon style helix width 2
    3164 
    3165 > hide #!2 models
    3166 
    3167 > select add #2
    3168 
    3169 116251 atoms, 8548 bonds, 62 pseudobonds, 15958 residues, 26 models selected 
    3170 
    3171 > select add #4
    3172 
    3173 116251 atoms, 17507 bonds, 62 pseudobonds, 15958 residues, 26 models selected 
    3174 
    3175 > select subtract #2
    3176 
    3177 108276 atoms, 9352 bonds, 57 pseudobonds, 14848 residues, 24 models selected 
    3178 
    3179 > hide #!4 models
    3180 
    3181 > select add #5
    3182 
    3183 108276 atoms, 17742 bonds, 57 pseudobonds, 14848 residues, 24 models selected 
    3184 
    3185 > select subtract #4
    3186 
    3187 99502 atoms, 8783 bonds, 52 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected 
    3188 
    3189 > hide #!6 models
    3190 
    3191 > hide #!5 models
    3192 
    3193 > select add #6
    3194 
    3195 99502 atoms, 17134 bonds, 52 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected 
    3196 
    3197 > select add #7
    3198 
    3199 99502 atoms, 25514 bonds, 52 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected 
    3200 
    3201 > hide #!8 models
    3202 
    3203 > hide #!7 models
    3204 
    3205 > hide #!18 models
    3206 
    3207 > hide #!20 models
    3208 
    3209 > hide #!15 models
    3210 
    3211 > select add #15
    3212 
    3213 99502 atoms, 34313 bonds, 53 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected 
    3214 
    3215 > select add #20
    3216 
    3217 99502 atoms, 43083 bonds, 53 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected 
    3218 
    3219 > select add #18
    3220 
    3221 99502 atoms, 51919 bonds, 53 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected 
    3222 
    3223 > select subtract #15
    3224 
    3225 90879 atoms, 43120 bonds, 46 pseudobonds, 12451 residues, 20 models selected 
    3226 
    3227 > select subtract #18
    3228 
    3229 82193 atoms, 34248 bonds, 40 pseudobonds, 11259 residues, 18 models selected 
    3230 
    3231 > select subtract #20
    3232 
    3233 73570 atoms, 25447 bonds, 36 pseudobonds, 10064 residues, 16 models selected 
    3234 
    3235 > hide #!27 models
    3236 
    3237 > select add #27
    3238 
    3239 73570 atoms, 33767 bonds, 36 pseudobonds, 10064 residues, 16 models selected 
    3240 
    3241 > select subtract #27
    3242 
    3243 65400 atoms, 25416 bonds, 30 pseudobonds, 8959 residues, 14 models selected 
    3244 
    3245 > hide #!12 models
    3246 
    3247 > hide #!11 models
    3248 
    3249 > hide #!10 models
    3250 
    3251 > hide #!9 models
    3252 
    3253 > select add #12
    3254 
    3255 65400 atoms, 33653 bonds, 30 pseudobonds, 8959 residues, 14 models selected 
    3256 
    3257 > select add #11
    3258 
    3259 65400 atoms, 41906 bonds, 30 pseudobonds, 8959 residues, 14 models selected 
    3260 
    3261 > select add #10
    3262 
    3263 65400 atoms, 50214 bonds, 36 pseudobonds, 8959 residues, 15 models selected 
    3264 
    3265 > select subtract #11
    3266 
    3267 57266 atoms, 41898 bonds, 30 pseudobonds, 7858 residues, 13 models selected 
    3268 
    3269 > select subtract #12
    3270 
    3271 49174 atoms, 33624 bonds, 24 pseudobonds, 6746 residues, 11 models selected 
    3272 
    3273 > select subtract #10
    3274 
    3275 41001 atoms, 25265 bonds, 18 pseudobonds, 5624 residues, 9 models selected 
    3276 
    3277 > select add #9
    3278 
    3279 41001 atoms, 33632 bonds, 22 pseudobonds, 5624 residues, 10 models selected 
    3280 
    3281 > select subtract #9
    3282 
    3283 32766 atoms, 25214 bonds, 18 pseudobonds, 4501 residues, 8 models selected 
    3284 
    3285 > select add #8
    3286 
    3287 32766 atoms, 33502 bonds, 18 pseudobonds, 4501 residues, 8 models selected 
    3288 
    3289 > select subtract #8
    3290 
    3291 24613 atoms, 25172 bonds, 13 pseudobonds, 3382 residues, 6 models selected 
    3292 
    3293 > select subtract #7
    3294 
    3295 16365 atoms, 16741 bonds, 10 pseudobonds, 2254 residues, 4 models selected 
    3296 
    3297 > select subtract #6
    3298 
    3299 8201 atoms, 8390 bonds, 5 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected 
    3300 
    3301 > select subtract #5
    3302 
    3303 Nothing selected 
    3304 
    3305 > show #!2 models
    3306 
    3307 > show #!14 models
    3308 
    3309 > view list
    3310 
    3311 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3312 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3313 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3314 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, fig2_density,
    3315 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    3316 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    3317 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    3318 
    3319 > view fig2_density
    3320 
    3321 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3322 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3323 > supersample 4 transparentBackground true
    3324 
    3325 > hide #!2 models
    3326 
    3327 > show #!4 models
    3328 
    3329 > hide #!14 models
    3330 
    3331 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3332 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    3333 > supersample 4 transparentBackground true
    3334 
    3335 > show #!5 models
    3336 
    3337 > hide #!4 models
    3338 
    3339 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3340 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3341 > supersample 4 transparentBackground true
    3342 
    3343 > show #!6 models
    3344 
    3345 > hide #!5 models
    3346 
    3347 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3348 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3349 > supersample 4 transparentBackground true
    3350 
    3351 > show #!7 models
    3352 
    3353 > hide #!6 models
    3354 
    3355 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3356 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    3357 > supersample 4 transparentBackground true
    3358 
    3359 > show #!8 models
    3360 
    3361 > hide #!7 models
    3362 
    3363 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3364 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    3365 > supersample 4 transparentBackground true
    3366 
    3367 > hide #!8 models
    3368 
    3369 > show #!9 models
    3370 
    3371 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3372 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/09_EP67-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3373 > supersample 4 transparentBackground true
    3374 
    3375 > show #!10 models
    3376 
    3377 > hide #!9 models
    3378 
    3379 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3380 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_EP67-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3381 > supersample 4 transparentBackground true
    3382 
    3383 > show #!11 models
    3384 
    3385 > hide #!10 models
    3386 
    3387 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3388 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3389 > supersample 4 transparentBackground true
    3390 
    3391 > show #!12 models
    3392 
    3393 > hide #!11 models
    3394 
    3395 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3396 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245
    3397 > supersample 4 transparentBackground true
    3398 
    3399 > show #!27 models
    3400 
    3401 > hide #!12 models
    3402 
    3403 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3404 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_SB-hC3aR-Go_Overall.png width 2000 height
    3405 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3406 
    3407 > hide #!27 models
    3408 
    3409 > show #!15 models
    3410 
    3411 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3412 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1245
    3413 > supersample 4 transparentBackground true
    3414 
    3415 > hide #!15 models
    3416 
    3417 > show #!18 models
    3418 
    3419 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3420 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/17_mC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000 height
    3421 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3422 
    3423 > hide #!18 models
    3424 
    3425 > show #!20 models
    3426 
    3427 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3428 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/18_hC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000 height
    3429 > 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3430 
    3431 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3432 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    3433 
    3434 > show #!2 models
    3435 
    3436 > hide #!2 models
    3437 
    3438 > hide #!20 models
    3439 
    3440 > show #!14 models
    3441 
    3442 > show #!28 models
    3443 
    3444 > view list
    3445 
    3446 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3447 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3448 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3449 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, fig2_density,
    3450 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    3451 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    3452 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    3453 
    3454 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3455 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    3456 
    3457 > select #14/D
    3458 
    3459 97 atoms, 98 bonds, 12 residues, 1 model selected 
    3460 
    3461 > show sel atoms
    3462 
    3463 > color sel byhetero
    3464 
    3465 > volume zone #28 nearAtoms sel
    3466 
    3467 > cofr sel
    3468 
    3469 > volume #28 level 0.08012
    3470 
    3471 > surface dust #28 size 7.76
    3472 
    3473 > volume #28 level 0.1329
    3474 
    3475 > volume zone #28 nearAtoms sel
    3476 
    3477 > volume #28 style mesh
    3478 
    3479 > color zone #28 near sel distance 6.34
    3480 
    3481 > volume #28 level 0.008701
    3482 
    3483 > volume #28 level 0.01802
    3484 
    3485 > show #!29 models
    3486 
    3487 > hide #!29 models
    3488 
    3489 > volume #28 level 0.002491
    3490 
    3491 > color single #28
    3492 
    3493 > volume #29 color #b2b2b2
    3494 
    3495 > volume #30 color #b2b2b2
    3496 
    3497 > volume #31 color #b2b2b2
    3498 
    3499 > volume #32 color #b2b2b2
    3500 
    3501 > volume #33 color #b2b2b2
    3502 
    3503 > volume #34 color #b2b2b2
    3504 
    3505 > volume #35 color #888a85
    3506 
    3507 > volume #35 color #babdb6
    3508 
    3509 > volume #28 level 0.002491
    3510 
    3511 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3512 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_Lig_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000
    3513 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3514 
    3515 > view C3a-angle_03_EP67
    3516 
    3517 > view C3a_angle_01
    3518 
    3519 > view C3a_angle_02
    3520 
    3521 > view C3a_angle_01
    3522 
    3523 > view C3a_angle_02
    3524 
    3525 > view list
    3526 
    3527 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3528 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3529 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3530 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, fig2_density,
    3531 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    3532 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    3533 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    3534 
    3535 > view fig2_density
    3536 
    3537 > hide #!28 models
    3538 
    3539 > show #!28 models
    3540 
    3541 > volume #28 level 0.002491
    3542 
    3543 > volume #28 level 0.02052
    3544 
    3545 > volume #28 level 0.03915
    3546 
    3547 > volume #28 level 0.001889
    3548 
    3549 > surface dust #28 size 2.42
    3550 
    3551 > volume zone #28 nearAtoms sel
    3552 
    3553 > view name Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go
    3554 
    3555 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3556 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_Lig_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000
    3557 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3558 
    3559 [Repeated 1 time(s)]
    3560 
    3561 > view name Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go
    3562 
    3563 > show #!29 models
    3564 
    3565 > hide #!28 models
    3566 
    3567 > volume #29 style mesh
    3568 
    3569 > show #!4 models
    3570 
    3571 > hide #!14 models
    3572 
    3573 > select #4/F
    3574 
    3575 507 atoms, 514 bonds, 1 pseudobond, 73 residues, 2 models selected 
    3576 
    3577 > select ~sel & ##selected
    3578 
    3579 8267 atoms, 8445 bonds, 4 pseudobonds, 1125 residues, 2 models selected 
    3580 
    3581 > hide sel cartoons
    3582 
    3583 > select ~sel & ##selected
    3584 
    3585 507 atoms, 514 bonds, 1 pseudobond, 73 residues, 2 models selected 
    3586 
    3587 > volume zone #29 nearAtoms sel
    3588 
    3589 > cofr sel
    3590 
    3591 > volume #29 level 0.08317
    3592 
    3593 > view name Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    3594 
    3595 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3596 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_Lig_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000
    3597 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3598 
    3599 > hide #!29 models
    3600 
    3601 > show #!30 models
    3602 
    3603 > show #!5 models
    3604 
    3605 > hide #!4 models
    3606 
    3607 > select add #4
    3608 
    3609 8774 atoms, 8959 bonds, 5 pseudobonds, 1198 residues, 2 models selected 
    3610 
    3611 > select subtract #4
    3612 
    3613 Nothing selected 
    3614 
    3615 > volume #30 style mesh
    3616 
    3617 > select #5/D
    3618 
    3619 95 atoms, 99 bonds, 13 residues, 1 model selected 
    3620 
    3621 > select ~sel & ##selected
    3622 
    3623 8106 atoms, 8291 bonds, 5 pseudobonds, 1115 residues, 2 models selected 
    3624 
    3625 > volume zone #30 nearAtoms sel
    3626 
    3627 > hide sel cartoons
    3628 
    3629 > select ~sel & ##selected
    3630 
    3631 95 atoms, 99 bonds, 13 residues, 1 model selected 
    3632 
    3633 > volume zone #30 nearAtoms sel
    3634 
    3635 > cofr sel
    3636 
    3637 > show sel atoms
    3638 
    3639 > color sel byhetero
    3640 
    3641 > volume #30 level 0.02238
    3642 
    3643 [Repeated 1 time(s)]
    3644 
    3645 > view name Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go
    3646 
    3647 > hide #!30 models
    3648 
    3649 > show #!29 models
    3650 
    3651 > hide #!5 models
    3652 
    3653 > show #!4 models
    3654 
    3655 > select #4/F
    3656 
    3657 507 atoms, 514 bonds, 1 pseudobond, 73 residues, 2 models selected 
    3658 
    3659 > cofr sel
    3660 
    3661 > show sel atoms
    3662 
    3663 > color (#!4 & sel) byhetero
    3664 
    3665 > hide sel atoms
    3666 
    3667 > show sel atoms
    3668 
    3669 > color (#!4 & sel) byhetero
    3670 
    3671 > view name Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3672 
    3673 > view list
    3674 
    3675 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3676 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3677 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3678 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    3679 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    3680 Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density,
    3681 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    3682 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    3683 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    3684 
    3685 > view Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go
    3686 
    3687 > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    3688 
    3689 > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3690 
    3691 > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    3692 
    3693 > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3694 
    3695 > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    3696 
    3697 > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3698 
    3699 [Repeated 2 time(s)]
    3700 
    3701 > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    3702 
    3703 > help help:user
    3704 
    3705 > name delete Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3706 
    3707 deregistering unregistered selector "Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go" 
    3708 
    3709 > name list
    3710 
    3711 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8 #7/A:272-315 #9/C:408-450 
    3712 GBeta_2025 #2,5,9,10,11,12,27/B #4,7,8,15,16,18,20/C 
    3713 GGamma_2025 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/G 
    3714 GRK2_Helix #26/G:2-20 
    3715 Go_2025 #2,5,6,9,10,11,12,27/A #4,7,8,15,16,18,20/B 
    3716 JR-SB_PIF #1,11,13/C:348,110,386 
    3717 JR14-SB_CWxP #1,11,13/C:389,390,392 
    3718 JR14-SB_NPxxY #1,11,13/C:431,432,435 
    3719 NTSR1-GRK #26/G:2-20 #26/R 
    3720 ScFv_2014 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/H 
    3721 all_lig #1/D #14/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1
    3722 #12/C:JR1 #13/A:LIG 
    3723 all_lig_recep #1/D #2/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1
    3724 #12/C:JR1 #13/A:LIG #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C
    3725 #12/E #13/C 
    3726 all_recep #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C #12/E #13/C 
    3727 hC3a-JR14-SB_TM6 #1,11,13/C:371-404 
    3728 hC3a-JR14-SB_TM7 #1,11,13/C:406-439 
    3729 panchMukhi5ptSwitch #1/C:78,102,340,393,417 #11/C:78,102,340,393,417
    3730 #13/C:78,102,340,393,417 
    3731 
    3732 > view list
    3733 
    3734 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3735 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3736 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3737 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    3738 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    3739 Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density,
    3740 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    3741 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    3742 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    3743 
    3744 > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3745 
    3746 > view list
    3747 
    3748 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3749 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3750 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3751 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    3752 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    3753 Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density,
    3754 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    3755 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    3756 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    3757 
    3758 > help help:user
    3759 
    3760 > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3761 
    3762 > view delete Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go
    3763 
    3764 > view list
    3765 
    3766 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3767 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3768 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3769 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    3770 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    3771 Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y,
    3772 hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-
    3773 hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview,
    3774 view_01, view_02 
    3775 
    3776 > view Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go
    3777 
    3778 > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    3779 
    3780 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3781 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_Lig_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000
    3782 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3783 
    3784 > hide #!4 models
    3785 
    3786 > show #!5 models
    3787 
    3788 > hide #!29 models
    3789 
    3790 > show #!30 models
    3791 
    3792 > volume #30 level 0.02238
    3793 
    3794 > view name Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go
    3795 
    3796 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3797 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_Density_Lig_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000
    3798 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3799 
    3800 > hide #!30 models
    3801 
    3802 > show #!31 models
    3803 
    3804 > show #!6 models
    3805 
    3806 > hide #!5 models
    3807 
    3808 > select add #4
    3809 
    3810 8774 atoms, 8959 bonds, 5 pseudobonds, 1198 residues, 2 models selected 
    3811 
    3812 > select subtract #4
    3813 
    3814 Nothing selected 
    3815 
    3816 > select add #6
    3817 
    3818 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected 
    3819 
    3820 > hide #!6 models
    3821 
    3822 > show #!6 models
    3823 
    3824 > select subtract #6
    3825 
    3826 Nothing selected 
    3827 
    3828 > select add #6
    3829 
    3830 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected 
    3831 
    3832 > select subtract #6
    3833 
    3834 Nothing selected 
    3835 
    3836 > select add #6
    3837 
    3838 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected 
    3839 
    3840 > hide #!6 models
    3841 
    3842 > show #!6 models
    3843 
    3844 > select subtract #6
    3845 
    3846 Nothing selected 
    3847 
    3848 > volume #31 style mesh
    3849 
    3850 > select #6/D
    3851 
    3852 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected 
    3853 
    3854 > select #6/D
    3855 
    3856 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected 
    3857 
    3858 > volume zone #30 nearAtoms #6/D
    3859 
    3860 > volume zone #31 nearAtoms #6/D
    3861 
    3862 > hide sel atoms
    3863 
    3864 > show sel atoms
    3865 
    3866 > color sel byhetero
    3867 
    3868 > volume #31 level 0.03112
    3869 
    3870 > select ~sel & ##selected
    3871 
    3872 8064 atoms, 8246 bonds, 5 pseudobonds, 1113 residues, 2 models selected 
    3873 
    3874 > hide sel cartoons
    3875 
    3876 > select #6/D
    3877 
    3878 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected 
    3879 
    3880 > cofr sel
    3881 
    3882 > volume #31 level 0.008813
    3883 
    3884 > view name Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go
    3885 
    3886 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3887 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_Lig_Density_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000
    3888 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3889 
    3890 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3891 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    3892 
    3893 > show #!32 models
    3894 
    3895 > hide #!31 models
    3896 
    3897 > show #!7 models
    3898 
    3899 > hide #!6 models
    3900 
    3901 > select add #6
    3902 
    3903 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected 
    3904 
    3905 > select subtract #6
    3906 
    3907 Nothing selected 
    3908 
    3909 > select #7/D
    3910 
    3911 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    3912 
    3913 > volume zone #32 nearAtoms sel
    3914 
    3915 > show sel atoms
    3916 
    3917 > color sel byhetero
    3918 
    3919 > select ~sel & ##selected
    3920 
    3921 8161 atoms, 8342 bonds, 3 pseudobonds, 1118 residues, 2 models selected 
    3922 
    3923 > hide sel cartoons
    3924 
    3925 > volume #32 style mesh
    3926 
    3927 > select ~sel & ##selected
    3928 
    3929 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    3930 
    3931 > cofr sel
    3932 
    3933 > volume #32 level 0.01033
    3934 
    3935 > select up
    3936 
    3937 8248 atoms, 8431 bonds, 1128 residues, 1 model selected 
    3938 
    3939 > select up
    3940 
    3941 197971 atoms, 202307 bonds, 3 pseudobonds, 27084 residues, 55 models selected 
    3942 
    3943 > select down
    3944 
    3945 8248 atoms, 8431 bonds, 1128 residues, 1 model selected 
    3946 
    3947 > view name Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go
    3948 
    3949 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    3950 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_Density_Lig_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000
    3951 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    3952 
    3953 > hide #!32 models
    3954 
    3955 > show #!33 models
    3956 
    3957 > show #!8 models
    3958 
    3959 > hide #!7 models
    3960 
    3961 > select add #7
    3962 
    3963 8248 atoms, 8431 bonds, 3 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected 
    3964 
    3965 > select subtract #7
    3966 
    3967 Nothing selected 
    3968 
    3969 > select #8/D
    3970 
    3971 75 atoms, 76 bonds, 9 residues, 1 model selected 
    3972 
    3973 > color sel byhetero
    3974 
    3975 > volume zone #33 nearAtoms sel
    3976 
    3977 > select ~sel & ##selected
    3978 
    3979 8078 atoms, 8254 bonds, 5 pseudobonds, 1110 residues, 2 models selected 
    3980 
    3981 > hide sel cartoons
    3982 
    3983 > select ~sel & ##selected
    3984 
    3985 75 atoms, 76 bonds, 9 residues, 1 model selected 
    3986 
    3987 > volume #33 style mesh
    3988 
    3989 > view list
    3990 
    3991 Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    3992 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    3993 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    3994 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    3995 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    3996 Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go,
    3997 Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y,
    3998 hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-
    3999 hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview,
    4000 view_01, view_02 
    4001 
    4002 > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go
    4003 
    4004 > volume #33 level 0.01116
    4005 
    4006 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4007 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_Density_Lig_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000
    4008 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4009 
    4010 > hide #!33 models
    4011 
    4012 > show #!34 models
    4013 
    4014 > hide #!8 models
    4015 
    4016 > show #!9 models
    4017 
    4018 > select #9/D
    4019 
    4020 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    4021 
    4022 > color sel byhetero
    4023 
    4024 > volume zone #34 nearAtoms sel
    4025 
    4026 > volume #34 style mesh
    4027 
    4028 > cofr sel
    4029 
    4030 > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go
    4031 
    4032 > select ~sel & ##selected
    4033 
    4034 8148 atoms, 8329 bonds, 4 pseudobonds, 1113 residues, 2 models selected 
    4035 
    4036 > hide sel cartoons
    4037 
    4038 > volume #34 level 0.03756
    4039 
    4040 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4041 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/09_Lig_Density_EP67-hC3aR-Go.png width 2000
    4042 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4043 
    4044 > show #!35 models
    4045 
    4046 > hide #!34 models
    4047 
    4048 > hide #!9 models
    4049 
    4050 > show #!10 models
    4051 
    4052 > select #10/D
    4053 
    4054 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    4055 
    4056 > color sel byhetero
    4057 
    4058 > volume zone #35 nearAtoms sel
    4059 
    4060 > volume #35
    4061 
    4062 > volume #35 style mesh
    4063 
    4064 > select ~sel
    4065 
    4066 197884 atoms, 202218 bonds, 120 pseudobonds, 27074 residues, 84 models
    4067 selected 
    4068 
    4069 > select clear
    4070 
    4071 > select #10/D
    4072 
    4073 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    4074 
    4075 > select ~sel & ##selected
    4076 
    4077 8086 atoms, 8270 bonds, 6 pseudobonds, 1112 residues, 2 models selected 
    4078 
    4079 > hide sel cartoons
    4080 
    4081 > view Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go
    4082 
    4083 > volume #35 level 0.007509
    4084 
    4085 > show #!34 models
    4086 
    4087 > hide #!34 models
    4088 
    4089 > show #!34 models
    4090 
    4091 > hide #!34 models
    4092 
    4093 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4094 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_Lig_Density_EP67-mC3aR-Go.png width 2000
    4095 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4096 
    4097 > hide #!35 models
    4098 
    4099 > show #!36 models
    4100 
    4101 > hide #!10 models
    4102 
    4103 > show #!11 models
    4104 
    4105 > volume #36 color #babdb6
    4106 
    4107 > select #11/C:JR1
    4108 
    4109 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4110 
    4111 > color sel byhetero
    4112 
    4113 > volume zone #36 nearAtoms sel
    4114 
    4115 > select ~sel & ##selected
    4116 
    4117 8099 atoms, 8279 bonds, 6 pseudobonds, 1100 residues, 2 models selected 
    4118 
    4119 > hide sel cartoons
    4120 
    4121 > select ~sel & ##selected
    4122 
    4123 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4124 
    4125 > show sel cartoons
    4126 
    4127 > show sel atoms
    4128 
    4129 > hide #!36 models
    4130 
    4131 > show #!36 models
    4132 
    4133 > hide sel atoms
    4134 
    4135 [Repeated 1 time(s)]
    4136 
    4137 > show sel atoms
    4138 
    4139 > select #11/C:JR1
    4140 
    4141 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4142 
    4143 > select ~sel & ##selected
    4144 
    4145 8099 atoms, 8279 bonds, 6 pseudobonds, 1100 residues, 2 models selected 
    4146 
    4147 > hide sel atoms
    4148 
    4149 > volume #36 style mesh
    4150 
    4151 > select ~sel & ##selected
    4152 
    4153 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4154 
    4155 > cofr sel
    4156 
    4157 > select ~sel & ##selected
    4158 
    4159 8099 atoms, 8279 bonds, 6 pseudobonds, 1100 residues, 2 models selected 
    4160 
    4161 > show sel cartoons
    4162 
    4163 > hide sel cartoons
    4164 
    4165 > select ~sel & ##selected
    4166 
    4167 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4168 
    4169 > volume #36 level 0.0278
    4170 
    4171 > view name 11_Density_JR14A-hC3aR-Go
    4172 
    4173 [Repeated 1 time(s)]
    4174 
    4175 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4176 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_Lig_Density_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000
    4177 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4178 
    4179 > show #!37 models
    4180 
    4181 > hide #!36 models
    4182 
    4183 > show #!12 models
    4184 
    4185 > hide #!11 models
    4186 
    4187 > select add #11
    4188 
    4189 8134 atoms, 8316 bonds, 6 pseudobonds, 1101 residues, 2 models selected 
    4190 
    4191 > select subtract #11
    4192 
    4193 Nothing selected 
    4194 
    4195 > volume #37 color #babdb6
    4196 
    4197 > select #12/C:JR1
    4198 
    4199 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4200 
    4201 > volume zone #37 nearAtoms sel
    4202 
    4203 > volume #37 style mesh
    4204 
    4205 > select ~sel & ##selected
    4206 
    4207 8057 atoms, 8237 bonds, 6 pseudobonds, 1111 residues, 2 models selected 
    4208 
    4209 > hide sel cartoons
    4210 
    4211 > view list
    4212 
    4213 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01,
    4214 C3a_angle_02, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn,
    4215 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn,
    4216 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF,
    4217 JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go,
    4218 Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go,
    4219 Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density,
    4220 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    4221 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    4222 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    4223 
    4224 > view 11_Density_JR14A-hC3aR-Go
    4225 
    4226 [Repeated 1 time(s)]
    4227 
    4228 > show #!11 models
    4229 
    4230 > hide #!11 models
    4231 
    4232 > volume #37 level 0.04456
    4233 
    4234 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4235 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_Lig_Density_JR14-mC3aR-Go.png width 2000
    4236 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4237 
    4238 > show #!38 models
    4239 
    4240 > hide #!37 models
    4241 
    4242 > show #!27 models
    4243 
    4244 > hide #!12 models
    4245 
    4246 > volume #38 color #babdb6
    4247 
    4248 > select add #12
    4249 
    4250 8092 atoms, 8274 bonds, 6 pseudobonds, 1112 residues, 2 models selected 
    4251 
    4252 > select subtract #12
    4253 
    4254 Nothing selected 
    4255 
    4256 > select #27/Z:LIG
    4257 
    4258 30 atoms, 31 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4259 
    4260 > volume zone #38 nearAtoms sel
    4261 
    4262 > volume #38 style mesh
    4263 
    4264 > select ~sel & ##selected
    4265 
    4266 8140 atoms, 8320 bonds, 6 pseudobonds, 1104 residues, 2 models selected 
    4267 
    4268 > hide sel cartoons
    4269 
    4270 > view list
    4271 
    4272 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01,
    4273 C3a_angle_02, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn,
    4274 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn,
    4275 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF,
    4276 JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go,
    4277 Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go,
    4278 Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density,
    4279 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    4280 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    4281 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    4282 
    4283 > view 11_Density_JR14A-hC3aR-Go
    4284 
    4285 > volume #38 level 0.01968
    4286 
    4287 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4288 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_Lig_Density_SB-hC3aR-Go_Overall.png width
    4289 > 2000 height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4290 
    4291 > hide #!38 models
    4292 
    4293 > show #!39 models
    4294 
    4295 > hide #!27 models
    4296 
    4297 > show #!15 models
    4298 
    4299 > select #15/F
    4300 
    4301 492 atoms, 497 bonds, 2 pseudobonds, 71 residues, 2 models selected 
    4302 
    4303 > show sel atoms
    4304 
    4305 > color (#!15 & sel) byhetero
    4306 
    4307 > volume zone #39 nearAtoms sel
    4308 
    4309 > volume #39 color #babdb6
    4310 
    4311 > volume #39 style mesh
    4312 
    4313 > cofr sel
    4314 
    4315 > select ~sel & ##selected
    4316 
    4317 8131 atoms, 8302 bonds, 5 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected 
    4318 
    4319 > hide sel cartoons
    4320 
    4321 > volume #39 level 0.07583
    4322 
    4323 > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go
    4324 
    4325 > view name 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go
    4326 
    4327 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4328 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    4329 
    4330 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4331 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000
    4332 > height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4333 
    4334 > show #!40 models
    4335 
    4336 > hide #!39 models
    4337 
    4338 > show #!18 models
    4339 
    4340 > hide #!15 models
    4341 
    4342 > volume #40 color #babdb6
    4343 
    4344 > volume #40 style mesh
    4345 
    4346 > select #18/F
    4347 
    4348 419 atoms, 424 bonds, 2 pseudobonds, 67 residues, 2 models selected 
    4349 
    4350 > select ~sel & ##selected
    4351 
    4352 8267 atoms, 8448 bonds, 4 pseudobonds, 1125 residues, 2 models selected 
    4353 
    4354 > hide sel cartoons
    4355 
    4356 > select ~sel & ##selected
    4357 
    4358 419 atoms, 424 bonds, 2 pseudobonds, 67 residues, 2 models selected 
    4359 
    4360 > show sel atoms
    4361 
    4362 > style sel stick
    4363 
    4364 Changed 419 atom styles 
    4365 
    4366 > color (#!18 & sel) byhetero
    4367 
    4368 > volume zone #40 nearAtoms sel
    4369 
    4370 > volume #40 level 0.01494
    4371 
    4372 > view list
    4373 
    4374 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    4375 C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    4376 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    4377 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    4378 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    4379 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    4380 Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go,
    4381 Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y,
    4382 hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-
    4383 hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview,
    4384 view_01, view_02 
    4385 
    4386 > view 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go
    4387 
    4388 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4389 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/17_Lig_Density_mC5adesArg-mC5aR1-Go.png width
    4390 > 2000 height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4391 
    4392 > hide #!40 models
    4393 
    4394 > show #!39 models
    4395 
    4396 > hide #!18 models
    4397 
    4398 > show #!17 models
    4399 
    4400 > hide #!17 models
    4401 
    4402 > show #!18 models
    4403 
    4404 > hide #!18 models
    4405 
    4406 > show #!16 models
    4407 
    4408 > hide #!16 models
    4409 
    4410 > show #!15 models
    4411 
    4412 > select add #18
    4413 
    4414 8686 atoms, 8872 bonds, 6 pseudobonds, 1192 residues, 2 models selected 
    4415 
    4416 > select #15/F
    4417 
    4418 492 atoms, 497 bonds, 2 pseudobonds, 71 residues, 2 models selected 
    4419 
    4420 > hide #!15 models
    4421 
    4422 > select add #15
    4423 
    4424 8623 atoms, 8799 bonds, 7 pseudobonds, 1199 residues, 2 models selected 
    4425 
    4426 > select subtract #15
    4427 
    4428 Nothing selected 
    4429 
    4430 > hide #!39 models
    4431 
    4432 > show #!40 models
    4433 
    4434 > show #!18 models
    4435 
    4436 > show #!41 models
    4437 
    4438 > hide #!40 models
    4439 
    4440 > volume #41 color #babdb6
    4441 
    4442 > select #20/D
    4443 
    4444 444 atoms, 448 bonds, 73 residues, 1 model selected 
    4445 
    4446 > show #!20 models
    4447 
    4448 > hide #!18 models
    4449 
    4450 > volume zone #41 nearAtoms sel
    4451 
    4452 > volume #41 style mesh
    4453 
    4454 > select ~sel & ##selected
    4455 
    4456 8179 atoms, 8353 bonds, 4 pseudobonds, 1122 residues, 2 models selected 
    4457 
    4458 > hide sel cartoons
    4459 
    4460 > select ~sel & ##selected
    4461 
    4462 444 atoms, 448 bonds, 73 residues, 1 model selected 
    4463 
    4464 > show sel atoms
    4465 
    4466 > style sel stick
    4467 
    4468 Changed 444 atom styles 
    4469 
    4470 > color sel byhetero
    4471 
    4472 > volume #41 level 0.05885
    4473 
    4474 > view 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go
    4475 
    4476 > volume #41 level 0.0294
    4477 
    4478 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4479 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/18_Lig_Density_hC5adesArg-mC5aR1-Go.png width
    4480 > 2000 height 1245 supersample 4 transparentBackground true
    4481 
    4482 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4483 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs
    4484 
    4485 ——— End of log from Tue Feb 4 13:08:16 2025 ———
    4486 
    4487 opened ChimeraX session 
    4488 
    4489 > hide #!20 models
    4490 
    4491 > hide #!41 models
    4492 
    4493 > show #!20 models
    4494 
    4495 > hide #!20 models
    4496 
    4497 > show #!2 models
    4498 
    4499 > show #!14 models
    4500 
    4501 Drag select of 504 residues, 2 pseudobonds 
    4502 
    4503 > select up
    4504 
    4505 4259 atoms, 4328 bonds, 2 pseudobonds, 601 residues, 2 models selected 
    4506 
    4507 > select up
    4508 
    4509 5913 atoms, 6036 bonds, 2 pseudobonds, 831 residues, 2 models selected 
    4510 
    4511 > hide sel cartoons
    4512 
    4513 Drag select of 291 residues, 1 pseudobonds, 59 atoms, 50 bonds 
    4514 
    4515 > select clear
    4516 
    4517 > show #!6 models
    4518 
    4519 > hide #!2,6,14 cartoons
    4520 
    4521 [Repeated 1 time(s)]
    4522 
    4523 > show #!2,6,14 cartoons
    4524 
    4525 Drag select of 567 residues, 4 pseudobonds 
    4526 
    4527 > select up
    4528 
    4529 4988 atoms, 5049 bonds, 4 pseudobonds, 706 residues, 4 models selected 
    4530 
    4531 > select up
    4532 
    4533 10252 atoms, 10458 bonds, 4 pseudobonds, 1436 residues, 4 models selected 
    4534 
    4535 > select up
    4536 
    4537 10456 atoms, 10662 bonds, 4 pseudobonds, 1467 residues, 4 models selected 
    4538 
    4539 > hide sel cartoons
    4540 
    4541 Drag select of 88 residues 
    4542 
    4543 > select up
    4544 
    4545 825 atoms, 831 bonds, 124 residues, 2 models selected 
    4546 
    4547 > select up
    4548 
    4549 1579 atoms, 1619 bonds, 227 residues, 2 models selected 
    4550 
    4551 > select up
    4552 
    4553 1605 atoms, 1643 bonds, 231 residues, 2 models selected 
    4554 
    4555 > hide sel cartoons
    4556 
    4557 Drag select of 585 residues, 2 pseudobonds, 121 atoms, 105 bonds 
    4558 
    4559 > cofr sel
    4560 
    4561 > select clear
    4562 
    4563 > select sequence FICWTPYHLVG
    4564 
    4565 470 atoms, 495 bonds, 55 residues, 5 models selected 
    4566 
    4567 > select sequence FICWTPYHLVG
    4568 
    4569 470 atoms, 495 bonds, 55 residues, 5 models selected 
    4570 
    4571 > ui tool show "Show Sequence Viewer"
    4572 
    4573 > sequence chain #2/E
    4574 
    4575 Alignment identifier is 2/E 
    4576 
    4577 > select #2/E:380-381
    4578 
    4579 19 atoms, 19 bonds, 2 residues, 1 model selected 
    4580 
    4581 > select #2/E:380-390
    4582 
    4583 94 atoms, 99 bonds, 11 residues, 1 model selected 
    4584 
    4585 > save "/nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4586 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect (copy).cxs" includeMaps
    4587 > true
    4588 
    4589 > graphics selection width 2 color lime green
    4590 
    4591 > hide #!6 models
    4592 
    4593 > select
    4594 > #2/E:21-51,58-84,92-125,127-133,136-160,324-356,367-395,401-427,433-442
    4595 
    4596 1639 atoms, 1677 bonds, 223 residues, 1 model selected 
    4597 
    4598 > select #2/E:380
    4599 
    4600 11 atoms, 11 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4601 
    4602 > select #2/E:380-390
    4603 
    4604 94 atoms, 99 bonds, 11 residues, 1 model selected 
    4605 
    4606 > select sequence AVMSWDHMSIA
    4607 
    4608 409 atoms, 419 bonds, 55 residues, 5 models selected 
    4609 
    4610 > select #2/E:405
    4611 
    4612 5 atoms, 4 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4613 
    4614 > select #2/E:405-415
    4615 
    4616 81 atoms, 83 bonds, 11 residues, 1 model selected 
    4617 
    4618 > select sequence ASANSCFNPFL
    4619 
    4620 971 atoms, 995 bonds, 132 residues, 12 models selected 
    4621 
    4622 > select #2/E:417
    4623 
    4624 5 atoms, 4 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4625 
    4626 > select #2/E:417-427
    4627 
    4628 81 atoms, 83 bonds, 11 residues, 1 model selected 
    4629 
    4630 > select clear
    4631 
    4632 > select #2/E:414,D:77,78
    4633 
    4634 25 atoms, 24 bonds, 3 residues, 1 model selected 
    4635 
    4636 > select #2/E:414,/D:77,78
    4637 
    4638 Expected an objects specifier or a keyword 
    4639 
    4640 > select #2/E:414 #2/D:77,78
    4641 
    4642 8 atoms, 7 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    4643 
    4644 > select clear
    4645 
    4646 > select #2/D:77
    4647 
    4648 Nothing selected 
    4649 
    4650 > select #2/E:414 #14/D:77,78
    4651 
    4652 25 atoms, 23 bonds, 3 residues, 2 models selected 
    4653 
    4654 > save "/nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4655 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect (copy).cxs" includeMaps
    4656 > true
    4657 
    4658 ——— End of log from Tue Feb 11 12:29:50 2025 ———
    4659 
    4660 opened ChimeraX session 
    4661 
    4662 > view list
    4663 
    4664 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    4665 C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    4666 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    4667 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    4668 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    4669 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    4670 Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go,
    4671 Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y,
    4672 hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-
    4673 hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview,
    4674 view_01, view_02 
    4675 
    4676 > view H8_overall
    4677 
    4678 > view H8_zoomed
    4679 
    4680 > show #!4 models
    4681 
    4682 > hide #!2 models
    4683 
    4684 > show sel & #!14 cartoons
    4685 
    4686 > hide #!4 models
    4687 
    4688 > show #!4 models
    4689 
    4690 > hide #!4 models
    4691 
    4692 > show #!4 models
    4693 
    4694 > show sel & #!14 cartoons
    4695 
    4696 > hide #!14 models
    4697 
    4698 > show #!4 atoms
    4699 
    4700 > show #!4 cartoons
    4701 
    4702 > hide #!4 atoms
    4703 
    4704 Drag select of 320 residues, 2 pseudobonds 
    4705 
    4706 > select up
    4707 
    4708 2787 atoms, 2827 bonds, 2 pseudobonds, 384 residues, 2 models selected 
    4709 
    4710 > select up
    4711 
    4712 4409 atoms, 4489 bonds, 2 pseudobonds, 603 residues, 2 models selected 
    4713 
    4714 > hide sel cartoons
    4715 
    4716 Drag select of 186 residues 
    4717 
    4718 > select up
    4719 
    4720 1535 atoms, 1568 bonds, 213 residues, 1 model selected 
    4721 
    4722 > select up
    4723 
    4724 1656 atoms, 1695 bonds, 230 residues, 1 model selected 
    4725 
    4726 > select up
    4727 
    4728 8774 atoms, 8959 bonds, 1198 residues, 1 model selected 
    4729 
    4730 > select down
    4731 
    4732 1656 atoms, 1695 bonds, 230 residues, 1 model selected 
    4733 
    4734 > hide sel cartoons
    4735 
    4736 > show #!18 models
    4737 
    4738 > show sel cartoons
    4739 
    4740 [Repeated 1 time(s)]
    4741 
    4742 > hide sel cartoons
    4743 
    4744 > select clear
    4745 
    4746 > select add #18
    4747 
    4748 8686 atoms, 8872 bonds, 6 pseudobonds, 1192 residues, 2 models selected 
    4749 
    4750 > hide sel atoms
    4751 
    4752 Drag select of 8 residues 
    4753 
    4754 > select clear
    4755 
    4756 > show #!25 models
    4757 
    4758 > select #18/A
    4759 
    4760 2199 atoms, 2259 bonds, 292 residues, 1 model selected 
    4761 
    4762 > show sel cartoons
    4763 
    4764 > select clear
    4765 
    4766 > cartoon style modeHelix tube
    4767 
    4768 > view list
    4769 
    4770 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    4771 C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    4772 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    4773 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    4774 H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY,
    4775 Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go,
    4776 Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go,
    4777 Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y,
    4778 hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-
    4779 hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview,
    4780 view_01, view_02 
    4781 
    4782 > view H8_zoomed
    4783 
    4784 [Repeated 2 time(s)]
    4785 
    4786 > color #4/A #4cfff8
    4787 
    4788 > color #18/A #007399
    4789 
    4790 > view H8_overall
    4791 
    4792 [Repeated 2 time(s)]
    4793 
    4794 > view name H8_overall_mC5aR1
    4795 
    4796 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4797 > Fingerprint_Final/Fig5_Images/03A_mC5a-mC5aR1+mC5adesArg-
    4798 > mC5aR1_overall_binding_pose.png width 2000 height 1129 supersample 4
    4799 > transparentBackground true
    4800 
    4801 > view H8_zoomed
    4802 
    4803 > ui tool show "Side View"
    4804 
    4805 > view H8_zoomed
    4806 
    4807 > view name H8_zoomed_mC5aR1
    4808 
    4809 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4810 > Fingerprint_Final/Fig5_Images/03A_mC5a-mC5aR1+mC5adesArg-mC5aR1_zoomed.png
    4811 > width 2000 height 1129 supersample 4 transparentBackground true
    4812 
    4813 > save "/nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4814 > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect (copy).cxs" includeMaps
    4815 > true
    4816 
    4817 ——— End of log from Sat Mar 15 15:38:25 2025 ———
    4818 
    4819 opened ChimeraX session 
    4820 
    4821 > name list
    4822 
    4823 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8 #7/A:272-315 #9/C:408-450 
    4824 GBeta_2025 #2,5,9,10,11,12,27/B #4,7,8,15,16,18,20/C 
    4825 GGamma_2025 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/G 
    4826 GRK2_Helix #26/G:2-20 
    4827 Go_2025 #2,5,6,9,10,11,12,27/A #4,7,8,15,16,18,20/B 
    4828 JR-SB_PIF #1,11,13/C:348,110,386 
    4829 JR14-SB_CWxP #1,11,13/C:389,390,392 
    4830 JR14-SB_NPxxY #1,11,13/C:431,432,435 
    4831 NTSR1-GRK #26/G:2-20 #26/R 
    4832 ScFv_2014 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/H 
    4833 all_lig #1/D #14/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1
    4834 #12/C:JR1 #13/A:LIG 
    4835 all_lig_recep #1/D #2/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1
    4836 #12/C:JR1 #13/A:LIG #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C
    4837 #12/E #13/C 
    4838 all_recep #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C #12/E #13/C 
    4839 hC3a-JR14-SB_TM6 #1,11,13/C:371-404 
    4840 hC3a-JR14-SB_TM7 #1,11,13/C:406-439 
    4841 panchMukhi5ptSwitch #1/C:78,102,340,393,417 #11/C:78,102,340,393,417
    4842 #13/C:78,102,340,393,417 
    4843 
    4844 > name delete JR-SB_PI(V)F
    4845 
    4846 deregistering unregistered selector "JR-SB_PI(V)F" 
    4847 
    4848 > ls
    4849 
    4850 Unknown command: ls 
    4851 
    4852 > pwd
    4853 
    4854 Current working directory is: /home/dell 
    4855 
    4856 > hide #!4 models
    4857 
    4858 > hide #!18 models
    4859 
    4860 > hide #!25 models
    4861 
    4862 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4863 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb
    4864 
    4865 Summary of feedback from opening /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-
    4866 Maps-Complement-Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go-
    4867 DEPOSIT.pdb 
    4868 --- 
    4869 warning | Ignored bad PDB record found on line 23 
    4870 REMARK [No title given] 
    4871  
    4872 Chain information for C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb #42 
    4873 --- 
    4874 Chain | Description 
    4875 B | No description available 
    4876 C | No description available 
    4877 D | No description available 
    4878 G | No description available 
    4879 H | No description available 
    4880 L | No description available 
    4881  
    4882 
    4883 > show #!1 models
    4884 
    4885 > hide #!1 models
    4886 
    4887 > show #!1 models
    4888 
    4889 > hide #!1,42 atoms
    4890 
    4891 > show #!1,42 cartoons
    4892 
    4893 > rename #42 24_C5aPep-hC5aR1-Go
    4894 
    4895 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4896 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-
    4897 > hC5aR1-Go/cryosparc_P26_J70_009_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened-
    4898 > inverse.mrc
    4899 
    4900 Opened cryosparc_P26_J70_009_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened-
    4901 inverse.mrc as #43, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00321,
    4902 step 1, values float32 
    4903 
    4904 > rename #43 24_Density_C5aPep-hC5aR1-Go
    4905 
    4906 > hide #!43 models
    4907 
    4908 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4909 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb
    4910 
    4911 Summary of feedback from opening /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-
    4912 Maps-Complement-Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go-
    4913 DEPOSIT.pdb 
    4914 --- 
    4915 warning | Ignored bad PDB record found on line 23 
    4916 REMARK [No title given] 
    4917  
    4918 Chain information for C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb #44 
    4919 --- 
    4920 Chain | Description 
    4921 B | No description available 
    4922 C | No description available 
    4923 D | No description available 
    4924 G | No description available 
    4925 H | No description available 
    4926 L | No description available 
    4927  
    4928 
    4929 > hide #!1,42,44 atoms
    4930 
    4931 > show #!1,42,44 cartoons
    4932 
    4933 > rename #44 25_EP54-hC5aR1-Go
    4934 
    4935 > hide #!42 models
    4936 
    4937 > show #!42 models
    4938 
    4939 > hide #!44 models
    4940 
    4941 > show #!44 models
    4942 
    4943 > select add #44
    4944 
    4945 8235 atoms, 8411 bonds, 4 pseudobonds, 1124 residues, 2 models selected 
    4946 
    4947 > select subtract #44
    4948 
    4949 Nothing selected 
    4950 
    4951 > select add #42
    4952 
    4953 8235 atoms, 8411 bonds, 4 pseudobonds, 1124 residues, 2 models selected 
    4954 
    4955 > select subtract #42
    4956 
    4957 Nothing selected 
    4958 
    4959 > close #44
    4960 
    4961 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4962 > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/EP54-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb
    4963 
    4964 Summary of feedback from opening /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-
    4965 Maps-Complement-Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/EP54-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb 
    4966 --- 
    4967 warning | Ignored bad PDB record found on line 23 
    4968 REMARK [No title given] 
    4969  
    4970 Chain information for EP54-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb #44 
    4971 --- 
    4972 Chain | Description 
    4973 A | No description available 
    4974 B | No description available 
    4975 C | No description available 
    4976 D | No description available 
    4977 G | No description available 
    4978 H | No description available 
    4979  
    4980 
    4981 > select add #44
    4982 
    4983 8224 atoms, 8397 bonds, 4 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected 
    4984 
    4985 > hide sel atoms
    4986 
    4987 > show sel cartoons
    4988 
    4989 > select clear
    4990 
    4991 > rename #44 25_EP54-hC5aR1-Go
    4992 
    4993 > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    4994 > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/cryosparc_P70_J115_010_volume_map_half_A_deepEMhancer-
    4995 > sharpened.mrc
    4996 
    4997 Opened cryosparc_P70_J115_010_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as
    4998 #45, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00297, step 1, values
    4999 float32 
    5000 
    5001 > hide #!45 models
    5002 
    5003 > show #!45 models
    5004 
    5005 > hide #!45 models
    5006 
    5007 > show #!45 models
    5008 
    5009 > rename #45 25_Density_EP54-hC5aR1-Go
    5010 
    5011 > hide #!45 models
    5012 
    5013 > show #!45 models
    5014 
    5015 > hide #!45 models
    5016 
    5017 > hide #!42 models
    5018 
    5019 > hide #!44 models
    5020 
    5021 > show #!42 models
    5022 
    5023 > show #!44 models
    5024 
    5025 > hide #!42 models
    5026 
    5027 > ui tool show Matchmaker
    5028 
    5029 > matchmaker #42/D to #1/C pairing ss
    5030 
    5031 Computing secondary structure 
    5032 Parameters 
    5033 --- 
    5034 Chain pairing | ss 
    5035 Alignment algorithm | Needleman-Wunsch 
    5036 Similarity matrix | BLOSUM-62 
    5037 SS fraction | 0.3 
    5038 Gap open (HH/SS/other) | 18/18/6 
    5039 Gap extend | 1 
    5040 SS matrix |  |  | H | S | O 
    5041 ---|---|---|--- 
    5042 H | 6 | -9 | -6 
    5043 S |  | 6 | -6 
    5044 O |  |  | 4 
    5045 Iteration cutoff | 2 
    5046  
    5047 Matchmaker 01_hC3a-hC3aR-Go_2023, chain C (#1) with 24_C5aPep-hC5aR1-Go, chain
    5048 D (#42), sequence alignment score = 674.9 
    5049 RMSD between 217 pruned atom pairs is 1.072 angstroms; (across all 261 pairs:
    5050 1.902) 
    5051  
    5052 
    5053 > matchmaker #44/A to #1/C pairing ss
    5054 
    5055 Computing secondary structure 
    5056 Parameters 
    5057 --- 
    5058 Chain pairing | ss 
    5059 Alignment algorithm | Needleman-Wunsch 
    5060 Similarity matrix | BLOSUM-62 
    5061 SS fraction | 0.3 
    5062 Gap open (HH/SS/other) | 18/18/6 
    5063 Gap extend | 1 
    5064 SS matrix |  |  | H | S | O 
    5065 ---|---|---|--- 
    5066 H | 6 | -9 | -6 
    5067 S |  | 6 | -6 
    5068 O |  |  | 4 
    5069 Iteration cutoff | 2 
    5070  
    5071 Matchmaker 01_hC3a-hC3aR-Go_2023, chain C (#1) with 25_EP54-hC5aR1-Go, chain A
    5072 (#44), sequence alignment score = 631.7 
    5073 RMSD between 208 pruned atom pairs is 1.028 angstroms; (across all 258 pairs:
    5074 2.013) 
    5075  
    5076 
    5077 > show #!42 models
    5078 
    5079 > show #!43 models
    5080 
    5081 > hide #!42 models
    5082 
    5083 > hide #!44 models
    5084 
    5085 > view #43 same as #42
    5086 
    5087 Expected an integer >= 1 or a keyword 
    5088 
    5089 > view #43 sameas #42
    5090 
    5091 Expected an integer >= 1 or a keyword 
    5092 
    5093 > view position #43 sameAsModels #42
    5094 
    5095 > hide #!43 models
    5096 
    5097 > view position #45 sameAsModels #44
    5098 
    5099 > show #!45 models
    5100 
    5101 > show #!44 models
    5102 
    5103 > hide #!1 models
    5104 
    5105 > volume #45 level 0.1269
    5106 
    5107 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5108 > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs
    5109 > includeMaps true
    5110 
    5111 > view list
    5112 
    5113 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    5114 C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    5115 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    5116 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    5117 H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF,
    5118 JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go,
    5119 Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go,
    5120 Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density,
    5121 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    5122 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    5123 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    5124 
    5125 > view fig2_density
    5126 
    5127 > volume #45 level 0.05608
    5128 
    5129 > view fig2_density
    5130 
    5131 > ui tool show "Map Eraser"
    5132 
    5133 > ui tool show "Hide Dust"
    5134 
    5135 > hide #!44 models
    5136 
    5137 > show #!44 models
    5138 
    5139 > hide #!44 models
    5140 
    5141 > hide #!45 models
    5142 
    5143 > show #!43 models
    5144 
    5145 > show #!42 models
    5146 
    5147 > surface dust #43 size 7.26
    5148 
    5149 > volume #43 level 0.1165
    5150 
    5151 > surface dust #43 size 7.26
    5152 
    5153 > surface dust #43 size 13.41
    5154 
    5155 > volume #43 level 0.1199
    5156 
    5157 > view fig2_density
    5158 
    5159 > hide #!43 models
    5160 
    5161 > hide #!42 models
    5162 
    5163 > show #!45 models
    5164 
    5165 > show #!44 models
    5166 
    5167 > volume #45 level 0.1871
    5168 
    5169 > surface dust #45 size 7.26
    5170 
    5171 > volume #45 level 0.1163
    5172 
    5173 > surface dust #45 size 5.14
    5174 
    5175 > volume #45 level 0.1481
    5176 
    5177 > volume #45 level 0.08087
    5178 
    5179 > surface dust #45 size 10.74
    5180 
    5181 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5182 > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs
    5183 > includeMaps true
    5184 
    5185 ——— End of log from Thu Apr 10 17:11:05 2025 ———
    5186 
    5187 opened ChimeraX session 
    5188 
    5189 > hide #!44 models
    5190 
    5191 > hide #!45 models
    5192 
    5193 > show #!43 models
    5194 
    5195 > show #!42 models
    5196 
    5197 > hide #!43 models
    5198 
    5199 > show #!43 models
    5200 
    5201 > hide #!43 models
    5202 
    5203 > show #!43 models
    5204 
    5205 > hide #!43 models
    5206 
    5207 > color #42/D #b366ff
    5208 
    5209 > color #42,44/D #b366ff
    5210 
    5211 > show #!44 models
    5212 
    5213 > color #44/A #b366ff
    5214 
    5215 > color #44,42/B #40bf40
    5216 
    5217 Drag select of 153 residues 
    5218 
    5219 > select up
    5220 
    5221 1610 atoms, 1634 bonds, 238 residues, 2 models selected 
    5222 
    5223 > select up
    5224 
    5225 3226 atoms, 3296 bonds, 464 residues, 2 models selected 
    5226 
    5227 > select up
    5228 
    5229 16459 atoms, 16808 bonds, 2252 residues, 2 models selected 
    5230 
    5231 > select down
    5232 
    5233 3226 atoms, 3296 bonds, 464 residues, 2 models selected 
    5234 
    5235 > color sel #c2c2d6
    5236 
    5237 > select clear
    5238 
    5239 Drag select of 10 residues 
    5240 
    5241 > select up
    5242 
    5243 296 atoms, 294 bonds, 46 residues, 2 models selected 
    5244 
    5245 > select up
    5246 
    5247 4870 atoms, 4958 bonds, 676 residues, 2 models selected 
    5248 
    5249 > select up
    5250 
    5251 16459 atoms, 16808 bonds, 2252 residues, 2 models selected 
    5252 
    5253 > select down
    5254 
    5255 4870 atoms, 4958 bonds, 676 residues, 2 models selected 
    5256 
    5257 > color sel #ffff00
    5258 
    5259 > select clear
    5260 
    5261 Drag select of 12 residues 
    5262 
    5263 > select up
    5264 
    5265 302 atoms, 300 bonds, 43 residues, 2 models selected 
    5266 
    5267 > select up
    5268 
    5269 764 atoms, 774 bonds, 112 residues, 2 models selected 
    5270 
    5271 > color sel #1a1aff
    5272 
    5273 > select clear
    5274 
    5275 > color #42/L #000099
    5276 
    5277 > color #44/D #ffcc33
    5278 
    5279 > select clear
    5280 
    5281 > hide #!44 models
    5282 
    5283 > show #!43 models
    5284 
    5285 > ui tool show "Color Zone"
    5286 
    5287 > color zone #43 near #42 distance 7.26
    5288 
    5289 > show #!44 models
    5290 
    5291 > show #!45 models
    5292 
    5293 > hide #!43 models
    5294 
    5295 > hide #!42 models
    5296 
    5297 > color zone #45 near #44 distance 7.26
    5298 
    5299 > color zone #45 near #44 distance 16.21
    5300 
    5301 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5302 > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs
    5303 > includeMaps true
    5304 
    5305 > view list
    5306 
    5307 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    5308 C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    5309 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    5310 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    5311 H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF,
    5312 JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go,
    5313 Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go,
    5314 Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density,
    5315 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    5316 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    5317 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    5318 
    5319 > hide #!44 models
    5320 
    5321 > hide #!45 models
    5322 
    5323 > show #!43 models
    5324 
    5325 > show #!42 models
    5326 
    5327 > hide #!42 models
    5328 
    5329 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5330 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/24_Density_C5aPep-hC5aR1-Go.png width 2000
    5331 > height 1129 supersample 4 transparentBackground true
    5332 
    5333 > show #!42 models
    5334 
    5335 > hide #!43 models
    5336 
    5337 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5338 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/24_C5aPep-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1129
    5339 > supersample 4 transparentBackground true
    5340 
    5341 > view 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go
    5342 
    5343 > view Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go
    5344 
    5345 > select #42/L
    5346 
    5347 62 atoms, 65 bonds, 6 residues, 1 model selected 
    5348 
    5349 > show sel atoms
    5350 
    5351 > color sel byhetero
    5352 
    5353 > select ~sel & ##selected
    5354 
    5355 8173 atoms, 8346 bonds, 4 pseudobonds, 1118 residues, 2 models selected 
    5356 
    5357 > hide sel cartoons
    5358 
    5359 Drag select of 45 atoms, 6 residues, 43 bonds 
    5360 
    5361 > cofr sel
    5362 
    5363 > view list
    5364 
    5365 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    5366 C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    5367 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    5368 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    5369 H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF,
    5370 JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go,
    5371 Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go,
    5372 Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density,
    5373 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    5374 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    5375 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    5376 
    5377 > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go
    5378 
    5379 > ui tool show "Surface Zone"
    5380 
    5381 > surface zone #28 nearAtoms #42 distance 1.29
    5382 
    5383 > surface zone #43 nearAtoms #42 distance 7.26
    5384 
    5385 > show #!43 models
    5386 
    5387 > surface zone #43 nearAtoms #42 distance 7.26
    5388 
    5389 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 7.26
    5390 
    5391 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.83
    5392 
    5393 > volume #43 style mesh
    5394 
    5395 > volume #43 color #d3d7cf
    5396 
    5397 > volume #43 color #babdb6
    5398 
    5399 > volume #43 color #888a85
    5400 
    5401 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.19
    5402 
    5403 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5404 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/24_Lig_Density_C5aPep-hC5aR1-Go.png width 2000
    5405 > height 1129 supersample 4 transparentBackground true
    5406 
    5407 > hide #!43 models
    5408 
    5409 > hide #!42 models
    5410 
    5411 > show #!44 models
    5412 
    5413 > show #!45 models
    5414 
    5415 > view list
    5416 
    5417 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    5418 C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    5419 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    5420 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    5421 H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF,
    5422 JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go,
    5423 Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go,
    5424 Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density,
    5425 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    5426 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    5427 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    5428 
    5429 > view hTLQP_angle_01
    5430 
    5431 > view fig2_density
    5432 
    5433 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5434 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_Density_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000
    5435 > height 1129 supersample 4 transparentBackground true
    5436 
    5437 > hide #!44 models
    5438 
    5439 > show #!44 models
    5440 
    5441 > hide #!44 models
    5442 
    5443 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5444 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_Density_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000
    5445 > height 1129 supersample 4 transparentBackground true
    5446 
    5447 > hide #!45 models
    5448 
    5449 > show #!44 models
    5450 
    5451 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5452 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1129
    5453 > supersample 4 transparentBackground true
    5454 
    5455 > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-G
    5456 
    5457 Expected an objects specifier or a view name or a keyword 
    5458 
    5459 > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go
    5460 
    5461 > select #44/D
    5462 
    5463 85 atoms, 88 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    5464 
    5465 > show sel atoms
    5466 
    5467 > style sel stick
    5468 
    5469 Changed 85 atom styles 
    5470 
    5471 > color sel byhetero
    5472 
    5473 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 7.26
    5474 
    5475 > show #!45 models
    5476 
    5477 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.61
    5478 
    5479 > volume #45 style mesh
    5480 
    5481 > volume #45 color #b2b2b2
    5482 
    5483 > select ~sel & ##selected
    5484 
    5485 8139 atoms, 8309 bonds, 4 pseudobonds, 1118 residues, 2 models selected 
    5486 
    5487 > hide sel cartoons
    5488 
    5489 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 3.16
    5490 
    5491 > select ~sel & ##selected
    5492 
    5493 85 atoms, 88 bonds, 10 residues, 1 model selected 
    5494 
    5495 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.61
    5496 
    5497 > select clear
    5498 
    5499 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5500 > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_Lig_Density_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000
    5501 > height 1129 supersample 4 transparentBackground true
    5502 
    5503 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5504 > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs
    5505 > includeMaps true
    5506 
    5507 ——— End of log from Thu Apr 10 18:17:16 2025 ———
    5508 
    5509 opened ChimeraX session 
    5510 
    5511 > hide #!44 models
    5512 
    5513 > hide #!45 models
    5514 
    5515 > show #!41 models
    5516 
    5517 > show #!42 models
    5518 
    5519 > hide #!41 models
    5520 
    5521 > show #!43 models
    5522 
    5523 > color #!42 byhetero
    5524 
    5525 > show #!41 models
    5526 
    5527 > hide #!41 models
    5528 
    5529 > volume #41 color black
    5530 
    5531 > ui tool show CliX
    5532 
    5533 > transparency #41 0 target s
    5534 
    5535 > ui tool show "Show Sequence Viewer"
    5536 
    5537 > show #42 cartoons
    5538 
    5539 > cartoon style width 1.2
    5540 
    5541 > cartoon style width 1.5
    5542 
    5543 > hide cartoons
    5544 
    5545 > show #42/L cartoons
    5546 
    5547 > name list
    5548 
    5549 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8 #7/A:272-315 #9/C:408-450 
    5550 GBeta_2025 #2,5,9,10,11,12,27/B #4,7,8,15,16,18,20/C 
    5551 GGamma_2025 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/G 
    5552 GRK2_Helix #26/G:2-20 
    5553 Go_2025 #2,5,6,9,10,11,12,27/A #4,7,8,15,16,18,20/B 
    5554 JR-SB_PIF #1,11,13/C:348,110,386 
    5555 JR14-SB_CWxP #1,11,13/C:389,390,392 
    5556 JR14-SB_NPxxY #1,11,13/C:431,432,435 
    5557 NTSR1-GRK #26/G:2-20 #26/R 
    5558 ScFv_2014 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/H 
    5559 all_lig #1/D #14/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1
    5560 #12/C:JR1 #13/A:LIG 
    5561 all_lig_recep #1/D #2/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1
    5562 #12/C:JR1 #13/A:LIG #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C
    5563 #12/E #13/C 
    5564 all_recep #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C #12/E #13/C 
    5565 hC3a-JR14-SB_TM6 #1,11,13/C:371-404 
    5566 hC3a-JR14-SB_TM7 #1,11,13/C:406-439 
    5567 panchMukhi5ptSwitch #1/C:78,102,340,393,417 #11/C:78,102,340,393,417
    5568 #13/C:78,102,340,393,417 
    5569 
    5570 > show #!44 models
    5571 
    5572 > hide #!44 models
    5573 
    5574 > ui tool show "Show Sequence Viewer"
    5575 
    5576 > sequence chain #42/D #44/A
    5577 
    5578 Alignment identifier is 1 
    5579 
    5580 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5581 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5582 > hC5aR1-Go_LIG.png width 2000 height 1155 supersample 4 transparentBackground
    5583 > true
    5584 
    5585 > show #42/D cartoons
    5586 
    5587 > ui tool show "Surface Zone"
    5588 
    5589 > surface zone #43 nearAtoms #42 distance 1.21
    5590 
    5591 No atoms selected for zoning 
    5592 
    5593 > select clear
    5594 
    5595 > surface unzone #43
    5596 
    5597 > select #42/D:35 #44/A:35
    5598 
    5599 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5600 
    5601 > select #42/D:35-65 #44/A:35-65
    5602 
    5603 466 atoms, 476 bonds, 62 residues, 2 models selected 
    5604 1 [ID: 1] region chains A,D [4-34] RMSD: 0.885 
    5605  
    5606 
    5607 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.12
    5608 
    5609 > cofr sel
    5610 
    5611 > hide atoms
    5612 
    5613 [Repeated 1 time(s)]
    5614 
    5615 > hide ribbons
    5616 
    5617 > hide atoms
    5618 
    5619 > hide ribbons
    5620 
    5621 > cofr sel
    5622 
    5623 No displayed objects specified. 
    5624 
    5625 > hide atoms
    5626 
    5627 > hide ribbons
    5628 
    5629 > cofr sel
    5630 
    5631 No displayed objects specified. 
    5632 
    5633 > hide atoms
    5634 
    5635 > hide ribbons
    5636 
    5637 > show sel atoms
    5638 
    5639 > show sel ribbons
    5640 
    5641 > cofr sel
    5642 
    5643 > hide atoms
    5644 
    5645 > hide ribbons
    5646 
    5647 > show sel atoms
    5648 
    5649 > style sel stick
    5650 
    5651 Changed 466 atom styles 
    5652 
    5653 > show sel ribbons
    5654 
    5655 > cofr sel
    5656 
    5657 > show #42/D cartoons
    5658 
    5659 > hide atoms
    5660 
    5661 > hide ribbons
    5662 
    5663 > show sel atoms
    5664 
    5665 > style sel stick
    5666 
    5667 Changed 466 atom styles 
    5668 
    5669 > show sel ribbons
    5670 
    5671 > cofr sel
    5672 
    5673 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 1.99
    5674 
    5675 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.67
    5676 
    5677 > graphics selection color black
    5678 
    5679 > graphics selection width 2
    5680 
    5681 > volume #43 step 2
    5682 
    5683 > volume #43 step 1
    5684 
    5685 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5686 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5687 > hC5aR1-Go_TM1.png width 2000 height 1177 supersample 4 transparentBackground
    5688 > true
    5689 
    5690 > select #42/D:70 #44/A:70
    5691 
    5692 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5693 
    5694 > select #42/D:70-97 #44/A:70-97
    5695 
    5696 431 atoms, 441 bonds, 56 residues, 2 models selected 
    5697 1 [ID: 1] region chains A,D [39-66] RMSD: 0.419 
    5698  
    5699 
    5700 > hide atoms
    5701 
    5702 > hide ribbons
    5703 
    5704 > show sel atoms
    5705 
    5706 > style sel stick
    5707 
    5708 Changed 431 atom styles 
    5709 
    5710 > show sel ribbons
    5711 
    5712 > cofr sel
    5713 
    5714 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.67
    5715 
    5716 > select #42/D:35-36 #44/A:35-36
    5717 
    5718 28 atoms, 28 bonds, 4 residues, 2 models selected 
    5719 
    5720 > select #42/D:36-65 #44/A:36-65
    5721 
    5722 452 atoms, 462 bonds, 60 residues, 2 models selected 
    5723 1 [ID: 1] region chains A,D [5-34] RMSD: 0.894 
    5724  
    5725 
    5726 > select clear
    5727 
    5728 > select #42/D:39 #44/A:39
    5729 
    5730 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5731 
    5732 > select #42/D:39-42 #44/A:39-42
    5733 
    5734 56 atoms, 54 bonds, 8 residues, 2 models selected 
    5735 1 [ID: 1] region chains A,D [8-11] RMSD: 0.261 
    5736  
    5737 
    5738 > select #42/D:35 #44/A:35
    5739 
    5740 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5741 
    5742 > select #42/D:35-65 #44/A:35-65
    5743 
    5744 466 atoms, 476 bonds, 62 residues, 2 models selected 
    5745 1 [ID: 1] region chains A,D [4-34] RMSD: 0.885 
    5746  
    5747 
    5748 > hide atoms
    5749 
    5750 > hide ribbons
    5751 
    5752 > show sel atoms
    5753 
    5754 > style sel stick
    5755 
    5756 Changed 466 atom styles 
    5757 
    5758 > show sel ribbons
    5759 
    5760 > cofr sel
    5761 
    5762 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.67
    5763 
    5764 > volume #45 level 0.1437
    5765 
    5766 > volume #43 level 0.06976
    5767 
    5768 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    5769 
    5770 > graphics silhouettes true
    5771 
    5772 > graphics silhouettes false
    5773 
    5774 > graphics silhouettes true
    5775 
    5776 > graphics silhouettes false
    5777 
    5778 > graphics silhouettes true
    5779 
    5780 > graphics silhouettes false
    5781 
    5782 > graphics silhouettes true
    5783 
    5784 > graphics silhouettes false
    5785 
    5786 > graphics silhouettes true
    5787 
    5788 > graphics silhouettes false
    5789 
    5790 > graphics silhouettes true
    5791 
    5792 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5793 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5794 > hC5aR1-Go_TM1_sigma-0.0698_zoneR-2.32_silht.png width 2000 height 1177
    5795 > supersample 4 transparentBackground true
    5796 
    5797 > transparency #42 0 target s
    5798 
    5799 > transparency #43 0 target s
    5800 
    5801 > graphics silhouettes false
    5802 
    5803 > transparency #43 60 target s
    5804 
    5805 > graphics silhouettes true
    5806 
    5807 > transparency #43 30 target s
    5808 
    5809 > transparency #43 90 target s
    5810 
    5811 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5812 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5813 > hC5aR1-Go_TM1_sigma-0.0698_zoneR-2.32_silht_trans90.png width 2000 height
    5814 > 1177 supersample 4 transparentBackground true
    5815 
    5816 > select #42/D:70 #44/A:70
    5817 
    5818 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5819 
    5820 > select #42/D:70-97 #44/A:70-97
    5821 
    5822 431 atoms, 441 bonds, 56 residues, 2 models selected 
    5823 1 [ID: 1] region chains A,D [39-66] RMSD: 0.419 
    5824  
    5825 
    5826 > hide atoms
    5827 
    5828 > hide ribbons
    5829 
    5830 > show sel atoms
    5831 
    5832 > style sel stick
    5833 
    5834 Changed 431 atom styles 
    5835 
    5836 > show sel ribbons
    5837 
    5838 > cofr sel
    5839 
    5840 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    5841 
    5842 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM2
    5843 
    5844 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5845 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5846 > hC5aR1-Go_TM2_sigma-0.0698_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000
    5847 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    5848 
    5849 > select #42/D:105 #44/A:105
    5850 
    5851 8 atoms, 6 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5852 
    5853 > select #42/D:105-139 #44/A:105-139
    5854 
    5855 513 atoms, 519 bonds, 70 residues, 2 models selected 
    5856 1 [ID: 1] region chains A,D [74-108] RMSD: 0.559 
    5857  
    5858 
    5859 > hide atoms
    5860 
    5861 > hide ribbons
    5862 
    5863 > show sel atoms
    5864 
    5865 > style sel stick
    5866 
    5867 Changed 513 atom styles 
    5868 
    5869 > show sel ribbons
    5870 
    5871 > cofr sel
    5872 
    5873 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    5874 
    5875 > volume #43 level 0.1343
    5876 
    5877 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3
    5878 
    5879 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5880 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5881 > hC5aR1-Go_TM3_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000
    5882 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    5883 
    5884 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3
    5885 
    5886 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5887 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5888 > hC5aR1-Go_TM3_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000
    5889 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    5890 
    5891 > select #42/D:141 #44/A:141
    5892 
    5893 14 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5894 
    5895 > select #42/D:141-174 #44/A:141-174
    5896 
    5897 528 atoms, 548 bonds, 68 residues, 2 models selected 
    5898 1 [ID: 1] region chains A,D [110-143] RMSD: 0.755 
    5899  
    5900 
    5901 > hide atoms
    5902 
    5903 > hide ribbons
    5904 
    5905 > show sel atoms
    5906 
    5907 > style sel stick
    5908 
    5909 Changed 528 atom styles 
    5910 
    5911 > show sel ribbons
    5912 
    5913 > cofr sel
    5914 
    5915 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    5916 
    5917 > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3
    5918 
    5919 > select #42/D:141 #44/A:141
    5920 
    5921 14 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5922 
    5923 > select #42/D:141-153 #44/A:141-153
    5924 
    5925 200 atoms, 206 bonds, 26 residues, 2 models selected 
    5926 1 [ID: 1] region chains A,D [110-122] RMSD: 0.679 
    5927  
    5928 
    5929 > select clear
    5930 
    5931 > select #42/D:141 #44/A:141
    5932 
    5933 14 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5934 
    5935 > select #42/D:141-166 #44/A:141-166
    5936 
    5937 394 atoms, 408 bonds, 52 residues, 2 models selected 
    5938 1 [ID: 1] region chains A,D [110-135] RMSD: 0.778 
    5939  
    5940 
    5941 > select clear
    5942 
    5943 > select #42/D:174 #44/A:174
    5944 
    5945 24 atoms, 24 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5946 
    5947 > select #42/D:150-174 #44/A:150-174
    5948 
    5949 372 atoms, 384 bonds, 50 residues, 2 models selected 
    5950 1 [ID: 1] region chains A,D [119-143] RMSD: 0.784 
    5951  
    5952 
    5953 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    5954 
    5955 > hide atoms
    5956 
    5957 > hide ribbons
    5958 
    5959 > show sel atoms
    5960 
    5961 > style sel stick
    5962 
    5963 Changed 372 atom styles 
    5964 
    5965 > show sel ribbons
    5966 
    5967 > cofr sel
    5968 
    5969 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM4
    5970 
    5971 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    5972 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    5973 > hC5aR1-Go_TM4_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000
    5974 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    5975 
    5976 [Repeated 1 time(s)]
    5977 
    5978 > select #42/D:196 #44/A:196
    5979 
    5980 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    5981 
    5982 > select #42/D:196-231 #44/A:196-231
    5983 
    5984 600 atoms, 614 bonds, 72 residues, 2 models selected 
    5985 1 [ID: 1] region chains A,D [165-200] RMSD: 0.962 
    5986  
    5987 
    5988 > hide atoms
    5989 
    5990 > hide ribbons
    5991 
    5992 > show sel atoms
    5993 
    5994 > style sel stick
    5995 
    5996 Changed 600 atom styles 
    5997 
    5998 > show sel ribbons
    5999 
    6000 > cofr sel
    6001 
    6002 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    6003 
    6004 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM5
    6005 
    6006 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6007 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6008 > hC5aR1-Go_TM5_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000
    6009 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6010 
    6011 > select #42/D:239 #44/A:239
    6012 
    6013 18 atoms, 16 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6014 
    6015 > select #42/D:239-267 #44/A:239-267
    6016 
    6017 468 atoms, 482 bonds, 58 residues, 2 models selected 
    6018 1 [ID: 1] region chains A,D [208-236] RMSD: 0.392 
    6019  
    6020 
    6021 > hide atoms
    6022 
    6023 > hide ribbons
    6024 
    6025 > show sel atoms
    6026 
    6027 > style sel stick
    6028 
    6029 Changed 468 atom styles 
    6030 
    6031 > show sel ribbons
    6032 
    6033 > cofr sel
    6034 
    6035 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    6036 
    6037 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM6
    6038 
    6039 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6040 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6041 > hC5aR1-Go_TM6_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000
    6042 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6043 
    6044 > select #42/D:272 #44/A:272
    6045 
    6046 12 atoms, 10 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6047 
    6048 > select #42/D:272-303 #44/A:272-303
    6049 
    6050 494 atoms, 504 bonds, 64 residues, 2 models selected 
    6051 1 [ID: 1] region chains A,D [241-272] RMSD: 0.602 
    6052  
    6053 
    6054 > hide atoms
    6055 
    6056 > hide ribbons
    6057 
    6058 > show sel atoms
    6059 
    6060 > style sel stick
    6061 
    6062 Changed 494 atom styles 
    6063 
    6064 > show sel ribbons
    6065 
    6066 > cofr sel
    6067 
    6068 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    6069 
    6070 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7
    6071 
    6072 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6073 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6074 > hC5aR1-Go_TM7_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000
    6075 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6076 
    6077 > select #42/D:305 #44/A:305
    6078 
    6079 18 atoms, 16 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6080 
    6081 > select #42/D:305-313 #44/A:305-313
    6082 
    6083 152 atoms, 152 bonds, 18 residues, 2 models selected 
    6084 1 [ID: 1] region chains A,D [274-282] RMSD: 1.994 
    6085  
    6086 
    6087 > hide atoms
    6088 
    6089 > hide ribbons
    6090 
    6091 > show sel atoms
    6092 
    6093 > style sel stick
    6094 
    6095 Changed 152 atom styles 
    6096 
    6097 > show sel ribbons
    6098 
    6099 > cofr sel
    6100 
    6101 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    6102 
    6103 > volume #43 level 0.01242
    6104 
    6105 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.22
    6106 
    6107 > volume #43 level 0.00525
    6108 
    6109 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.15
    6110 
    6111 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-H8
    6112 
    6113 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6114 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6115 > hC5aR1-Go_H8_sigma-0.00525_zoneR-2.15_mesh_trans90_silht.png width 2000
    6116 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6117 
    6118 > show #42 cartoons
    6119 
    6120 > select #42/B:350
    6121 
    6122 4 atoms, 3 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    6123 
    6124 > select up
    6125 
    6126 156 atoms, 156 bonds, 21 residues, 1 model selected 
    6127 
    6128 > hide atoms
    6129 
    6130 > hide ribbons
    6131 
    6132 > show sel atoms
    6133 
    6134 > style sel stick
    6135 
    6136 Changed 156 atom styles 
    6137 
    6138 > show sel ribbons
    6139 
    6140 > cofr sel
    6141 
    6142 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.15
    6143 
    6144 > volume #43 level 0.1522
    6145 
    6146 > volume #43 level 0.134
    6147 
    6148 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.1
    6149 
    6150 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2
    6151 
    6152 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.3
    6153 
    6154 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    6155 
    6156 [Repeated 1 time(s)]
    6157 
    6158 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6159 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6160 > hC5aR1-Go_a5_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 height
    6161 > 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6162 
    6163 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-a5
    6164 
    6165 > show #42 cartoons
    6166 
    6167 > select #42/B:30
    6168 
    6169 5 atoms, 4 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    6170 
    6171 > select up
    6172 
    6173 145 atoms, 144 bonds, 23 residues, 1 model selected 
    6174 
    6175 > hide atoms
    6176 
    6177 > hide ribbons
    6178 
    6179 > show sel atoms
    6180 
    6181 > style sel stick
    6182 
    6183 Changed 145 atom styles 
    6184 
    6185 > show sel ribbons
    6186 
    6187 > cofr sel
    6188 
    6189 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    6190 
    6191 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-aN
    6192 
    6193 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6194 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6195 > hC5aR1-Go_aN_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 height
    6196 > 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6197 
    6198 > show #42 cartoons
    6199 
    6200 > select #42/L:4
    6201 
    6202 11 atoms, 11 bonds, 1 residue, 1 model selected 
    6203 
    6204 > select up
    6205 
    6206 62 atoms, 65 bonds, 6 residues, 1 model selected 
    6207 
    6208 > hide atoms
    6209 
    6210 > hide ribbons
    6211 
    6212 > show sel atoms
    6213 
    6214 > style sel stick
    6215 
    6216 Changed 62 atom styles 
    6217 
    6218 > show sel ribbons
    6219 
    6220 > cofr sel
    6221 
    6222 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32
    6223 
    6224 > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.15
    6225 
    6226 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6227 > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6228 > hC5aR1-Go_LIG_sigma-0.134_zoneR-2.15_mesh_trans90_silht.png width 2000
    6229 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6230 
    6231 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-LIG
    6232 
    6233 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6234 > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250427.cxs
    6235 > includeMaps true
    6236 
    6237 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6238 > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs
    6239 > includeMaps true
    6240 
    6241 > hide #!43 models
    6242 
    6243 > hide #!42 models
    6244 
    6245 > show #!44 models
    6246 
    6247 > show #!45 models
    6248 
    6249 > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7
    6250 
    6251 > show #44 atoms
    6252 
    6253 > hide #44 atoms
    6254 
    6255 > show #44 cartoons
    6256 
    6257 > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7
    6258 
    6259 > view list
    6260 
    6261 Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go,
    6262 24_C5aPep-hC5aR1-Go-H8, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-LIG, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM2,
    6263 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM4, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM5,
    6264 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM6, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-a5,
    6265 24_C5aPep-hC5aR1-Go-aN, C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02,
    6266 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut,
    6267 EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut,
    6268 H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF,
    6269 JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go,
    6270 Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go,
    6271 Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density,
    6272 hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7,
    6273 hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01,
    6274 hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 
    6275 
    6276 > select #42/D:35 #44/A:35
    6277 
    6278 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6279 
    6280 > select #42/D:35-65 #44/A:35-65
    6281 
    6282 466 atoms, 476 bonds, 62 residues, 2 models selected 
    6283 1 [ID: 1] region chains A,D [4-34] RMSD: 0.885 
    6284  
    6285 
    6286 > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM1
    6287 
    6288 Expected an objects specifier or a view name or a keyword 
    6289 
    6290 > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM1
    6291 
    6292 Expected an objects specifier or a view name or a keyword 
    6293 
    6294 > hide atoms
    6295 
    6296 > hide ribbons
    6297 
    6298 > show sel atoms
    6299 
    6300 > style sel stick
    6301 
    6302 Changed 466 atom styles 
    6303 
    6304 > show sel ribbons
    6305 
    6306 > cofr sel
    6307 
    6308 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.61
    6309 
    6310 > color sel & #!44 byhetero
    6311 
    6312 > volume #45 level 0.1289
    6313 
    6314 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.78
    6315 
    6316 > volume #45 level 0.1215
    6317 
    6318 > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM1
    6319 
    6320 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2
    6321 
    6322 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.1
    6323 
    6324 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.15
    6325 
    6326 [Repeated 1 time(s)]
    6327 
    6328 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.87
    6329 
    6330 > view name 25_EP54-hC5aR1-Go-TM1
    6331 
    6332 [Repeated 1 time(s)]
    6333 
    6334 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6335 > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6336 > hC5aR1-Go_LIG_sigma-0.122_zoneR-1.87_mesh_trans90_silht.png width 2000
    6337 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6338 
    6339 > transparency #45 90 target s
    6340 
    6341 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6342 > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep-
    6343 > hC5aR1-Go_LIG_sigma-0.122_zoneR-1.87_mesh_trans90_silht.png width 2000
    6344 > height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6345 
    6346 > select #42/D:70 #44/A:70
    6347 
    6348 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6349 
    6350 > select #42/D:70-97 #44/A:70-97
    6351 
    6352 431 atoms, 441 bonds, 56 residues, 2 models selected 
    6353 1 [ID: 1] region chains A,D [39-66] RMSD: 0.419 
    6354  
    6355 
    6356 > hide atoms
    6357 
    6358 > hide ribbons
    6359 
    6360 > show sel atoms
    6361 
    6362 > style sel stick
    6363 
    6364 Changed 431 atom styles 
    6365 
    6366 > show sel ribbons
    6367 
    6368 > cofr sel
    6369 
    6370 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.87
    6371 
    6372 > color #44 by
    6373 
    6374 Expected a color or one of 'byatom', 'bychain', 'byelement', 'byhetero',
    6375 'byidentity', 'bymodel', 'bynucleotide', 'bypolymer', 'fromatoms',
    6376 'fromcartoons', 'fromribbons', or 'random' or a keyword 
    6377 
    6378 > color #44 byhetero
    6379 
    6380 > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM2
    6381 
    6382 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6383 > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/25_EP54-hC5aR1-Go_TM2_sigma-0.122_zoneR-1.87_mesh_trans90_silht.png
    6384 > width 2000 height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6385 
    6386 > select #42/D:105 #44/A:105
    6387 
    6388 8 atoms, 6 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6389 
    6390 > select #42/D:105-139 #44/A:105-139
    6391 
    6392 513 atoms, 519 bonds, 70 residues, 2 models selected 
    6393 1 [ID: 1] region chains A,D [74-108] RMSD: 0.559 
    6394  
    6395 
    6396 > select #42/D:108 #44/A:108
    6397 
    6398 10 atoms, 8 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6399 
    6400 > select #42/D:108-109 #44/A:108-109
    6401 
    6402 22 atoms, 20 bonds, 4 residues, 2 models selected 
    6403 1 [ID: 1] region chains A,D [77-78] RMSD: 0.526 
    6404  
    6405 
    6406 > select #42/D:105 #44/A:105
    6407 
    6408 8 atoms, 6 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6409 
    6410 > select #42/D:105-139 #44/A:105-139
    6411 
    6412 513 atoms, 519 bonds, 70 residues, 2 models selected 
    6413 1 [ID: 1] region chains A,D [74-108] RMSD: 0.559 
    6414  
    6415 
    6416 > hide atoms
    6417 
    6418 > hide ribbons
    6419 
    6420 > show sel atoms
    6421 
    6422 > style sel stick
    6423 
    6424 Changed 513 atom styles 
    6425 
    6426 > show sel ribbons
    6427 
    6428 > cofr sel
    6429 
    6430 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.87
    6431 
    6432 > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3
    6433 
    6434 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.94
    6435 
    6436 > volume #45 level 0.1844
    6437 
    6438 > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.05
    6439 
    6440 > volume #45 level 0.1844
    6441 
    6442 > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement-
    6443 > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/25_EP54-hC5aR1-Go_TM3_sigma-0.184_zoneR-2.05_mesh_trans90_silht.png
    6444 > width 2000 height 1147 supersample 4 transparentBackground true
    6445 
    6446 > select #42/D:150 #44/A:150
    6447 
    6448 10 atoms, 8 bonds, 2 residues, 2 models selected 
    6449 
    6450 > select #42/D:150-174 #44/A:150-174
    6451 
    6452 372 atoms, 384 bonds, 50 residues, 2 models selected 
    6453 1 [ID: 1] region chains A,D [119-143] RMSD: 0.784 
    6454  
     1449[deleted to fit within ticket limits]
     1450
    64551451
    64561452> hide atoms
     
    98224818'/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    98234819 
    9824 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9825 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9826  
    9827 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9828 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9829 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9830  
    9831 See log for complete Python traceback. 
    9832  
    9833 Traceback (most recent call last): 
    9834 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9835 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    9836 self._update_completion_state(False) 
    9837 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9838 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    9839 _update_completion_state 
    9840 self._current_completion_state =
    9841 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    9842 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9843 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9844 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    9845 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    9846 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9847 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9848 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    9849 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    9850 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9851 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9852 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    9853 _complete_path_impl 
    9854 if _maybe_path.exists(): 
    9855 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9856 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    9857 self.stat() 
    9858 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9859 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9860 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9861 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9862 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9863  
    9864 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9865 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9866  
    9867 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9868 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9869 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9870  
    9871 See log for complete Python traceback. 
    9872  
    9873 Traceback (most recent call last): 
    9874 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9875 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    9876 self._update_completion_state(False) 
    9877 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9878 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    9879 _update_completion_state 
    9880 self._current_completion_state =
    9881 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    9882 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9883 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9884 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    9885 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    9886 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9887 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9888 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    9889 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    9890 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9891 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9892 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    9893 _complete_path_impl 
    9894 if _maybe_path.exists(): 
    9895 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9896 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    9897 self.stat() 
    9898 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9899 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9900 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9901 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9902 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9903  
    9904 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9905 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9906  
    9907 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9908 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9909 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9910  
    9911 See log for complete Python traceback. 
    9912  
    9913 Traceback (most recent call last): 
    9914 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9915 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    9916 self._update_completion_state(False) 
    9917 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9918 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    9919 _update_completion_state 
    9920 self._current_completion_state =
    9921 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    9922 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9923 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9924 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    9925 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    9926 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9927 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9928 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    9929 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    9930 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9931 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9932 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    9933 _complete_path_impl 
    9934 if _maybe_path.exists(): 
    9935 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9936 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    9937 self.stat() 
    9938 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9939 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9940 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9941 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9942 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9943  
    9944 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9945 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9946  
    9947 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9948 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9949 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9950  
    9951 See log for complete Python traceback. 
    9952  
    9953 Traceback (most recent call last): 
    9954 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9955 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    9956 self._update_completion_state(False) 
    9957 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9958 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    9959 _update_completion_state 
    9960 self._current_completion_state =
    9961 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    9962 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9963 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9964 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    9965 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    9966 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9967 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9968 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    9969 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    9970 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9971 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9972 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    9973 _complete_path_impl 
    9974 if _maybe_path.exists(): 
    9975 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9976 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    9977 self.stat() 
    9978 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9979 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9980 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9981 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9982 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9983  
    9984 OSError: [Errno 36] File name too long:
    9985 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    9986  
    9987 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    9988 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    9989 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    9990  
    9991 See log for complete Python traceback. 
    9992  
    9993 Traceback (most recent call last): 
    9994 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9995 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    9996 self._update_completion_state(False) 
    9997 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    9998 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    9999 _update_completion_state 
    10000 self._current_completion_state =
    10001 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10002 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10003 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10004 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10005 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10006 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10007 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10008 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10009 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10010 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10011 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10012 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10013 _complete_path_impl 
    10014 if _maybe_path.exists(): 
    10015 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10016 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10017 self.stat() 
    10018 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10019 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10020 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10021 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10022 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10023  
    10024 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10025 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10026  
    10027 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10028 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10029 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10030  
    10031 See log for complete Python traceback. 
    10032  
    10033 Traceback (most recent call last): 
    10034 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10035 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10036 self._update_completion_state(False) 
    10037 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10038 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10039 _update_completion_state 
    10040 self._current_completion_state =
    10041 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10042 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10043 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10044 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10045 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10046 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10047 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10048 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10049 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10050 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10051 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10052 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10053 _complete_path_impl 
    10054 if _maybe_path.exists(): 
    10055 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10056 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10057 self.stat() 
    10058 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10059 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10060 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10061 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10062 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10063  
    10064 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10065 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10066  
    10067 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10068 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10069 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10070  
    10071 See log for complete Python traceback. 
    10072  
    10073 Traceback (most recent call last): 
    10074 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10075 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10076 self._update_completion_state(False) 
    10077 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10078 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10079 _update_completion_state 
    10080 self._current_completion_state =
    10081 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10082 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10083 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10084 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10085 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10086 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10087 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10088 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10089 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10090 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10091 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10092 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10093 _complete_path_impl 
    10094 if _maybe_path.exists(): 
    10095 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10096 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10097 self.stat() 
    10098 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10099 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10100 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10101 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10102 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10103  
    10104 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10105 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10106  
    10107 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10108 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10109 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10110  
    10111 See log for complete Python traceback. 
    10112  
    10113 Traceback (most recent call last): 
    10114 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10115 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10116 self._update_completion_state(False) 
    10117 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10118 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10119 _update_completion_state 
    10120 self._current_completion_state =
    10121 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10122 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10123 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10124 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10125 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10126 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10127 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10128 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10129 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10130 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10131 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10132 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10133 _complete_path_impl 
    10134 if _maybe_path.exists(): 
    10135 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10136 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10137 self.stat() 
    10138 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10139 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10140 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10141 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10142 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10143  
    10144 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10145 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10146  
    10147 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10148 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10149 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10150  
    10151 See log for complete Python traceback. 
    10152  
    10153 Traceback (most recent call last): 
    10154 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10155 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10156 self._update_completion_state(False) 
    10157 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10158 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10159 _update_completion_state 
    10160 self._current_completion_state =
    10161 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10162 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10163 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10164 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10165 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10166 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10167 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10168 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10169 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10170 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10171 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10172 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10173 _complete_path_impl 
    10174 if _maybe_path.exists(): 
    10175 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10176 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10177 self.stat() 
    10178 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10179 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10180 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10181 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10182 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10183  
    10184 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10185 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10186  
    10187 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10188 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10189 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10190  
    10191 See log for complete Python traceback. 
    10192  
    10193 Traceback (most recent call last): 
    10194 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10195 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10196 self._update_completion_state(False) 
    10197 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10198 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10199 _update_completion_state 
    10200 self._current_completion_state =
    10201 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10202 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10203 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10204 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10205 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10206 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10207 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10208 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10209 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10210 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10211 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10212 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10213 _complete_path_impl 
    10214 if _maybe_path.exists(): 
    10215 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10216 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10217 self.stat() 
    10218 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10219 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10220 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10221 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10222 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10223  
    10224 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10225 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10226  
    10227 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10228 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10229 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10230  
    10231 See log for complete Python traceback. 
    10232  
    10233 Traceback (most recent call last): 
    10234 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10235 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10236 self._update_completion_state(False) 
    10237 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10238 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10239 _update_completion_state 
    10240 self._current_completion_state =
    10241 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10242 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10243 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10244 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10245 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10246 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10247 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10248 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10249 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10250 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10251 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10252 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10253 _complete_path_impl 
    10254 if _maybe_path.exists(): 
    10255 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10256 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10257 self.stat() 
    10258 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10259 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10260 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10261 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10262 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10263  
    10264 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10265 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10266  
    10267 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10268 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10269 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10270  
    10271 See log for complete Python traceback. 
    10272  
    10273 Traceback (most recent call last): 
    10274 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10275 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10276 self._update_completion_state(False) 
    10277 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10278 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10279 _update_completion_state 
    10280 self._current_completion_state =
    10281 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10282 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10283 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10284 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10285 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10286 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10287 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10288 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10289 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10290 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10291 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10292 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10293 _complete_path_impl 
    10294 if _maybe_path.exists(): 
    10295 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10296 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10297 self.stat() 
    10298 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10299 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10300 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10301 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10302 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10303  
    10304 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10305 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10306  
    10307 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10308 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10309 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10310  
    10311 See log for complete Python traceback. 
    10312  
    10313 Traceback (most recent call last): 
    10314 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10315 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10316 self._update_completion_state(False) 
    10317 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10318 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10319 _update_completion_state 
    10320 self._current_completion_state =
    10321 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10322 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10323 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10324 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10325 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10326 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10327 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10328 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10329 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10330 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10331 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10332 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10333 _complete_path_impl 
    10334 if _maybe_path.exists(): 
    10335 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10336 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10337 self.stat() 
    10338 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10339 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10340 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10341 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10342 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10343  
    10344 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10345 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10346  
    10347 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10348 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10349 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10350  
    10351 See log for complete Python traceback. 
    10352  
    10353 Traceback (most recent call last): 
    10354 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10355 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10356 self._update_completion_state(False) 
    10357 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10358 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10359 _update_completion_state 
    10360 self._current_completion_state =
    10361 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10362 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10363 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10364 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10365 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10366 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10367 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10368 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10369 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10370 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10371 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10372 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10373 _complete_path_impl 
    10374 if _maybe_path.exists(): 
    10375 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10376 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10377 self.stat() 
    10378 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10379 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10380 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10381 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10382 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10383  
    10384 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10385 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10386  
    10387 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10388 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10389 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10390  
    10391 See log for complete Python traceback. 
    10392  
    10393 Traceback (most recent call last): 
    10394 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10395 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10396 self._update_completion_state(False) 
    10397 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10398 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10399 _update_completion_state 
    10400 self._current_completion_state =
    10401 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10402 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10403 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10404 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10405 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10406 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10407 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10408 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10409 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10410 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10411 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10412 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10413 _complete_path_impl 
    10414 if _maybe_path.exists(): 
    10415 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10416 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10417 self.stat() 
    10418 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10419 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10420 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10421 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10422 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10423  
    10424 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10425 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10426  
    10427 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10428 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10429 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10430  
    10431 See log for complete Python traceback. 
    10432  
    10433 Traceback (most recent call last): 
    10434 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10435 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10436 self._update_completion_state(False) 
    10437 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10438 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10439 _update_completion_state 
    10440 self._current_completion_state =
    10441 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10442 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10443 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10444 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10445 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10446 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10447 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10448 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10449 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10450 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10451 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10452 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10453 _complete_path_impl 
    10454 if _maybe_path.exists(): 
    10455 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10456 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10457 self.stat() 
    10458 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10459 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10460 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10461 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10462 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10463  
    10464 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10465 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10466  
    10467 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10468 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10469 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10470  
    10471 See log for complete Python traceback. 
    10472  
    10473 Traceback (most recent call last): 
    10474 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10475 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10476 self._update_completion_state(False) 
    10477 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10478 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10479 _update_completion_state 
    10480 self._current_completion_state =
    10481 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10482 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10483 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10484 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10485 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10486 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10487 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10488 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10489 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10490 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10491 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10492 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10493 _complete_path_impl 
    10494 if _maybe_path.exists(): 
    10495 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10496 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10497 self.stat() 
    10498 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10499 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10500 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10501 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10502 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10503  
    10504 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10505 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10506  
    10507 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10508 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10509 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10510  
    10511 See log for complete Python traceback. 
    10512  
    10513 Traceback (most recent call last): 
    10514 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10515 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10516 self._update_completion_state(False) 
    10517 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10518 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10519 _update_completion_state 
    10520 self._current_completion_state =
    10521 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10522 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10523 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10524 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10525 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10526 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10527 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10528 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10529 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10530 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10531 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10532 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10533 _complete_path_impl 
    10534 if _maybe_path.exists(): 
    10535 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10536 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10537 self.stat() 
    10538 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10539 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10540 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10541 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10542 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10543  
    10544 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10545 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10546  
    10547 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10548 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10549 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10550  
    10551 See log for complete Python traceback. 
    10552  
    10553 Traceback (most recent call last): 
    10554 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10555 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10556 self._update_completion_state(False) 
    10557 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10558 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10559 _update_completion_state 
    10560 self._current_completion_state =
    10561 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10562 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10563 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10564 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10565 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10566 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10567 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10568 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10569 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10570 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10571 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10572 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10573 _complete_path_impl 
    10574 if _maybe_path.exists(): 
    10575 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10576 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10577 self.stat() 
    10578 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10579 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10580 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10581 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10582 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10583  
    10584 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10585 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10586  
    10587 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10588 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10589 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10590  
    10591 See log for complete Python traceback. 
    10592  
    10593 Traceback (most recent call last): 
    10594 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10595 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10596 self._update_completion_state(False) 
    10597 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10598 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10599 _update_completion_state 
    10600 self._current_completion_state =
    10601 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10602 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10603 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10604 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10605 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10606 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10607 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10608 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10609 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10610 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10611 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10612 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10613 _complete_path_impl 
    10614 if _maybe_path.exists(): 
    10615 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10616 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10617 self.stat() 
    10618 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10619 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10620 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10621 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10622 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10623  
    10624 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10625 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10626  
    10627 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10628 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10629 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10630  
    10631 See log for complete Python traceback. 
    10632  
    10633 Traceback (most recent call last): 
    10634 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10635 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10636 self._update_completion_state(False) 
    10637 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10638 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10639 _update_completion_state 
    10640 self._current_completion_state =
    10641 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10642 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10643 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10644 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10645 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10646 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10647 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10648 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10649 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10650 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10651 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10652 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10653 _complete_path_impl 
    10654 if _maybe_path.exists(): 
    10655 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10656 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10657 self.stat() 
    10658 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10659 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10660 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10661 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10662 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10663  
    10664 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10665 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10666  
    10667 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10668 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10669 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10670  
    10671 See log for complete Python traceback. 
    10672  
    10673 Traceback (most recent call last): 
    10674 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10675 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10676 self._update_completion_state(False) 
    10677 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10678 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10679 _update_completion_state 
    10680 self._current_completion_state =
    10681 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10682 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10683 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10684 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10685 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10686 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10687 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10688 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10689 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10690 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10691 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10692 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10693 _complete_path_impl 
    10694 if _maybe_path.exists(): 
    10695 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10696 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10697 self.stat() 
    10698 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10699 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10700 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10701 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10702 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10703  
    10704 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10705 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10706  
    10707 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10708 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10709 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10710  
    10711 See log for complete Python traceback. 
    10712  
    10713 Traceback (most recent call last): 
    10714 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10715 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10716 self._update_completion_state(False) 
    10717 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10718 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10719 _update_completion_state 
    10720 self._current_completion_state =
    10721 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10722 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10723 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10724 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10725 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10726 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10727 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10728 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10729 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10730 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10731 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10732 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10733 _complete_path_impl 
    10734 if _maybe_path.exists(): 
    10735 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10736 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10737 self.stat() 
    10738 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10739 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10740 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10741 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10742 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10743  
    10744 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10745 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10746  
    10747 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10748 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10749 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10750  
    10751 See log for complete Python traceback. 
    10752  
    10753 Traceback (most recent call last): 
    10754 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10755 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10756 self._update_completion_state(False) 
    10757 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10758 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10759 _update_completion_state 
    10760 self._current_completion_state =
    10761 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10762 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10763 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10764 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10765 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10766 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10767 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10768 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10769 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10770 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10771 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10772 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10773 _complete_path_impl 
    10774 if _maybe_path.exists(): 
    10775 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10776 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10777 self.stat() 
    10778 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10779 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10780 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10781 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10782 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10783  
    10784 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10785 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10786  
    10787 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10788 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10789 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10790  
    10791 See log for complete Python traceback. 
    10792  
    10793 Traceback (most recent call last): 
    10794 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10795 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10796 self._update_completion_state(False) 
    10797 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10798 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10799 _update_completion_state 
    10800 self._current_completion_state =
    10801 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10802 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10803 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10804 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10805 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10806 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10807 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10808 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10809 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10810 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10811 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10812 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10813 _complete_path_impl 
    10814 if _maybe_path.exists(): 
    10815 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10816 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10817 self.stat() 
    10818 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10819 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10820 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10821 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10822 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10823  
    10824 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10825 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10826  
    10827 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10828 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10829 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10830  
    10831 See log for complete Python traceback. 
    10832  
    10833 Traceback (most recent call last): 
    10834 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10835 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10836 self._update_completion_state(False) 
    10837 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10838 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10839 _update_completion_state 
    10840 self._current_completion_state =
    10841 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10842 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10843 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10844 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10845 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10846 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10847 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10848 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10849 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10850 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10851 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10852 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10853 _complete_path_impl 
    10854 if _maybe_path.exists(): 
    10855 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10856 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10857 self.stat() 
    10858 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10859 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10860 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10861 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10862 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10863  
    10864 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10865 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10866  
    10867 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10868 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10869 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10870  
    10871 See log for complete Python traceback. 
    10872  
    10873 Traceback (most recent call last): 
    10874 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10875 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10876 self._update_completion_state(False) 
    10877 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10878 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10879 _update_completion_state 
    10880 self._current_completion_state =
    10881 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10882 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10883 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10884 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10885 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10886 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10887 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10888 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10889 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10890 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10891 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10892 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10893 _complete_path_impl 
    10894 if _maybe_path.exists(): 
    10895 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10896 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10897 self.stat() 
    10898 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10899 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10900 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10901 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10902 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10903  
    10904 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10905 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10906  
    10907 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10908 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10909 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10910  
    10911 See log for complete Python traceback. 
    10912  
    10913 Traceback (most recent call last): 
    10914 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10915 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10916 self._update_completion_state(False) 
    10917 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10918 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10919 _update_completion_state 
    10920 self._current_completion_state =
    10921 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10922 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10923 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10924 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10925 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10926 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10927 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10928 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10929 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10930 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10931 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10932 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10933 _complete_path_impl 
    10934 if _maybe_path.exists(): 
    10935 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10936 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10937 self.stat() 
    10938 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10939 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10940 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10941 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10942 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10943  
    10944 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10945 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10946  
    10947 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10948 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10949 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10950  
    10951 See log for complete Python traceback. 
    10952  
    10953 Traceback (most recent call last): 
    10954 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10955 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10956 self._update_completion_state(False) 
    10957 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10958 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10959 _update_completion_state 
    10960 self._current_completion_state =
    10961 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    10962 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10963 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10964 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    10965 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    10966 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10967 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10968 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    10969 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    10970 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10971 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10972 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    10973 _complete_path_impl 
    10974 if _maybe_path.exists(): 
    10975 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10976 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    10977 self.stat() 
    10978 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10979 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10980 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10981 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10982 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10983  
    10984 OSError: [Errno 36] File name too long:
    10985 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    10986  
    10987 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    10988 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    10989 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    10990  
    10991 See log for complete Python traceback. 
    10992  
    10993 Traceback (most recent call last): 
    10994 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10995 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    10996 self._update_completion_state(False) 
    10997 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    10998 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    10999 _update_completion_state 
    11000 self._current_completion_state =
    11001 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11002 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11003 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11004 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11005 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11006 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11007 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11008 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11009 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11010 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11011 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11012 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11013 _complete_path_impl 
    11014 if _maybe_path.exists(): 
    11015 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11016 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11017 self.stat() 
    11018 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11019 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11020 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11021 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11022 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11023  
    11024 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11025 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11026  
    11027 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11028 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11029 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11030  
    11031 See log for complete Python traceback. 
    11032  
    11033 Traceback (most recent call last): 
    11034 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11035 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11036 self._update_completion_state(False) 
    11037 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11038 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11039 _update_completion_state 
    11040 self._current_completion_state =
    11041 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11042 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11043 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11044 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11045 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11046 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11047 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11048 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11049 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11050 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11051 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11052 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11053 _complete_path_impl 
    11054 if _maybe_path.exists(): 
    11055 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11056 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11057 self.stat() 
    11058 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11059 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11060 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11061 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11062 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11063  
    11064 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11065 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11066  
    11067 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11068 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11069 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11070  
    11071 See log for complete Python traceback. 
    11072  
    11073 Traceback (most recent call last): 
    11074 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11075 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11076 self._update_completion_state(False) 
    11077 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11078 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11079 _update_completion_state 
    11080 self._current_completion_state =
    11081 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11082 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11083 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11084 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11085 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11086 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11087 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11088 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11089 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11090 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11091 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11092 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11093 _complete_path_impl 
    11094 if _maybe_path.exists(): 
    11095 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11096 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11097 self.stat() 
    11098 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11099 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11100 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11101 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11102 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11103  
    11104 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11105 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11106  
    11107 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11108 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11109 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11110  
    11111 See log for complete Python traceback. 
    11112  
    11113 Traceback (most recent call last): 
    11114 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11115 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11116 self._update_completion_state(False) 
    11117 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11118 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11119 _update_completion_state 
    11120 self._current_completion_state =
    11121 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11122 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11123 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11124 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11125 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11126 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11127 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11128 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11129 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11130 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11131 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11132 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11133 _complete_path_impl 
    11134 if _maybe_path.exists(): 
    11135 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11136 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11137 self.stat() 
    11138 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11139 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11140 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11141 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11142 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11143  
    11144 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11145 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11146  
    11147 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11148 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11149 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11150  
    11151 See log for complete Python traceback. 
    11152  
    11153 Traceback (most recent call last): 
    11154 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11155 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11156 self._update_completion_state(False) 
    11157 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11158 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11159 _update_completion_state 
    11160 self._current_completion_state =
    11161 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11162 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11163 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11164 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11165 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11166 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11167 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11168 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11169 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11170 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11171 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11172 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11173 _complete_path_impl 
    11174 if _maybe_path.exists(): 
    11175 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11176 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11177 self.stat() 
    11178 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11179 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11180 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11181 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11182 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11183  
    11184 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11185 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11186  
    11187 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11188 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11189 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11190  
    11191 See log for complete Python traceback. 
    11192  
    11193 Traceback (most recent call last): 
    11194 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11195 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11196 self._update_completion_state(False) 
    11197 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11198 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11199 _update_completion_state 
    11200 self._current_completion_state =
    11201 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11202 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11203 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11204 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11205 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11206 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11207 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11208 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11209 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11210 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11211 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11212 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11213 _complete_path_impl 
    11214 if _maybe_path.exists(): 
    11215 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11216 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11217 self.stat() 
    11218 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11219 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11220 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11221 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11222 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11223  
    11224 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11225 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11226  
    11227 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11228 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11229 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11230  
    11231 See log for complete Python traceback. 
    11232  
    11233 Traceback (most recent call last): 
    11234 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11235 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11236 self._update_completion_state(False) 
    11237 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11238 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11239 _update_completion_state 
    11240 self._current_completion_state =
    11241 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11242 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11243 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11244 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11245 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11246 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11247 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11248 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11249 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11250 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11251 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11252 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11253 _complete_path_impl 
    11254 if _maybe_path.exists(): 
    11255 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11256 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11257 self.stat() 
    11258 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11259 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11260 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11261 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11262 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11263  
    11264 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11265 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11266  
    11267 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11268 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11269 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11270  
    11271 See log for complete Python traceback. 
    11272  
    11273 Traceback (most recent call last): 
    11274 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11275 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11276 self._update_completion_state(False) 
    11277 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11278 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11279 _update_completion_state 
    11280 self._current_completion_state =
    11281 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11282 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11283 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11284 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11285 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11286 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11287 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11288 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11289 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11290 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11291 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11292 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11293 _complete_path_impl 
    11294 if _maybe_path.exists(): 
    11295 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11296 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11297 self.stat() 
    11298 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11299 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11300 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11301 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11302 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11303  
    11304 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11305 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11306  
    11307 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11308 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11309 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11310  
    11311 See log for complete Python traceback. 
    11312  
    11313 Traceback (most recent call last): 
    11314 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11315 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11316 self._update_completion_state(False) 
    11317 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11318 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11319 _update_completion_state 
    11320 self._current_completion_state =
    11321 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11322 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11323 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11324 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11325 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11326 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11327 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11328 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11329 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11330 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11331 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11332 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11333 _complete_path_impl 
    11334 if _maybe_path.exists(): 
    11335 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11336 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11337 self.stat() 
    11338 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11339 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11340 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11341 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11342 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11343  
    11344 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11345 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11346  
    11347 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11348 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11349 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11350  
    11351 See log for complete Python traceback. 
    11352  
    11353 Traceback (most recent call last): 
    11354 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11355 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11356 self._update_completion_state(False) 
    11357 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11358 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11359 _update_completion_state 
    11360 self._current_completion_state =
    11361 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11362 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11363 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11364 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11365 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11366 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11367 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11368 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11369 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11370 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11371 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11372 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11373 _complete_path_impl 
    11374 if _maybe_path.exists(): 
    11375 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11376 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11377 self.stat() 
    11378 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11379 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11380 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11381 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11382 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11383  
    11384 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11385 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11386  
    11387 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11388 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11389 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11390  
    11391 See log for complete Python traceback. 
    11392  
    11393 Traceback (most recent call last): 
    11394 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11395 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11396 self._update_completion_state(False) 
    11397 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11398 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11399 _update_completion_state 
    11400 self._current_completion_state =
    11401 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11402 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11403 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11404 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11405 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11406 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11407 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11408 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11409 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11410 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11411 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11412 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11413 _complete_path_impl 
    11414 if _maybe_path.exists(): 
    11415 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11416 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11417 self.stat() 
    11418 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11419 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11420 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11421 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11422 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11423  
    11424 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11425 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11426  
    11427 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11428 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11429 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11430  
    11431 See log for complete Python traceback. 
    11432  
    11433 Traceback (most recent call last): 
    11434 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11435 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11436 self._update_completion_state(False) 
    11437 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11438 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11439 _update_completion_state 
    11440 self._current_completion_state =
    11441 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11442 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11443 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11444 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11445 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11446 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11447 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11448 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11449 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11450 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11451 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11452 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11453 _complete_path_impl 
    11454 if _maybe_path.exists(): 
    11455 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11456 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11457 self.stat() 
    11458 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11459 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11460 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11461 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11462 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11463  
    11464 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11465 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11466  
    11467 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11468 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11469 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11470  
    11471 See log for complete Python traceback. 
    11472  
    11473 Traceback (most recent call last): 
    11474 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11475 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11476 self._update_completion_state(False) 
    11477 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11478 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11479 _update_completion_state 
    11480 self._current_completion_state =
    11481 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11482 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11483 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11484 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11485 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11486 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11487 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11488 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11489 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11490 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11491 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11492 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11493 _complete_path_impl 
    11494 if _maybe_path.exists(): 
    11495 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11496 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11497 self.stat() 
    11498 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11499 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11500 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11501 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11502 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11503  
    11504 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11505 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11506  
    11507 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11508 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11509 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11510  
    11511 See log for complete Python traceback. 
    11512  
    11513 Traceback (most recent call last): 
    11514 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11515 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11516 self._update_completion_state(False) 
    11517 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11518 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11519 _update_completion_state 
    11520 self._current_completion_state =
    11521 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11522 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11523 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11524 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11525 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11526 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11527 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11528 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11529 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11530 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11531 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11532 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11533 _complete_path_impl 
    11534 if _maybe_path.exists(): 
    11535 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11536 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11537 self.stat() 
    11538 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11539 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11540 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11541 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11542 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11543  
    11544 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11545 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11546  
    11547 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11548 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11549 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11550  
    11551 See log for complete Python traceback. 
    11552  
    11553 Traceback (most recent call last): 
    11554 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11555 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11556 self._update_completion_state(False) 
    11557 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11558 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11559 _update_completion_state 
    11560 self._current_completion_state =
    11561 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11562 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11563 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11564 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11565 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11566 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11567 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11568 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11569 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11570 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11571 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11572 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11573 _complete_path_impl 
    11574 if _maybe_path.exists(): 
    11575 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11576 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11577 self.stat() 
    11578 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11579 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11580 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11581 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11582 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11583  
    11584 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11585 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11586  
    11587 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11588 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11589 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11590  
    11591 See log for complete Python traceback. 
    11592  
    11593 Traceback (most recent call last): 
    11594 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11595 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11596 self._update_completion_state(False) 
    11597 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11598 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11599 _update_completion_state 
    11600 self._current_completion_state =
    11601 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11602 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11603 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11604 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11605 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11606 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11607 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11608 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11609 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11610 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11611 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11612 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11613 _complete_path_impl 
    11614 if _maybe_path.exists(): 
    11615 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11616 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11617 self.stat() 
    11618 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11619 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11620 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11621 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11622 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11623  
    11624 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11625 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11626  
    11627 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11628 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11629 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11630  
    11631 See log for complete Python traceback. 
    11632  
    11633 Traceback (most recent call last): 
    11634 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11635 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11636 self._update_completion_state(False) 
    11637 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11638 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11639 _update_completion_state 
    11640 self._current_completion_state =
    11641 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11642 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11643 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11644 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11645 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11646 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11647 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11648 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11649 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11650 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11651 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11652 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11653 _complete_path_impl 
    11654 if _maybe_path.exists(): 
    11655 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11656 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11657 self.stat() 
    11658 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11659 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11660 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11661 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11662 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11663  
    11664 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11665 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11666  
    11667 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11668 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11669 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11670  
    11671 See log for complete Python traceback. 
    11672  
    11673 Traceback (most recent call last): 
    11674 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11675 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11676 self._update_completion_state(False) 
    11677 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11678 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11679 _update_completion_state 
    11680 self._current_completion_state =
    11681 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11682 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11683 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11684 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11685 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11686 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11687 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11688 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11689 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11690 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11691 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11692 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11693 _complete_path_impl 
    11694 if _maybe_path.exists(): 
    11695 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11696 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11697 self.stat() 
    11698 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11699 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11700 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11701 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11702 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11703  
    11704 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11705 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11706  
    11707 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11708 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11709 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11710  
    11711 See log for complete Python traceback. 
    11712  
    11713 Traceback (most recent call last): 
    11714 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11715 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11716 self._update_completion_state(False) 
    11717 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11718 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11719 _update_completion_state 
    11720 self._current_completion_state =
    11721 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11722 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11723 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11724 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11725 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11726 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11727 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11728 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11729 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11730 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11731 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11732 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11733 _complete_path_impl 
    11734 if _maybe_path.exists(): 
    11735 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11736 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11737 self.stat() 
    11738 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11739 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11740 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11741 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11742 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11743  
    11744 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11745 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11746  
    11747 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11748 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11749 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11750  
    11751 See log for complete Python traceback. 
    11752  
    11753 Traceback (most recent call last): 
    11754 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11755 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11756 self._update_completion_state(False) 
    11757 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11758 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11759 _update_completion_state 
    11760 self._current_completion_state =
    11761 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11762 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11763 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11764 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11765 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11766 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11767 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11768 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11769 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11770 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11771 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11772 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11773 _complete_path_impl 
    11774 if _maybe_path.exists(): 
    11775 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11776 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11777 self.stat() 
    11778 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11779 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11780 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11781 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11782 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11783  
    11784 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11785 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11786  
    11787 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11788 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11789 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11790  
    11791 See log for complete Python traceback. 
    11792  
    11793 Traceback (most recent call last): 
    11794 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11795 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11796 self._update_completion_state(False) 
    11797 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11798 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11799 _update_completion_state 
    11800 self._current_completion_state =
    11801 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11802 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11803 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11804 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11805 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11806 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11807 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11808 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11809 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11810 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11811 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11812 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11813 _complete_path_impl 
    11814 if _maybe_path.exists(): 
    11815 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11816 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11817 self.stat() 
    11818 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11819 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11820 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11821 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11822 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11823  
    11824 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11825 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11826  
    11827 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11828 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11829 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11830  
    11831 See log for complete Python traceback. 
    11832  
    11833 Traceback (most recent call last): 
    11834 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11835 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11836 self._update_completion_state(False) 
    11837 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11838 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11839 _update_completion_state 
    11840 self._current_completion_state =
    11841 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11842 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11843 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11844 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11845 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11846 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11847 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11848 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11849 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11850 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11851 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11852 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11853 _complete_path_impl 
    11854 if _maybe_path.exists(): 
    11855 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11856 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11857 self.stat() 
    11858 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11859 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11860 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11861 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11862 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11863  
    11864 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11865 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11866  
    11867 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11868 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11869 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11870  
    11871 See log for complete Python traceback. 
    11872  
    11873 Traceback (most recent call last): 
    11874 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11875 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11876 self._update_completion_state(False) 
    11877 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11878 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11879 _update_completion_state 
    11880 self._current_completion_state =
    11881 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11882 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11883 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11884 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11885 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11886 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11887 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11888 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11889 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11890 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11891 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11892 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11893 _complete_path_impl 
    11894 if _maybe_path.exists(): 
    11895 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11896 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11897 self.stat() 
    11898 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11899 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11900 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11901 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11902 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11903  
    11904 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11905 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11906  
    11907 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11908 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11909 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11910  
    11911 See log for complete Python traceback. 
    11912  
    11913 Traceback (most recent call last): 
    11914 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11915 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11916 self._update_completion_state(False) 
    11917 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11918 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11919 _update_completion_state 
    11920 self._current_completion_state =
    11921 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11922 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11923 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11924 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11925 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11926 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11927 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11928 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11929 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11930 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11931 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11932 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11933 _complete_path_impl 
    11934 if _maybe_path.exists(): 
    11935 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11936 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11937 self.stat() 
    11938 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11939 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11940 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11941 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11942 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11943  
    11944 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11945 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11946  
    11947 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11948 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11949 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11950  
    11951 See log for complete Python traceback. 
    11952  
    11953 Traceback (most recent call last): 
    11954 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11955 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11956 self._update_completion_state(False) 
    11957 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11958 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11959 _update_completion_state 
    11960 self._current_completion_state =
    11961 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    11962 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11963 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11964 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    11965 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    11966 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11967 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11968 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    11969 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    11970 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11971 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11972 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    11973 _complete_path_impl 
    11974 if _maybe_path.exists(): 
    11975 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11976 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    11977 self.stat() 
    11978 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11979 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11980 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11981 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11982 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11983  
    11984 OSError: [Errno 36] File name too long:
    11985 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    11986  
    11987 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    11988 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    11989 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    11990  
    11991 See log for complete Python traceback. 
    11992  
    11993 Traceback (most recent call last): 
    11994 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11995 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    11996 self._update_completion_state(False) 
    11997 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    11998 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    11999 _update_completion_state 
    12000 self._current_completion_state =
    12001 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12002 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12003 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12004 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12005 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12006 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12007 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12008 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12009 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12010 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12011 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12012 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12013 _complete_path_impl 
    12014 if _maybe_path.exists(): 
    12015 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12016 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12017 self.stat() 
    12018 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12019 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12020 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12021 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12022 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12023  
    12024 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12025 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12026  
    12027 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12028 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12029 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12030  
    12031 See log for complete Python traceback. 
    12032  
    12033 Traceback (most recent call last): 
    12034 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12035 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12036 self._update_completion_state(False) 
    12037 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12038 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12039 _update_completion_state 
    12040 self._current_completion_state =
    12041 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12042 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12043 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12044 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12045 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12046 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12047 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12048 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12049 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12050 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12051 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12052 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12053 _complete_path_impl 
    12054 if _maybe_path.exists(): 
    12055 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12056 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12057 self.stat() 
    12058 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12059 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12060 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12061 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12062 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12063  
    12064 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12065 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12066  
    12067 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12068 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12069 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12070  
    12071 See log for complete Python traceback. 
    12072  
    12073 Traceback (most recent call last): 
    12074 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12075 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12076 self._update_completion_state(False) 
    12077 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12078 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12079 _update_completion_state 
    12080 self._current_completion_state =
    12081 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12082 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12083 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12084 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12085 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12086 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12087 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12088 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12089 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12090 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12091 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12092 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12093 _complete_path_impl 
    12094 if _maybe_path.exists(): 
    12095 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12096 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12097 self.stat() 
    12098 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12099 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12100 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12101 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12102 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12103  
    12104 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12105 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12106  
    12107 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12108 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12109 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12110  
    12111 See log for complete Python traceback. 
    12112  
    12113 Traceback (most recent call last): 
    12114 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12115 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12116 self._update_completion_state(False) 
    12117 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12118 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12119 _update_completion_state 
    12120 self._current_completion_state =
    12121 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12122 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12123 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12124 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12125 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12126 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12127 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12128 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12129 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12130 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12131 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12132 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12133 _complete_path_impl 
    12134 if _maybe_path.exists(): 
    12135 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12136 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12137 self.stat() 
    12138 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12139 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12140 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12141 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12142 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12143  
    12144 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12145 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12146  
    12147 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12148 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12149 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12150  
    12151 See log for complete Python traceback. 
    12152  
    12153 Traceback (most recent call last): 
    12154 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12155 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12156 self._update_completion_state(False) 
    12157 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12158 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12159 _update_completion_state 
    12160 self._current_completion_state =
    12161 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12162 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12163 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12164 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12165 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12166 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12167 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12168 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12169 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12170 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12171 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12172 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12173 _complete_path_impl 
    12174 if _maybe_path.exists(): 
    12175 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12176 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12177 self.stat() 
    12178 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12179 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12180 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12181 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12182 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12183  
    12184 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12185 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12186  
    12187 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12188 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12189 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12190  
    12191 See log for complete Python traceback. 
    12192  
    12193 Traceback (most recent call last): 
    12194 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12195 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12196 self._update_completion_state(False) 
    12197 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12198 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12199 _update_completion_state 
    12200 self._current_completion_state =
    12201 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12202 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12203 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12204 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12205 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12206 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12207 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12208 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12209 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12210 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12211 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12212 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12213 _complete_path_impl 
    12214 if _maybe_path.exists(): 
    12215 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12216 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12217 self.stat() 
    12218 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12219 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12220 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12221 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12222 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12223  
    12224 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12225 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12226  
    12227 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12228 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12229 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12230  
    12231 See log for complete Python traceback. 
    12232  
    12233 Traceback (most recent call last): 
    12234 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12235 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12236 self._update_completion_state(False) 
    12237 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12238 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12239 _update_completion_state 
    12240 self._current_completion_state =
    12241 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12242 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12243 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12244 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12245 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12246 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12247 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12248 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12249 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12250 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12251 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12252 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12253 _complete_path_impl 
    12254 if _maybe_path.exists(): 
    12255 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12256 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12257 self.stat() 
    12258 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12259 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12260 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12261 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12262 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12263  
    12264 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12265 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12266  
    12267 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12268 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12269 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12270  
    12271 See log for complete Python traceback. 
    12272  
    12273 Traceback (most recent call last): 
    12274 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12275 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12276 self._update_completion_state(False) 
    12277 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12278 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12279 _update_completion_state 
    12280 self._current_completion_state =
    12281 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12282 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12283 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12284 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12285 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12286 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12287 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12288 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12289 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12290 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12291 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12292 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12293 _complete_path_impl 
    12294 if _maybe_path.exists(): 
    12295 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12296 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12297 self.stat() 
    12298 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12299 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12300 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12301 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12302 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12303  
    12304 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12305 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12306  
    12307 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12308 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12309 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12310  
    12311 See log for complete Python traceback. 
    12312  
    12313 Traceback (most recent call last): 
    12314 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12315 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12316 self._update_completion_state(False) 
    12317 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12318 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12319 _update_completion_state 
    12320 self._current_completion_state =
    12321 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12322 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12323 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12324 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12325 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12326 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12327 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12328 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12329 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12330 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12331 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12332 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12333 _complete_path_impl 
    12334 if _maybe_path.exists(): 
    12335 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12336 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12337 self.stat() 
    12338 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12339 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12340 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12341 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12342 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12343  
    12344 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12345 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12346  
    12347 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12348 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12349 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12350  
    12351 See log for complete Python traceback. 
    12352  
    12353 Traceback (most recent call last): 
    12354 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12355 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12356 self._update_completion_state(False) 
    12357 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12358 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12359 _update_completion_state 
    12360 self._current_completion_state =
    12361 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12362 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12363 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12364 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12365 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12366 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12367 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12368 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12369 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12370 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12371 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12372 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12373 _complete_path_impl 
    12374 if _maybe_path.exists(): 
    12375 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12376 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12377 self.stat() 
    12378 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12379 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12380 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12381 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12382 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12383  
    12384 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12385 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12386  
    12387 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12388 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12389 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12390  
    12391 See log for complete Python traceback. 
    12392  
    12393 Traceback (most recent call last): 
    12394 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12395 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12396 self._update_completion_state(False) 
    12397 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12398 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12399 _update_completion_state 
    12400 self._current_completion_state =
    12401 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12402 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12403 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12404 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12405 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12406 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12407 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12408 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12409 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12410 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12411 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12412 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12413 _complete_path_impl 
    12414 if _maybe_path.exists(): 
    12415 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12416 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12417 self.stat() 
    12418 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12419 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12420 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12421 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12422 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12423  
    12424 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12425 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12426  
    12427 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12428 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12429 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12430  
    12431 See log for complete Python traceback. 
    12432  
    12433 Traceback (most recent call last): 
    12434 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12435 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12436 self._update_completion_state(False) 
    12437 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12438 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12439 _update_completion_state 
    12440 self._current_completion_state =
    12441 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12442 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12443 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12444 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12445 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12446 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12447 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12448 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12449 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12450 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12451 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12452 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12453 _complete_path_impl 
    12454 if _maybe_path.exists(): 
    12455 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12456 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12457 self.stat() 
    12458 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12459 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12460 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12461 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12462 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12463  
    12464 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12465 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12466  
    12467 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12468 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12469 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12470  
    12471 See log for complete Python traceback. 
    12472  
    12473 Traceback (most recent call last): 
    12474 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12475 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12476 self._update_completion_state(False) 
    12477 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12478 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12479 _update_completion_state 
    12480 self._current_completion_state =
    12481 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12482 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12483 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12484 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12485 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12486 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12487 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12488 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12489 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12490 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12491 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12492 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12493 _complete_path_impl 
    12494 if _maybe_path.exists(): 
    12495 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12496 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12497 self.stat() 
    12498 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12499 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12500 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12501 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12502 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12503  
    12504 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12505 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12506  
    12507 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12508 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12509 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12510  
    12511 See log for complete Python traceback. 
    12512  
    12513 Traceback (most recent call last): 
    12514 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12515 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12516 self._update_completion_state(False) 
    12517 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12518 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12519 _update_completion_state 
    12520 self._current_completion_state =
    12521 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12522 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12523 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12524 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12525 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12526 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12527 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12528 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12529 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12530 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12531 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12532 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12533 _complete_path_impl 
    12534 if _maybe_path.exists(): 
    12535 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12536 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12537 self.stat() 
    12538 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12539 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12540 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12541 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12542 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12543  
    12544 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12545 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12546  
    12547 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12548 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12549 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12550  
    12551 See log for complete Python traceback. 
    12552  
    12553 Traceback (most recent call last): 
    12554 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12555 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12556 self._update_completion_state(False) 
    12557 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12558 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12559 _update_completion_state 
    12560 self._current_completion_state =
    12561 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12562 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12563 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12564 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12565 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12566 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12567 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12568 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12569 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12570 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12571 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12572 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12573 _complete_path_impl 
    12574 if _maybe_path.exists(): 
    12575 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12576 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12577 self.stat() 
    12578 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12579 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12580 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12581 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12582 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12583  
    12584 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12585 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12586  
    12587 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12588 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12589 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12590  
    12591 See log for complete Python traceback. 
    12592  
    12593 Traceback (most recent call last): 
    12594 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12595 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12596 self._update_completion_state(False) 
    12597 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12598 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12599 _update_completion_state 
    12600 self._current_completion_state =
    12601 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12602 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12603 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12604 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12605 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12606 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12607 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12608 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12609 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12610 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12611 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12612 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12613 _complete_path_impl 
    12614 if _maybe_path.exists(): 
    12615 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12616 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12617 self.stat() 
    12618 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12619 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12620 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12621 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12622 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12623  
    12624 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12625 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12626  
    12627 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12628 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12629 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12630  
    12631 See log for complete Python traceback. 
    12632  
    12633 Traceback (most recent call last): 
    12634 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12635 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12636 self._update_completion_state(False) 
    12637 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12638 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12639 _update_completion_state 
    12640 self._current_completion_state =
    12641 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12642 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12643 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12644 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12645 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12646 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12647 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12648 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12649 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12650 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12651 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12652 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12653 _complete_path_impl 
    12654 if _maybe_path.exists(): 
    12655 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12656 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12657 self.stat() 
    12658 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12659 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12660 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12661 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12662 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12663  
    12664 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12665 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12666  
    12667 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12668 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12669 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12670  
    12671 See log for complete Python traceback. 
    12672  
    12673 Traceback (most recent call last): 
    12674 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12675 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12676 self._update_completion_state(False) 
    12677 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12678 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12679 _update_completion_state 
    12680 self._current_completion_state =
    12681 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12682 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12683 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12684 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12685 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12686 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12687 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12688 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12689 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12690 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12691 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12692 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12693 _complete_path_impl 
    12694 if _maybe_path.exists(): 
    12695 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12696 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12697 self.stat() 
    12698 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12699 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12700 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12701 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12702 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12703  
    12704 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12705 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12706  
    12707 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12708 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12709 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12710  
    12711 See log for complete Python traceback. 
    12712  
    12713 Traceback (most recent call last): 
    12714 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12715 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12716 self._update_completion_state(False) 
    12717 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12718 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12719 _update_completion_state 
    12720 self._current_completion_state =
    12721 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12722 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12723 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12724 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12725 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12726 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12727 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12728 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12729 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12730 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12731 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12732 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12733 _complete_path_impl 
    12734 if _maybe_path.exists(): 
    12735 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12736 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12737 self.stat() 
    12738 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12739 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12740 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12741 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12742 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12743  
    12744 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12745 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12746  
    12747 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12748 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12749 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12750  
    12751 See log for complete Python traceback. 
    12752  
    12753 Traceback (most recent call last): 
    12754 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12755 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12756 self._update_completion_state(False) 
    12757 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12758 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12759 _update_completion_state 
    12760 self._current_completion_state =
    12761 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12762 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12763 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12764 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12765 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12766 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12767 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12768 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12769 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12770 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12771 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12772 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12773 _complete_path_impl 
    12774 if _maybe_path.exists(): 
    12775 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12776 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12777 self.stat() 
    12778 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12779 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12780 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12781 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12782 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12783  
    12784 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12785 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12786  
    12787 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12788 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12789 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12790  
    12791 See log for complete Python traceback. 
    12792  
    12793 Traceback (most recent call last): 
    12794 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12795 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12796 self._update_completion_state(False) 
    12797 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12798 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12799 _update_completion_state 
    12800 self._current_completion_state =
    12801 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12802 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12803 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12804 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12805 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12806 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12807 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12808 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12809 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12810 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12811 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12812 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12813 _complete_path_impl 
    12814 if _maybe_path.exists(): 
    12815 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12816 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12817 self.stat() 
    12818 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12819 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12820 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12821 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12822 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12823  
    12824 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12825 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12826  
    12827 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12828 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12829 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12830  
    12831 See log for complete Python traceback. 
    12832  
    12833 Traceback (most recent call last): 
    12834 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12835 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12836 self._update_completion_state(False) 
    12837 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12838 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12839 _update_completion_state 
    12840 self._current_completion_state =
    12841 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12842 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12843 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12844 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12845 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12846 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12847 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12848 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12849 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12850 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12851 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12852 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12853 _complete_path_impl 
    12854 if _maybe_path.exists(): 
    12855 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12856 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12857 self.stat() 
    12858 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12859 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12860 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12861 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12862 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12863  
    12864 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12865 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12866  
    12867 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12868 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12869 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12870  
    12871 See log for complete Python traceback. 
    12872  
    12873 Traceback (most recent call last): 
    12874 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12875 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12876 self._update_completion_state(False) 
    12877 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12878 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12879 _update_completion_state 
    12880 self._current_completion_state =
    12881 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12882 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12883 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12884 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12885 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12886 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12887 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12888 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12889 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12890 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12891 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12892 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12893 _complete_path_impl 
    12894 if _maybe_path.exists(): 
    12895 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12896 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12897 self.stat() 
    12898 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12899 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12900 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12901 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12902 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12903  
    12904 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12905 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12906  
    12907 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12908 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12909 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12910  
    12911 See log for complete Python traceback. 
    12912  
    12913 Traceback (most recent call last): 
    12914 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12915 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12916 self._update_completion_state(False) 
    12917 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12918 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12919 _update_completion_state 
    12920 self._current_completion_state =
    12921 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12922 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12923 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12924 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12925 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12926 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12927 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12928 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12929 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12930 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12931 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12932 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12933 _complete_path_impl 
    12934 if _maybe_path.exists(): 
    12935 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12936 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12937 self.stat() 
    12938 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12939 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12940 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12941 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12942 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12943  
    12944 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12945 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12946  
    12947 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12948 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12949 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12950  
    12951 See log for complete Python traceback. 
    12952  
    12953 Traceback (most recent call last): 
    12954 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12955 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12956 self._update_completion_state(False) 
    12957 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12958 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12959 _update_completion_state 
    12960 self._current_completion_state =
    12961 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    12962 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12963 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12964 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    12965 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    12966 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12967 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12968 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    12969 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    12970 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12971 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12972 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    12973 _complete_path_impl 
    12974 if _maybe_path.exists(): 
    12975 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12976 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    12977 self.stat() 
    12978 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12979 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12980 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12981 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12982 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12983  
    12984 OSError: [Errno 36] File name too long:
    12985 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    12986  
    12987 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    12988 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    12989 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    12990  
    12991 See log for complete Python traceback. 
    12992  
    12993 Traceback (most recent call last): 
    12994 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12995 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    12996 self._update_completion_state(False) 
    12997 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    12998 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    12999 _update_completion_state 
    13000 self._current_completion_state =
    13001 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13002 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13003 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13004 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13005 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13006 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13007 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13008 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13009 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13010 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13011 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13012 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13013 _complete_path_impl 
    13014 if _maybe_path.exists(): 
    13015 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13016 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13017 self.stat() 
    13018 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13019 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13020 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13021 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13022 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13023  
    13024 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13025 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13026  
    13027 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13028 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13029 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13030  
    13031 See log for complete Python traceback. 
    13032  
    13033 Traceback (most recent call last): 
    13034 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13035 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13036 self._update_completion_state(False) 
    13037 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13038 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13039 _update_completion_state 
    13040 self._current_completion_state =
    13041 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13042 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13043 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13044 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13045 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13046 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13047 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13048 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13049 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13050 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13051 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13052 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13053 _complete_path_impl 
    13054 if _maybe_path.exists(): 
    13055 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13056 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13057 self.stat() 
    13058 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13059 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13060 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13061 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13062 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13063  
    13064 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13065 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13066  
    13067 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13068 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13069 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13070  
    13071 See log for complete Python traceback. 
    13072  
    13073 Traceback (most recent call last): 
    13074 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13075 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13076 self._update_completion_state(False) 
    13077 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13078 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13079 _update_completion_state 
    13080 self._current_completion_state =
    13081 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13082 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13083 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13084 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13085 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13086 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13087 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13088 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13089 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13090 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13091 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13092 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13093 _complete_path_impl 
    13094 if _maybe_path.exists(): 
    13095 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13096 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13097 self.stat() 
    13098 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13099 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13100 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13101 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13102 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13103  
    13104 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13105 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13106  
    13107 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13108 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13109 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13110  
    13111 See log for complete Python traceback. 
    13112  
    13113 Traceback (most recent call last): 
    13114 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13115 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13116 self._update_completion_state(False) 
    13117 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13118 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13119 _update_completion_state 
    13120 self._current_completion_state =
    13121 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13122 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13123 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13124 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13125 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13126 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13127 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13128 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13129 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13130 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13131 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13132 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13133 _complete_path_impl 
    13134 if _maybe_path.exists(): 
    13135 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13136 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13137 self.stat() 
    13138 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13139 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13140 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13141 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13142 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13143  
    13144 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13145 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13146  
    13147 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13148 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13149 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13150  
    13151 See log for complete Python traceback. 
    13152  
    13153 Traceback (most recent call last): 
    13154 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13155 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13156 self._update_completion_state(False) 
    13157 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13158 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13159 _update_completion_state 
    13160 self._current_completion_state =
    13161 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13162 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13163 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13164 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13165 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13166 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13167 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13168 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13169 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13170 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13171 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13172 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13173 _complete_path_impl 
    13174 if _maybe_path.exists(): 
    13175 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13176 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13177 self.stat() 
    13178 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13179 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13180 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13181 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13182 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13183  
    13184 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13185 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13186  
    13187 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13188 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13189 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13190  
    13191 See log for complete Python traceback. 
    13192  
    13193 Traceback (most recent call last): 
    13194 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13195 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13196 self._update_completion_state(False) 
    13197 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13198 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13199 _update_completion_state 
    13200 self._current_completion_state =
    13201 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13202 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13203 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13204 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13205 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13206 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13207 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13208 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13209 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13210 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13211 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13212 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13213 _complete_path_impl 
    13214 if _maybe_path.exists(): 
    13215 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13216 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13217 self.stat() 
    13218 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13219 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13220 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13221 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13222 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13223  
    13224 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13225 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13226  
    13227 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13228 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13229 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13230  
    13231 See log for complete Python traceback. 
    13232  
    13233 Traceback (most recent call last): 
    13234 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13235 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13236 self._update_completion_state(False) 
    13237 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13238 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13239 _update_completion_state 
    13240 self._current_completion_state =
    13241 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13242 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13243 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13244 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13245 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13246 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13247 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13248 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13249 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13250 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13251 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13252 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13253 _complete_path_impl 
    13254 if _maybe_path.exists(): 
    13255 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13256 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13257 self.stat() 
    13258 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13259 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13260 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13261 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13262 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13263  
    13264 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13265 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13266  
    13267 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13268 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13269 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13270  
    13271 See log for complete Python traceback. 
    13272  
    13273 Traceback (most recent call last): 
    13274 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13275 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13276 self._update_completion_state(False) 
    13277 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13278 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13279 _update_completion_state 
    13280 self._current_completion_state =
    13281 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13282 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13283 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13284 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13285 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13286 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13287 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13288 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13289 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13290 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13291 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13292 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13293 _complete_path_impl 
    13294 if _maybe_path.exists(): 
    13295 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13296 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13297 self.stat() 
    13298 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13299 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13300 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13301 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13302 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13303  
    13304 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13305 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13306  
    13307 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13308 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13309 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13310  
    13311 See log for complete Python traceback. 
    13312  
    13313 Traceback (most recent call last): 
    13314 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13315 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13316 self._update_completion_state(False) 
    13317 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13318 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13319 _update_completion_state 
    13320 self._current_completion_state =
    13321 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13322 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13323 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13324 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13325 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13326 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13327 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13328 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13329 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13330 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13331 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13332 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13333 _complete_path_impl 
    13334 if _maybe_path.exists(): 
    13335 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13336 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13337 self.stat() 
    13338 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13339 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13340 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13341 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13342 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13343  
    13344 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13345 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13346  
    13347 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13348 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13349 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13350  
    13351 See log for complete Python traceback. 
    13352  
    13353 Traceback (most recent call last): 
    13354 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13355 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13356 self._update_completion_state(False) 
    13357 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13358 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13359 _update_completion_state 
    13360 self._current_completion_state =
    13361 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13362 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13363 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13364 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13365 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13366 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13367 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13368 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13369 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13370 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13371 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13372 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13373 _complete_path_impl 
    13374 if _maybe_path.exists(): 
    13375 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13376 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13377 self.stat() 
    13378 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13379 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13380 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13381 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13382 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13383  
    13384 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13385 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13386  
    13387 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13388 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13389 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13390  
    13391 See log for complete Python traceback. 
    13392  
    13393 Traceback (most recent call last): 
    13394 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13395 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13396 self._update_completion_state(False) 
    13397 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13398 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13399 _update_completion_state 
    13400 self._current_completion_state =
    13401 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13402 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13403 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13404 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13405 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13406 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13407 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13408 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13409 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13410 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13411 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13412 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13413 _complete_path_impl 
    13414 if _maybe_path.exists(): 
    13415 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13416 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13417 self.stat() 
    13418 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13419 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13420 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13421 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13422 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13423  
    13424 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13425 '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13426  
    13427 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13428 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13429 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13430  
    13431 See log for complete Python traceback. 
    13432  
    13433 Traceback (most recent call last): 
    13434 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13435 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13436 self._update_completion_state(False) 
    13437 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13438 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13439 _update_completion_state 
    13440 self._current_completion_state =
    13441 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13442 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13443 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13444 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13445 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13446 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13447 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13448 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13449 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13450 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13451 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13452 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13453 _complete_path_impl 
    13454 if _maybe_path.exists(): 
    13455 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13456 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13457 self.stat() 
    13458 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13459 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13460 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13461 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13462 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13463  
    13464 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13465 '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
    13466  
    13467 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13468 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13469 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13470  
    13471 See log for complete Python traceback. 
    13472  
    13473 Traceback (most recent call last): 
    13474 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13475 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed 
    13476 self._update_completion_state(False) 
    13477 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13478 packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in
    13479 _update_completion_state 
    13480 self._current_completion_state =
    13481 list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) 
    13482 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13483 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13484 packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list 
    13485 if state := complete_path(last_word, current_command): 
    13486 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13487 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13488 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path 
    13489 if completions := _complete_path_impl(last_word): 
    13490 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13491 File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site-
    13492 packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in
    13493 _complete_path_impl 
    13494 if _maybe_path.exists(): 
    13495 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13496 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists 
    13497 self.stat() 
    13498 File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat 
    13499 return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) 
    13500 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ 
    13501 OSError: [Errno 36] File name too long:
    13502 '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' 
     4820[deleted to fit within ticket limits]
     4821
    135034822 
    135044823OSError: [Errno 36] File name too long: