<div dir="ltr">Dear ChimeraX Users,<br><div><br></div><div>There is this AlphaFold prediction: <a href="https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/P02549">https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/P02549</a>. And we know this protein should be more or less in a rod-like shape rather than a globular shape: <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Spectrin">https://en.wikipedia.org/wiki/Spectrin</a> and related literature such as <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3218374/">https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3218374/</a>. I wonder is there a way that we can pull the two ends of the predicted structure while maintaining the secondary structures, mostly alpha-helices in this case, inside ChimeraX? </div><div><br></div><div>I am quite new to ChimeraX. I understand this is more fitted to an MD simulation. But I got to know there are options to fit a PDB to a density map. So I wondered if this can be achieved in ChimeraX. </div><div><br></div><div>Best,</div><div>Roden</div></div>

<br>
<div><hr></div><font face="Arial" size="1">This message and its contents, including attachments are intended solely for the original recipient. If you are not the intended recipient or have received this message in error, please notify me immediately and delete this message from your computer system. Any unauthorized use or distribution is prohibited. Please consider the environment before printing this email.</font>