<div>Hi all！</div><div><br></div><div>I can’t install the plugin isolde using command 'toolshed install isolde'.</div><div><br></div><div>Looking in indexes: https://pypi.org/simple, https://cxtoolshed.rbvi.ucsf.edu/pypi/ Requirement already satisfied: ChimeraX-ISOLDE==1.2.2 in c:\users\dell\appdata\local\ucsf\chimerax\1.2\site-packages (1.2.2) Requirement already satisfied: ChimeraX-AtomicLibrary~=3.1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (3.1.3) Requirement already satisfied: ChimeraX-Core~=1.2.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.2.5) Requirement already satisfied: ChimeraX-Arrays~=1.0.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.0) Requirement already satisfied: ChimeraX-Clipper~=0.16.0 in c:\users\dell\appdata\local\ucsf\chimerax\1.2\site-packages (from ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (0.16.0) Requirement already satisfied: ChimeraX-Atomic~=1.13.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.13.2) Requirement already satisfied: ChimeraX-Nucleotides~=2.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (2.0.1) Requirement already satisfied: ChimeraX-mmCIF~=2.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (2.3) Requirement already satisfied: ChimeraX-ConnectStructure~=2.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (2.0) Requirement already satisfied: ChimeraX-Geometry~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.1) Requirement already satisfied: ChimeraX-Graphics~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.0) Requirement already satisfied: ChimeraX-PDB~=2.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (2.4.1) Requirement already satisfied: ChimeraX-AtomSearchLibrary~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-ConnectStructure~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.0) Requirement already satisfied: ChimeraX-DataFormats~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-mmCIF~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.1) Requirement already satisfied: ChimeraX-OpenCommand~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-mmCIF~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.5) Requirement already satisfied: ChimeraX-PDBLibrary~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-mmCIF~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.0.1) Requirement already satisfied: ChimeraX-SaveCommand~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-mmCIF~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.4) Requirement already satisfied: ChimeraX-IO~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-DataFormats~=1.0->ChimeraX-mmCIF~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.0.1) Requirement already satisfied: ChimeraX-Surface~=1.0 in c:\program files\chimerax\bin\lib\site-packages (from ChimeraX-Nucleotides~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.0) Requirement already satisfied: ChimeraX-UI~=1.0 in c:\users\dell\appdata\local\ucsf\chimerax\1.2\site-packages (from ChimeraX-Nucleotides~=2.0->ChimeraX-Atomic~=1.13.0->ChimeraX-ISOLDE==1.2.2) (1.2.1) INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-pdblibrary to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-pdb to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-opencommand to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-nucleotides to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-io to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-dataformats to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-mmcif to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-graphics to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-geometry to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-core to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-atomsearchlibrary to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-connectstructure to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-clipper to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-atomiclibrary to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-atomic to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-arrays to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. INFO: pip is looking at multiple versions of chimerax-isolde to determine which version is compatible with other requirements. This could take a while. </div><div><br></div><div>The conflict is caused by: chimerax-nucleotides 2.0.1 depends on ChimeraX-UI~=1.0 chimerax-opencommand 1.5 depends on ChimeraX-UI~=1.0 chimerax-savecommand 1.4 depends on ChimeraX-UI~=1.4 </div><div><br></div><div>To fix this you could try to: 1. loosen the range of package versions you've specified 2. remove package versions to allow pip attempt to solve the dependency conflict ERROR: Cannot install chimerax-nucleotides==2.0.1, chimerax-opencommand==1.5 and chimerax-savecommand==1.4 because these package versions have conflicting dependencies. ERROR: ResolutionImpossible: for help visit https://pip.pypa.io/en/latest/user_guide/#fixing-conflicting-dependencies WARNING: You are using pip version 21.0.1; however, version 21.2.4 is available. You should consider upgrading via the 'C:\Program Files\ChimeraX\bin\ChimeraX.exe -m pip install --upgrade pip' command.</div><div><br></div><div><pre style="white-space: pre-wrap;">Thanks,
Haijing Ben</pre></div>