<div dir="ltr"><div>Hi Tom,</div><div><br></div><div>Thanks for your answer. You're right, the error arises from some text labels I didn't delete.</div><div><br></div><div>Best regards,<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">El mié, 8 sept 2021 a las 20:24, Tom Goddard (<<a href="mailto:goddard@sonic.net">goddard@sonic.net</a>>) escribió:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div style="overflow-wrap: break-word;"><div>Hi Diego,</div><div><br></div>Saving an STL file should not give that error, and when I test it with --nogui --script it does not give this error.  What does give that error is when you try to save an image when you have text labels in the graphics because it needs the graphical interface to get fonts.<div><br></div><div>If this does not explain your error use ChimeraX Help / Report a Bug and attach your python script.<br><div><div><br></div><div><span style="white-space:pre-wrap">    </span>Tom<br><div><br></div><div>Here was my test code</div><div><br></div><div><div>from chimerax.core.commands import run</div><div>run(session, 'open 1a0m')</div><div>run(session, 'molmap #1 5')</div><div>run(session, 'close #1')</div><div>run(session, 'save test.stl')</div><div><br></div><div><br></div><blockquote type="cite"><div>On Sep 8, 2021, at 7:59 AM, Diego Amaya via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:</div><br><div><div dir="ltr"><div>Hi,</div><div><br></div><div>I'm running a python script in --nogui and --script mode and I'm getting an error when doing rc(session, 'save surface.stl format stl'). The error message is :</div><div><br></div><div></div><div><i>QGuiApplication::font(): no QGuiApplication instance and no application font set.<br>Segmentation fault</i></div><div><br></div><div>I'm working with debian 10 and I used the production release 1.2.5-1 <br></div><div><br></div><div>Thanks in advance for the help.<br></div><div><br>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr">Diego A. Amaya Ramírez</div></div></div></div>

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<b style="color:rgb(34,34,34);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:14.6667px;font-style:normal;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><span style="font-size:6.5pt;line-height:9.96667px;font-family:"Ancizar Sans",sans-serif">Aviso legal:</span></b><span style="font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);font-size:6.5pt;line-height:9.96667px;font-family:"Ancizar Sans",sans-serif"> El contenido de este mensaje y los archivos adjuntos son confidenciales y de uso exclusivo de la Universidad Nacional de Colombia. Se encuentran dirigidos sólo para el uso del destinatario al cual van enviados. La reproducción, lectura y/o copia se encuentran prohibidas a cualquier persona diferente a este y puede ser ilegal. Si usted lo ha recibido por error, infórmenos y elimínelo de su correo. Los Datos Personales serán tratados conforme a la Ley 1581 de 2012 y a nuestra Política de Datos Personales que podrá consultar en la página web </span><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Calibri,sans-serif;font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);font-size:6.5pt;line-height:9.96667px"><a href="http://www.unal.edu.co/" style="color:blue" target="_blank"><span style="font-family:"Ancizar Sans",sans-serif">www.unal.edu.co</span></a></span><span style="font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);font-size:6.5pt;line-height:9.96667px;font-family:"Ancizar Sans",sans-serif">.<u><span> </span></u>Las opiniones, informaciones, conclusiones y cualquier otro tipo de dato contenido en este correo electrónico, no relacionados con la actividad de la Universidad Nacional de Colombia, se entenderá como personales y de ninguna manera son avaladas por la Universidad.</span><br><span style="color:rgb(245,132,111);font-family:ClearSans-Regular,Arial,Verdana,Helvetica,sans-serif;font-size:14px;font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:left;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);display:inline;float:none"><span></span></span><span style="color:rgb(245,132,111);font-family:ClearSans-Regular,Arial,Verdana,Helvetica,sans-serif;font-size:14px;font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:left;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);display:inline;float:none"><span></span></span>_______________________________________________<br>ChimeraX-users mailing list<br><a href="mailto:ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu</a><br>Manage subscription:<br><a href="https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users" target="_blank">https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users</a><br></div></blockquote></div><br></div></div></div></div></blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr">Diego A. Amaya Ramírez</div></div>

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<b style="color:rgb(34,34,34);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:14.6667px;font-style:normal;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><span style="font-size:6.5pt;line-height:9.96667px;font-family:"Ancizar Sans",sans-serif;color:black">Aviso legal:</span></b><span style="font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);font-size:6.5pt;line-height:9.96667px;font-family:"Ancizar Sans",sans-serif;color:black"> El contenido de este mensaje y los archivos adjuntos son confidenciales y de uso exclusivo de la Universidad Nacional de Colombia. Se encuentran dirigidos sólo para el uso del destinatario al cual van enviados. La reproducción, lectura y/o copia se encuentran prohibidas a cualquier persona diferente a este y puede ser ilegal. Si usted lo ha recibido por error, infórmenos y elimínelo de su correo. Los Datos Personales serán tratados conforme a la Ley 1581 de 2012 y a nuestra Política de Datos Personales que podrá consultar en la página web </span><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Calibri,sans-serif;font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);font-size:6.5pt;line-height:9.96667px"><a href="http://www.unal.edu.co/" style="color:blue" target="_blank"><span style="font-family:"Ancizar Sans",sans-serif">www.unal.edu.co</span></a></span><span style="font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:justify;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);font-size:6.5pt;line-height:9.96667px;font-family:"Ancizar Sans",sans-serif;color:black">.<u><span> </span></u>Las opiniones, informaciones, conclusiones y cualquier otro tipo de dato contenido en este correo electrónico, no relacionados con la actividad de la Universidad Nacional de Colombia, se entenderá como personales y de ninguna manera son avaladas por la Universidad.</span><br><span style="color:rgb(245,132,111);font-family:ClearSans-Regular,Arial,Verdana,Helvetica,sans-serif;font-size:14px;font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:left;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);display:inline!important;float:none"><span></span></span><span style="color:rgb(245,132,111);font-family:ClearSans-Regular,Arial,Verdana,Helvetica,sans-serif;font-size:14px;font-style:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:left;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);display:inline!important;float:none"><span></span></span>