<div dir="auto">Hi Elaine and Tom,</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">I actually have a related question on marker files.  I tried to color my density by “color zone #2 near #4 distance 70”, for example. However, it seems that I can only have one marker file colored (they are mutually exclusive). For example, if I want to color area around another model by “color zone #2 near #5”, the coloring done by the previous command near #4 will disappear.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Best,</div><div dir="auto">Shiqing </div><div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Jun 30, 2021 at 12:04 PM SHIQING LIAO <<a href="mailto:shiqing03@g.ucla.edu">shiqing03@g.ucla.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="auto">Hi Elaine and Tom,</div><div dir="auto"> </div><div dir="auto">Thank you so much! I am amazed by the speed of response and update!</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Best,</div><div dir="auto">Shiqing </div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto"><br></div><div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Jun 30, 2021 at 11:42 AM Tom Goddard <<a href="mailto:goddard@sonic.net" target="_blank">goddard@sonic.net</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space">Hi Shiqing,<div><br></div><div>  I added a menu to the Marker Placement panel to choose which marker set is used when adding markers with the mouse.  Also the "New" button will make a new marker set.  These improvements will be in tonight's ChimeraX builds.</div><div><br></div><div><span style="white-space:pre-wrap">    </span>Tom<br><div><br></div><div><img src="cid:17a5e4d9b13839679731" style="width:812px;max-width:100%"></div><div><br><blockquote type="cite"></blockquote></div></div></div><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space"><div><div><blockquote type="cite"><div>On Jun 30, 2021, at 8:47 AM, Elaine Meng via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:</div><br></blockquote></div></div></div><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space"><div><div><blockquote type="cite"><div><div></div></div></blockquote></div></div></div><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space"><div><div><blockquote type="cite"><div><div>Hi Shiqing,<br>In your example command, #5 is telling it to add to marker model #5.  If there is a different marker set it would have a different model number.  So if you are adding the marker with a command, you can control it directly by the model number in that command.  However, the example command you gave isn't quite right, maybe you meant:<br><br>marker #5 position 1,1,1 radius 100<br><br>"marker" command details:<br><<a href="https://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/commands/marker.html" target="_blank">https://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/commands/marker.html</a>><br><br>You are probably talking about adding the marker with the mouse, however.  In that case, you are right:  I don't see a way to control which marker model is used.  Maybe we did not plan for people to have multiple marker models.  So maybe this is a type of control that can be added in the future.<br><br><<a href="https://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/tools/markerplacement.html" target="_blank">https://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/tools/markerplacement.html</a>><br><br>Sorry about that,<br>Elaine<br>-----<br>Elaine C. Meng, Ph.D.                       <br>UCSF Chimera(X) team<br>Department of Pharmaceutical Chemistry<br>University of California, San Francisco<br><br><blockquote type="cite">On Jun 29, 2021, at 7:29 PM, SHIQING LIAO via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br><br>Hi! <br><br>I’m trying to have multiple marker files because I would like them to have different radius and coloring distance. I figured out that I can create new marker files by “marker #5 1,1,1 radius 100”, for example. However, if I add new markers, the new marker always goes to the first marker file, instead of the selected marker file that I want. Any help is really appreciated!<br><br>Best,<br>Shiqing <br></blockquote><br><br></div></div></blockquote></div></div></div><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space"><div><div><blockquote type="cite"><div><div>_______________________________________________<br>ChimeraX-users mailing list<br><a href="mailto:ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu</a><br>Manage subscription:<br><a href="https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users" target="_blank">https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users</a><br><br></div></div></blockquote></div><br></div></div></blockquote></div></div>
</blockquote></div></div>