<div dir="ltr">Hello again,<div><br></div><div>You guys were so helpful last time I figured I'd just ask for help again! I'm trying to do something that I know is a feature in PyMol but I'm not sure if it is a feature in ChimeraX (yet). In PyMol, there is a function to pair fit over specific atoms between two different structures. I have tried using the Matchmaker tool in ChimeraX to do this, but I think the dilemma is I'm trying to align the protein relative to the position of specific atoms in a heme cofactor across two different structures and that isn't something in the primary sequence of the protein. I also could just be doing something wrong in the matchmaker process. Do you know if there is an easy way to accomplish this in ChimeraX? </div><div><br></div><div>Best regards,</div><div><br></div><div>Rachael Coleman<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><div><div><b>Rachael E. Coleman</b><br></div><div>PhD Candidate, Lancaster Group<br></div></div>Department of Chemistry and Chemical Biology<br></div>Cornell University<br></div>Ithaca, NY 14853<br></div></div><div>Pronouns: She, her, hers</div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>