<div dir="ltr">Hi all,<div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>I'm interested in visualizing post translational modified positions in Chimera or ChimeraX, using the script generated by PhosphoSitePlus (PSP). I'm not able to get it working though, so I hope you can help:</div><div><br></div><div><a href="https://www.phosphosite.org/proteinAction.action?id=4103&showAllSites=true">Here's an example of a page with an available Chimera script.</a> From what I read in the <a href="https://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/1.10/docs/webservices.html">documentation</a> about web services, I should be able to click the script, and it will open in a locally running instance of Chimera. However, in Chrome, my only option is to download the script.</div><div><br></div><div>When I download and then try to open the script in ChimeraX (v 1.1), it tells me the ".chimerax" file type is not recognized. When I try to open it in the original Chimera (v1.15), I get the infinite spinning wheel of rainbows. These things occur whether or not I have the reference PDB structure loaded. Just to see what would happen, I also tried pasting the first command from the .chimerax file (<b>setattr a label Ser-89 :88.A@OG</b>) into Chimera and ChimeraX. The command executed successfully in Chimera, but in ChimeraX, I get the error</div><div><br></div><div>setattr a label Ser-89 <span style="background-color:rgb(255,0,0)">:88.A@OG</span><br><font color="#ff0000">Expected a keyword</font><br></div><div><br></div><div>Thanks in advance for the assistance,</div><div>Dan</div><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">_</span><span style="font-size:12.8px">_</span><span style="font-size:12.8px">__________________________</span><br></div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr">Daniel Gurnon, Ph. D.<div>Associate Professor of Chemistry and Biochemistry</div><div>DePauw University<br></div><div>Greencastle, IN 46135</div></div></div></div></div></div></div></div>