
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>

</head>

<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">

<p>Hi,<br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>I'm trying to generate a ribbons diagram where the secondary structures are defined by user and colored by user. I'm running into a problem where half of the amino acid is assigned the secondary structure and the entire residue is assigned the color. This

 makes for a strange image. Attached is an image. Notice how the coloring starts before the secondary structure. <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);"> Any help is appreciated.</span><br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>Best wishes,<br>

Reza<br>

</p>

<p><br>

</p>

<div id="Signature">

<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">

Reza Khayat, PhD

<div>Assistant Professor </div>

<div>City College of New York</div>

<div>Department of Chemistry and Biochemistry</div>

<div>New York, NY 10031</div>

</div>

</div>

</body>

</html>