<div dir="ltr">Hi Elaine,<div><br></div><div>thank you, it was exactly what I was looking for!</div><div>I'm enjoying ChimeraX a lot, you're really doing a wonderful job!</div><div>Thank you for your attention and your help.</div><div>Have a good weekend,</div><div><br></div><div>Andrea</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Il giorno sab 4 lug 2020 alle ore 18:23 Elaine Meng <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>> ha scritto:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi Andrea,<br>
I guess you mean measuring the size of an atomic structure, such as from the Protein Databank.  Given such a structure, you can do distance measurements between any two atoms.  Or,  with command "measure inertia" you can calculate an inertial ellipsoid for the protein, which reports the three axis lengths.<br>
<br>
See the "measurements" page and links therein for how to do many types of measurements in ChimeraX:<br>
<<a href="http://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/measurements.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/measurements.html</a>><br>
<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.                       <br>
UCSF Chimera(X) team<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
> On Jul 4, 2020, at 7:23 AM, Andrea Dallapè <<a href="mailto:andrea.dallape@unitn.it" target="_blank">andrea.dallape@unitn.it</a>> wrote:<br>
> <br>
> Dear UCSF Chimera and ChimeraX developers,<br>
> I would like to ask you if there's a method to obtain the size measures of a protein in order to compare with the heights and lengths obtained by AFM. <br>
> Could you please suggest me how could I obtain such measurements?<br>
> Thank you in advance for your help and support,<br>
> Andrea<br>
<br>
</blockquote></div>