<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<font size="3" class="">Dear chimeraX developer,</font>
<div class=""><font size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font size="3" class="">I am a graduate student from university of Texas at San Antonio. I’m trying to make a movie to compare two of my structures (resting state and substrate bound) using the function “morph”. But there is a problem, I very
 appreciate if you can help me figure this out.</font></div>
<div class=""><font size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font size="3" class="">As show in Figure 1, I have two structures superposed. The resting state (nude) contains an active site metal ion coordinated by three residues and 3 water molecules. And the substrate bound (blue) also contains a metal
 coordinated by the same residues, a remaining water molecule, and a new ligand as my substrate.</font></div>
<div class=""><font size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font size="3" class="">After I entered command “morph #1,2 frames 60”, I got the result of Figure 2. However, the active site metal ion and the water and substrate are missing. I want to show the active site changes between model 1 and 2. Model
 #3.1 seems keep the metal coordination bonds but I can’t make it present even with “show”. So my question is how to show the metal and the corresponding ligands in morph?</font></div>
<div class=""><font size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><font size="3" class="">Regards,</font></div>
<div class=""><font size="3" class="">Yifan Wang </font></div>
<div class=""><font size="3" class=""><br class="">
</font></div>
<div class=""><img apple-inline="yes" id="3E753BA9-1D64-4A65-919D-452576C36408" width="729" height="469" src="cid:143A130E-412D-4674-AB95-99EA0C21DF44@UTSARR.NET" class=""></div>
<div class=""><img apple-inline="yes" id="D73E0411-552A-4D7D-9599-72AE603B30F7" width="729" height="471" src="cid:90E28A3D-AB8F-402F-A982-8B40682176A1@UTSARR.NET" class=""></div>
</body>
</html>