<div dir="ltr">Thank you for your quick response.</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Dec 18, 2019 at 11:57 PM Elaine Meng <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Rajarshi Roy,<br>
The command in ChimeraX to match small molecules is “align” (not “match,” which is the same as “matchmaker” and works for biopolymers).<br>
<br>
<<a href="http://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/commands/align.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/commands/align.html</a>><br>
<br>
The error message is wrong!  Sorry about that, we will fix it.  I guess the error message was copied from Chimera to ChimeraX without updating the wording.<br>
<br>
Apologies for the inconvenience.   <br>
Best,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Chimera(X) team<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
> On Dec 17, 2019, at 10:28 PM, Rajarshi Roy <<a href="mailto:phd1701171011@iiti.ac.in" target="_blank">phd1701171011@iiti.ac.in</a>> wrote:<br>
> <br>
> Dear ChimeraX,<br>
> I am trying to superimpose multiple carbohydrate chains using chimeraX. Using match command, I am unable to do the same.<br>
> Here is my command:<br>
> match #2:1-4 to  #1:1-4<br>
> But I am getting the following error:<br>
> Reference and/or match model contains no nucleic or amino acid chains.<br>
> Use the command-line 'match' command to superimpose small molecules/ligands.<br>
> <br>
> Already I am using match command, still why the same error is showing?<br>
> Please advise me on how to proceed?<br>
> Thank you in advance.<br>
> <br>
> -- <br>
> with regards<br>
> Rajarshi Roy<br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><div><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><b>with regards</b></span></span><br><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"></span></span><div><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><b>Rajarshi Roy<br></b></span></span></div><div><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><b><br></b></span></span></div><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><b>PhD Research Scholar<br></b></span></span></div><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><b>Biosciences and Biomedical Engineering<br></b></span></span></div><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><b>Indian Institute of Technology, Indore<br></b></span></span></div><span style="color:rgb(11,83,148)"><span style="font-family:"arial narrow",sans-serif"><b>India</b></span></span><br></div></div></div></div></div></div>