<div dir="auto">Hi Elaine,<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Thank you for your help. I'll verify my system then. </div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Sincerely,</div><div dir="auto">Mauricio Menegatti Rigo</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">Em 25/01/2018 16:20, "Elaine Meng" <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>> escreveu:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Maurício,<br>
I don’t have this problem opening your PDB file with ChimeraX 0.5 release (Dec 20, 2017) and also the current daily build.  I only get one warning message that can be ignored, that it does not like the END on line 2615, and the structure looks fine.  I’m testing on Mac.<br>
<br>
I’m not sure what’s happening for you.  I guess you could make sure you are using a fairly recent version; otherwise, maybe it is something specific to your system or platform.<br>
Elaine<br>
<br>
> On Jan 25, 2018, at 10:05 AM, Maurício Menegatti Rigo <<a href="mailto:mauriciomr1985@gmail.com">mauriciomr1985@gmail.com</a>> wrote:<br>
><br>
> Sure, this is my file.<br>
><br>
><br>
> 2018-01-25 16:01 GMT-02:00 Elaine Meng <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>>:<br>
> Dear Mauricio,<br>
> It’s hard to tell without having the file, or at least part of it that gives these messages.  Could send as attachment to the list, or if private, just to me.<br>
> Best,<br>
> Elaine<br>
> -----<br>
> Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
> UCSF Chimera(X) team<br>
> Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
> University of California, San Francisco<br>
><br>
> > On Jan 25, 2018, at 8:55 AM, Maurício Menegatti Rigo <<a href="mailto:mauriciomr1985@gmail.com">mauriciomr1985@gmail.com</a>> wrote:<br>
> ><br>
> > I don't understand, my .pdb file seems perfectly fine, but I keep getting this error:<br>
> ><br>
> > Ignored bad PDB record found on line 1<br>
> > ATOM 1 N ASN A 1 61.433 13.168 52.787 1.00 69.56 N<br>
> ><br>
> > Ignored bad PDB record found on line 2<br>
> > ATOM 2 CA ASN A 1 62.543 13.695 51.962 1.00 69.56 C<br>
> ><br>
> > Ignored bad PDB record found on line 3<br>
> > ATOM 3 C ASN A 1 61.990 14.337 50.735 1.00 69.56 C<br>
> ><br>
> > Ignored bad PDB record found on line 4<br>
> > ATOM 4 O ASN A 1 60.999 13.878 50.167 1.00 69.56 O<br>
> ><br>
> > Ignored bad PDB record found on line 5<br>
> > ATOM 5 CB ASN A 1 63.479 12.547 51.555 1.00 69.56 C<br>
> ><br>
> > 2610 messages similar to the above omitted<br>
> ><br>
> > I can open it in Chimera, PyMol, VMD, among others. But in ChimeraX is always the same error. I'm working on Linux (Ubuntu 14.04) with ChimeraX version 0.5 (2018-01-24).<br>
> ><br>
> > Any help?<br>
> ><br>
> > Thanks in advance,<br>
> > Mauricio M Rigo, Ph.D<br>
><br>
> <BEST_SiglecE_murine-<wbr>BL00230001-chainA.pdb><br>
</blockquote></div></div>