<div dir="ltr">Dear Chimera X<div><br></div><div>Thank you very much for your kind answers.<br><br></div><div>I tried to find the distance between ligand(cluster14) and protein(TRP420) by referring to the tutorial, but I could not do it, so I contacted you.<br><div><br></div><div>Detail</div><div>Objective: To display the distance between cluster14 and TRP420(The area circled in yellow）.<br></div><div><img src="cid:ii_kyxt4hyr5" alt="image.png" width="472" height="249"><br></div><div>I chose cluster 14 and TRP420 (shift+ctrl+click)→tool →structure Analysis →distance</div><div><span lang="EN-US" style="font-family:Cambria,serif;font-size:9pt"><span style="font-variant-numeric:normal;font-variant-east-asian:normal;font-stretch:normal;font-size:7pt;line-height:normal;font-family:"Times New Roman""> </span></span></div><div><font face="Times New Roman" size="1">Refernece:　Chimera tutorial</font></div><div><b style="font-family:Cambria,serif;font-size:12pt"><span lang="EN-US" style="font-size:9pt">To measure distances</span></b><span lang="EN-US" style="font-family:Cambria,serif;font-size:9pt">:</span><span lang="EN-US" style="font-size:9pt;font-family:Symbol;color:rgb(152,72,6)"><span style="font-variant-numeric:normal;font-variant-east-asian:normal;font-stretch:normal;font-size:7pt;line-height:normal;font-family:"Times New Roman""> </span></span></div><div><span lang="EN-US" style="color:rgb(152,72,6)"><font face="Times New Roman" size="1">・</font></span><span lang="EN-US" style="font-family:Cambria,serif;font-size:9pt;color:rgb(152,72,6)">Select two atoms –
press Shift + Control + Left click on the atoms in the graphics window >> </span></div><div><span lang="EN-US" style="font-size:9pt;font-family:Symbol;color:rgb(152,72,6)"><span style="font-variant-numeric:normal;font-variant-east-asian:normal;font-stretch:normal;font-size:7pt;line-height:normal;font-family:"Times New Roman"">・  </span></span><span lang="EN-US" style="font-family:Cambria,serif;font-size:9pt;color:rgb(152,72,6)">Tools >>
Structure Analysis >> Distances >> Create  - Distance reported in graphics and new
window</span></div><div><br></div><div><span lang="EN-US" style="font-family:Cambria,serif"><font color="#000000">But,</font></span><span lang="EN-US" style="font-family:Cambria,serif;font-size:9pt;color:rgb(152,72,6)"> </span><span lang="EN-US" style="font-family:Cambria,serif;font-size:9pt"><font color="#000000">error is shown.  How to solve this problem?</font></span></div><div><img src="cid:ii_kyxsn0pu2" alt="image.png" width="338" height="307"></div><div><br></div><div><img src="cid:ii_kyxsry3g3" alt="image.png" width="220" height="230"></div><div><br></div><div>What else I tried.<br></div><div><br></div><div>combine ligand and protein(OSBP)→But, I couldn't display.</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><span style="color:rgb(34,34,34)">------------------------------</span><span style="color:rgb(34,34,34)">------------------------------</span><span style="color:rgb(34,34,34)">---------------</span><br></div><div><br></div><div><span style="color:rgb(34,34,34)">Kenji Matsui</span><br style="color:rgb(34,34,34)"><span style="color:rgb(34,34,34)"> Graduate School of Tokyo University of Agriculture and Technology</span><br style="color:rgb(34,34,34)"><span style="color:rgb(34,34,34)">2-24-16, Nakamachi, Koganei-shi, Tokyo 184-8588, Japan</span><br style="color:rgb(34,34,34)"><div style="color:rgb(34,34,34)"> Mail: <a href="mailto:s214903z@st.go.tuat.ac.jp" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">s214903z@st.go.tuat.ac.jp</a></div></div></div></div></div></div></div></div>