<div dir="ltr">Thank you, Elaine and Kevin, for your response. <div>The Rosetta Symmetry docking is up to 400 amino acids, and mine is 800. I can't use it as it is. Wondering there is any other server for predicting symmetry. </div><div><br></div><div>Thank you. </div><div><br></div><div>Best </div><div>Smith</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Aug 31, 2021 at 7:02 PM Kevin Jude <<a href="mailto:kjude@stanford.edu">kjude@stanford.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div> Hi Smith, you can use Rosetta Symmetric Docking. It's available on the ROSIE server</div><div><br></div><div><a href="https://rosie.rosettacommons.org/symmetric_docking" target="_blank">https://rosie.rosettacommons.org/symmetric_docking</a></div><br clear="all"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span><div>--<br></div><div>Kevin Jude, PhD (he/him/his)<br><div>Structural Biology Research Specialist, Garcia Lab</div><div>Howard Hughes Medical Institute</div></div><div>Stanford University School of Medicine</div><div>Beckman B177, 279 Campus Drive, Stanford CA 94305</div><div>Phone: <a href="tel:%28650%29%20723-6431" value="+16507236431" target="_blank">(650) 723-6431</a></div></span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Aug 31, 2021 at 4:30 AM tim smith via Chimera-users <<a href="mailto:chimera-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi All,<div>Apologies for the nonrelated question!!</div><div><br></div><div>Wondering if there are any tools (can make in chimera/chimerax/Pymol) that predict or build protein oligomers based on alphfold structure.   Please let me know. I will be grateful for your kind responses. Thank you </div><div><br></div><div>Best</div><div>Smith</div></div>
_______________________________________________<br>
Chimera-users mailing list: <a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
Manage subscription: <a href="https://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a><br>
</blockquote></div>
</blockquote></div>