<div dir="ltr"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="margin:0px;padding:0px;color:rgb(53,53,53)"><div style="margin:0px;padding:0px"><div style="color:rgb(34,34,34)">Dear Experts,</div><div style="color:rgb(34,34,34)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34)">This is regarding adding an ALA residue in the C-terminal of a specific protein domain, with CHIMERA.</div><div style="color:rgb(34,34,34)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34)">I have a protein-complex with multiple domains and chains.</div><div style="color:rgb(34,34,34)">I want to add an ALA residue (101-th position) in the chain D, after the 100th residue which is PRO.</div><div style="color:rgb(34,34,34)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34)">I followed the tutorial and have given the following command in command line:</div><div style="color:rgb(34,34,34)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34)"><b>addaa ala,101 :100.d</b></div><div style="color:rgb(34,34,34)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34)">The following outcome was: Couldn’t find ‘O’ backbone atom of PRO 100.D.</div><div style="color:rgb(34,34,34)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34)">Request you to kindly let me know what the possible solution could be, so that I add an ALA residue in the C-terminal of Chain D.</div><div style="color:rgb(34,34,34)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34)">Thank you in advance,</div><div style="color:rgb(34,34,34)">Regards,</div><div style="color:rgb(34,34,34)">Prathit Chatterjee</div></div></div></div></div></div></div><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Jun 28, 2021 at 4:48 PM Prathit Chatterjee <<a href="mailto:prathit.biophysics@gmail.com">prathit.biophysics@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div style="overflow-wrap: break-word;"><div>Dear Experts,</div><div><br></div><div>This is regarding adding an ALA residue in the C-terminal of a specific protein domain, with CHIMERA.</div><div><br></div><div>I have a protein-complex with multiple domains and chains.</div><div>I want to add an ALA residue (101-th position) in the chain D, after the 100th residue which is PRO.</div><div><br></div><div>I followed the tutorial and have given the following command in command line:</div><div><br></div><div><b>addaa ala,101 :100.d</b></div><div><br></div><div>The following outcome was: Couldn’t find ‘O’ backbone atom of PRO 100.D.</div><div><br></div><div>Request you to kindly let me know what the possible solution could be, so that I add an ALA residue in the C-terminal of Chain D.</div><div><br></div><div>Thank you in advance,</div><div>Regards,</div><div>Prathit Chatterjee</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div></blockquote></div>