<div dir="ltr"><div>Hi,</div><div><br></div><div>Is there a work around measuring rmsd between two structures of the same protein, with one of them missing some segments, without having to rebuild / model the missing parts?!</div><div><br></div><div>I'm thinking of writing a quick script to check for the matching segments, calculate rmsd for those and take an average of these measurements, unless there's a quicker way to do it! </div><div><br></div><div>Regards. </div></div>