<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body>
<div id="edo-message">
<div></div>
Thanks Elaine!  Well you answered well before others in the team. 👍</div>
<div id="edo-meta"><style hint="edo">#edo-signature img {max-width: 90%}</style>
<div id="edo-signature" style="font-family: sans-serif, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial;font:-apple-system-body;">
<br>
</div>
</div>
<div id="edo-original">
<div><br>
<br>
<blockquote type="cite" style="margin:1ex 0 0 0; height: min-content; border-left:1px #ccc solid;padding-left:0.5ex;">
<div>On Apr 1, 2021 at 8:02 PM, <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">Elaine Meng</a>> wrote:<br>
<br>
</div>
<div>
<pre>Hey, I'm not the only one who answers these questions!  :-)

It is explained in the "Fit in Map" manual page:
<<a href="https://urldefense.com/v3/__https://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/fitmaps/fitmaps.html*matrices__;Iw!!JqxBPMk!xxVnA8H7hYuofVFeoHwHPo-TJhHwl52Ro3yS2YPnrup56wIKqpeuq-rtH-PilKRZ3g$" dir="ltr" x-apple-data-detectors="true" x-apple-data-detectors-type="link" x-apple-data-detectors-result="1">https://urldefense.com/v3/__https://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/fitmaps/fitmaps.html*matrices__;Iw!!JqxBPMk!xxVnA8H7hYuofVFeoHwHPo-TJhHwl52Ro3yS2YPnrup56wIKqpeuq-rtH-PilKRZ3g$</a> >

"The transformation matrix of the fit model relative to the reference map is reported in the Reply Log. The first three columns of the matrix describe a rotation and the fourth describes a translation (performed after the rotation)."

I hope this helps,
Elaine
-----
Elaine C. Meng, Ph.D.                        
UCSF Chimera(X) team
Department of Pharmaceutical Chemistry
University of California, San Francisco

> On Apr 1, 2021, at 3:46 PM, Ashok Nayak <<a href="mailto:Ashok.Nayak@vcuhealth.org" dir="ltr" x-apple-data-detectors="true" x-apple-data-detectors-type="link" x-apple-data-detectors-result="4">Ashok.Nayak@vcuhealth.org</a>> wrote:
>  
> HI Elaine,
> I want to know the rotation and translation components along x,y and z separately from the rotation matrix obtained from chimera reply log upon fitting a model into a map. Will it be possible to know?
>  
> Matrix rotation and translation
>      1.00000000  -0.00000000  -0.00000000   1.83458738
>     -0.00000000   1.00000000  -0.00000000   1.15016978
>     -0.00000000  -0.00000000   1.00000000  -0.53835221
>   Axis   0.00000000   0.00000000   1.00000000
>   Axis point   0.00000000   0.00000000   0.00000000
>   Rotation angle (degrees)   0.00000000
>   Shift along axis  -0.53835221
>  
> thanks,
> Ashok

</pre>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</body>
</html>