<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN">
<html><body>
OK<br />Thanks<br />Saverio<br />
<p>Il 15.03.2021 17:35 Elaine Meng ha scritto:</p>
<blockquote type="cite" style="padding-left:5px; border-left:#1010ff 2px solid; margin-left:5px; width:100%"><!-- html ignored --><!-- head ignored --><!-- meta ignored -->
<pre>Hi Saverio,
If you are trying to get a ladder rung that goes across the base pair, you would have to select both residues in the base pair.  E.g. in this case the base pair is 20.b with 5.a.  So you would need something like

command:  select :5.a,20.b

... and then use the menu like you did, or another command:

nuc side ladder sel

I hope this helps,
Elaine
-----
Elaine C. Meng, Ph.D.                       
UCSF Chimera(X) team
Department of Pharmaceutical Chemistry
University of California, San Francisco</pre>
<blockquote type="cite" style="padding-left:5px; border-left:#1010ff 2px solid; margin-left:5px; width:100%">On Mar 15, 2021, at 5:05 AM, <a href="mailto:svle@tiscali.it">svle@tiscali.it</a> wrote: Hi, I have a visualization that seems not a correct one for 1d86 for DT 20.b when using Actions -> Atoms/Bonds -> nucleotide objects -> settings... . Settings: Show backbone as: Ribbon Show sides( .... ) as ladder Ladder Options: Ignore non-base H-bonds: false Shows stubs: false Rung radius: 0.45 Using existing H-bonds: true In the png file the problem. Where I'm wrong? Thanks Saverio</blockquote>
</blockquote>
</body></html>
<br><br/><br/>Con Tiscali Mobile Smart 30 4G hai minuti illimitati, 100 SMS e 30 Giga in 4G a soli 8,99€ al mese. <a href='http://tisca.li/smart30' target='_blank'>http://tisca.li/smart30</a><br/><br/>