<div class="__aliyun_email_body_block"><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">Dear Elaine,</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">Thank you for your reply. The attribute file entropy.txt is available at </span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">https://drive.google.com/file/d/1oG0O4zKqw-uD5SeLTrAu16c3Jh8m3LG5/view?usp=sharing</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">Could you please help check whether the format is correct"?</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">I cannot figure out how to open this attribure file in chimera. When I input "open entropy.txt format defattr" in chimerax, I get the following error message:</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">Invalid "format" argument: Should be one of 'aln', 'amira', 'apbs', 'bild', 'brix', 'ccd', 'ccp4', 'cellpack', 'cmap', 'cmd', 'collada', 'compiled python', 'cube', 'dcd', 'delphi', 'dicom', 'dock', 'dsn6', 'dv', 'emanhdf', 'fasta', 'fsc', 'gltf', 'gopenmol', 'hdf', 'hssp', 'html', 'ihm', 'images', 'imagic', 'imod', 'imodmap', 'ims', 'macmolplt', 'markers', 'mmcif', 'mmtf', 'mol2', 'mrc', 'msf', 'netcdf', 'obj', 'pdb', 'pdbqt', 'pfam', 'pif', 'pir', 'positions', 'priism', 'profec', 'pseudobonds', 'python', 'rsf', 'sdf', 'segger', 'session', 'sff', 'situs', 'smiles', 'spider', 'stl', 'stockholm', 'storm', 'swc', 'tom_em', 'trr', 'uhbd', 'uniprot', 'vtk', 'web fetch', 'xplor', or 'xtc'</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;">Could you tell me what is the correct way to open the file?</div><div  style="clear:both;"><br ></div><div  style="clear:both;">Thank you,</div><div  style="clear:both;">Best,</div><div  style="clear:both;">Yeping</div><blockquote  style="margin-right:.0px;margin-top:.0px;margin-bottom:.0px;"><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">------------------------------------------------------------------</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">From:孙业平 <sunyeping@aliyun.com></span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">Send Time:2021年1月26日(星期二) 11:53</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">To:chimera-users <chimera-users@cgl.ucsf.edu></span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">Subject:[Chimera-users] how to color an model by an attribute in chimerax</span></div><div  style="clear:both;"><span  style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;"><span  class=" __aliyun_node_has_color" style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;">Dear all,</span></div><div  style="clear:both;"><span  class=" __aliyun_node_has_color" style="font-family:Tahoma,Arial,STHeiti,SimSun;font-size:14.0px;color:#000000;"><br ></span></div><div  style="clear:both;">I wish to color an model  by an attribute in chimerax. The attribute is the entropy which is calculted by an external software. I wrote the entropy values of each residue in a text file (attr.txt) like the following:</div><div  style="clear:both;"><br ></div><div  style="clear:both;">attribute: entropy<br >match mode: 1-to-1<br >recipient: residues<br > :1 0.0<br > :2 0.0014948<br > :3 0.0090952<br > :4 0.0004805<br > :5 0.1102497<br > :6 0.0095258<br > :7 0.0008226<br > :8 0.0042205<br > :9 0.0037255<br > :10 0.0006678<br > :11 0.0027988<br > :12 0.0193925<br > :13 0.0153925<br > :14 0.0052115<br > :15 0.0020136</div><div  style="clear:both;">..........</div><div  style="clear:both;"><br ></div><div  style="clear:both;">However, when I input the command "color byattr attr.txt", I get the following error information:</div><div  style="clear:both;">"No known/Registered attribute attr.txt"</div><div  style="clear:both;"><br ></div><div  style="clear:both;">Could anyone tell me what is the correct way to do this?</div><div  style="clear:both;"><br ></div><div  style="clear:both;">With many thanks.</div><div  style="clear:both;"><br ></div><div  style="clear:both;">Best regards</div></blockquote><div ><br ></div></div>