<div dir="ltr"><div>Hello</div><div>I am trying to measure (from command line) the distance between <br></div><div>atom NH1 in residue 27, chain M <br></div><div>atom OG1 in residue 215, chain A</div><div>command<br></div><div>distance :27@NH1 :215@OG1</div><div></div><div>error: 6 atoms were selected. <br></div><div><br></div><div>The error message is correct because the system is a homotrimer.</div><div>My question: any way to specify the chains? Any of my attempts failed.</div><div><br></div><div>Thanks for advice (getting distances from the command line would be quicker that graphically as I have a large number of disnces to measure)<br></div></div>