<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body>
<div dir="ltr">Good day,
<div><br>
</div>
<div>I am an honours student attempting to set up my first molecular dynamics simulation, and am having some trouble trying to understand how to set a pathway for a substrate through a pore in Chimera. I am very unsure of how to do this, and was wondering if
 you could provide some help. I tried following the Trajectory and Ensemble Analysis tutorial, but essentially cannot get past the first step of downloading leap.top etc. I am also not sure if this is the correct tutorial to follow for what I am looking to
 do?</div>
<div><br>
</div>
<div>Any advice would be greatly appreciated, I am in way over my depth.</div>
<div><br>
</div>
<div>Thank you</div>
<div><br>
</div>
<div>Kind regards,</div>
<div>Rani</div>
<div><br>
</div>
</div>
Disclaimer - University of Cape Town This email is subject to UCT policies and email disclaimer published on our website at http://www.uct.ac.za/main/email-disclaimer or obtainable from +27 21 650 9111. If this email is not related to the business of UCT, it
 is sent by the sender in an individual capacity. Please report security incidents or abuse via https://csirt.uct.ac.za/page/report-an-incident.php.
</body>
</html>