<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body>
<div dir="ltr">
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">Hi,</div>
<div dir="ltr">I am trying to get the backbone RMSD between two structures. However I tried selecting backbone and use matchmaker, it gives me same value with the whole protein. So there must be something wrong. Could you please teach me a command that can
 do this? Thank you so much for helping!</div>
<div dir="ltr">Best,</div>
<div dir="ltr">Bixia </div>
<div class="ms-outlook-ios-signature"></div>
</div>
</div>
</body>
</html>