<div dir="ltr"><div>Good day!</div><div><br></div><div>My name is Sergei Vladimirov, I'm a student at Moscow State University.</div><div>As far as I know, when running a molecular dynamics of ligand-protein interaction one must use different force fields to the ligand and the protein. There is a mm14ff to calculate interactions within a protein but there are only two different force fields to calculate interactions within a ligand.</div><div>I've been led into believing that the best ff for small organic ligands is GAFF.</div><div>So my question is, is there any way to implement the GAFF force field into the production of molecular dynamics?</div><div><br></div><div>Is there anything I'm missing? I will be awaiting your reply.</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div>Sergei Vladimirov.<br></div></div>