<html><head>

<style id="css_styles"> 
blockquote.cite { margin-left: 5px; margin-right: 0px; padding-left: 10px; padding-right:0px; border-left: 1px solid #cccccc }
blockquote.cite2 {margin-left: 5px; margin-right: 0px; padding-left: 10px; padding-right:0px; border-left: 1px solid #cccccc; margin-top: 3px; padding-top: 0px; }
a img { border: 0px; }
li[style='text-align: center;'], li[style='text-align: right;'] {  list-style-position: inside;}
body { font-family: Segoe UI; font-size: 12pt;   }
 </style>
<style><!--#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 p.MsoNormal{
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-parent:'';
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0in;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 li.MsoNormal{
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-parent:'';
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0in;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 div.MsoNormal{
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-parent:'';
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0in;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 p.MsoListParagraph{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0.5in;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 li.MsoListParagraph{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0.5in;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 div.MsoListParagraph{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0.5in;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 p.MsoListParagraphCxSpFirst{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:0.5in;
        margin-bottom:0.0001pt;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 li.MsoListParagraphCxSpFirst{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:0.5in;
        margin-bottom:0.0001pt;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 div.MsoListParagraphCxSpFirst{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:0.5in;
        margin-bottom:0.0001pt;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 p.MsoListParagraphCxSpMiddle{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:0.5in;
        margin-bottom:0.0001pt;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 li.MsoListParagraphCxSpMiddle{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:0.5in;
        margin-bottom:0.0001pt;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 div.MsoListParagraphCxSpMiddle{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:0.5in;
        margin-bottom:0.0001pt;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 p.MsoListParagraphCxSpLast{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0.5in;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 li.MsoListParagraphCxSpLast{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0.5in;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 div.MsoListParagraphCxSpLast{
        mso-style-priority:34;
        mso-style-unhide:no;
        mso-style-qformat:yes;
        mso-style-type:export-only;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:8pt;
        margin-left:0.5in;
        mso-add-space:auto;
        line-height:107%;
        mso-pagination:widow-orphan;
        font-size:11pt;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 .MsoChpDefault{
        mso-style-type:export-only;
        mso-default-props:yes;
        font-family:'Calibri',sans-serif;
        mso-ascii-font-family:Calibri;
        mso-ascii-theme-font:minor-latin;
        mso-fareast-font-family:Calibri;
        mso-fareast-theme-font:minor-latin;
        mso-hansi-font-family:Calibri;
        mso-hansi-theme-font:minor-latin;
        mso-bidi-font-family:'Times New Roman';
        mso-bidi-theme-font:minor-bidi;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 .MsoPapDefault{
        mso-style-type:export-only;
        margin-bottom:8pt;
        line-height:107%;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 div.WordSection1{
        page:WordSection1;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 ol{
        margin-bottom:0in;
}
#x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6 ul{
        margin-bottom:0in;
}--></style></head>
<body><div id="x1f33a0b6a9584cecbe19a3e17b0a37b6">


<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">Dear colleagues,<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"> </o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">I want to compare 2 models that have some differences: the
same subunits but repositioned, missing structures, etc.<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"> </o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">Is there a tool in Chimera that can:<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p>

<p class="MsoListParagraphCxSpFirst" style="text-indent:-0.25in;mso-list:l0 level1 lfo1 ;" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">-<span>         
</span>Make a list of structure
A (all components/residues). A list of elements in Structure B.<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p>

<p class="MsoListParagraphCxSpMiddle" style="text-indent:-0.25in;mso-list:l0 level1 lfo1 ;" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">-<span>         
</span>Compare and report the
missing parts in structure B compared to structure A? Maybe also the differences
in distances between the same helices in structure B compared to structure A?<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p>

<p class="MsoListParagraphCxSpLast" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"> </o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">Thank you!<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"> </o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">Sincerely,<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p>

<p class="MsoNormal" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">Dmitry<o:p xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office"></o:p></p></div>
</body></html>