<div dir="auto">Hi, <div dir="auto">I did a docking experiment from autodock and downloaded the file in chimerax format, when I open it works great and I select the model with highest delta G and visaulise it, but when I save the model as PDB, and open it in pymol only ligand is visible when I open the protein file in the same, although the ligand sits perfectly. I am not able to get a PDB file of the docked structure for ligplot analysis. </div><div dir="auto">Any help would be appreciated.</div><div dir="auto">Take care</div><div dir="auto">Sincerely,</div><div dir="auto"> Yash Bahl </div><div dir="auto"><br></div></div>