<div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>We are currently developing an educational exercise in Chimera for building different inhibitors in different proteases, using Chimera and then using AutoDock Vina for finding potential docking sites. I was wondering if there is a function in Chimera for doing a conformational search that we could do  to find the lowest energy conformer before running AutoDock Vina?  </div><div><br></div><div>Thank you,<br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><b><br></b></div><div dir="ltr">Maj Krumberger</div><div dir="ltr"><div><br></div><div>Graduate Student - Nowick Group</div><div>Department of Chemistry</div><div><a href="mailto:maj.krumberger@uci.edu" target="_blank">maj.krumberger@uci.edu</a></div><div><br></div><div><img src="https://docs.google.com/uc?export=download&id=1CEP4NZmhK4wqH1Am-JMLaNCYo4AZr8TY&revid=0B9_rwpDQRqhXSlU3RmV3Lzl1eEpaUHpPSzY5a0U5eTZKbFowPQ" width="96" height="96"><br></div><div><br></div><div>University of California, Irvine</div><div>4302 Natural Sciences I</div><div>Irvine, CA 92697-2025</div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>