
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">

Dear Developers, 

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">I have a set of maps that I am trying to transform the following way:</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class=""><u class="">i) Compute the transformation between a PDB and one of maps. </u></div>

<div class="">This is trivial using <i class="">fitmap</i> command. </div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class=""><u class="">ii) I would like to get the inverse transformation moving the PDB to its original position.</u></div>

<div class="">I have tried to play with matrixget and matrixes but without much success in access the the inverse transformation.</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class=""><u class="">iii) Apply the inverse transformation to each of the map.</u></div>

<div class="">I assume you can easily do that with <i class="">move</i> passing the inverse matrix obtained above with a little for loop on model #. </div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class=""><u class="">iv) Save the rotated maps</u></div>

<div class="">This is trivial using <i class="">vop resample</i> and <i class="">

volume save.</i></div>

<div class=""><i class=""><br class="">

</i></div>

<div class=""><span style="font-style: normal;" class="">As you may see, I am struggling with step 2. Is there an easy way to access that matrix, get the inverse, and apply to a set of models. </span></div>

<div class=""><span style="font-style: normal;" class="">I have tried to find a solution in both Chimera (using runCommand) and ChimeraX (using run from core.commands) but to no avail. </span></div>

<div class=""><span style="font-style: normal;" class="">Any tips would be </span>appreciated here - </div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">Ilan</div>

</body>

</html>