<div dir="ltr">Hi<div>Thank you for your reply.</div><div>Could you please let me know which version of DelPhi academic version is compatible with Chimera? Which DelPhi version was used to generate the 3eeb.phi file in the tutorial?</div><div>kindest regards,</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Dec 20, 2019 at 11:16 PM Elaine Meng <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi,<br>
Chimera is saying that your phi file output from Delphi contains inconsistent information, like maybe it got truncated.  I do not know if it is possible to fix the phi file, sorry.  <br>
<br>
The DelPhi files that Chimera can read are from the academic version of DelPhi, as mentioned here:<br>
<<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/filetypes.html#esp" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/filetypes.html#esp</a>><br>
<br>
If you have some other version of DelPhi associated with a commercial package, maybe the format is different and Chimera does not know how to read it.<br>
<br>
Linked to the last section of this tutorial, there is an example DelPhi phi file (3eebB.phi) that Chimera can read:<br>
<<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/tutorials/surfprop.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/tutorials/surfprop.html</a>><br>
<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.                       <br>
UCSF Chimera(X) team<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
> On Dec 20, 2019, at 10:33 AM, labe boye <<a href="mailto:sintaspirulina@gmail.com" target="_blank">sintaspirulina@gmail.com</a>> wrote:<br>
> <br>
> Hi,<br>
> I use windows, UCSF Chimera 1.14 and tried all versions of DelPhi for windows but I get the following error<br>
> Error reading file default.phi, format delphi<br>
> Record size > file size <br>
> What is the solution?<br>
> regards,<br>
> <br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><span style="font-family:monospace">Sintayehu M. Shenkutie, Dr. rer. nat. </span></div><div dir="ltr" style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><span style="font-family:monospace">Assistant Professor of Biochemistry. </span></div><div dir="ltr" style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><span style="font-family:monospace">Department of Chemistry<br></span></div><div dir="ltr" style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><span style="font-family:monospace">Hawassa University</span></div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><span style="font-family:monospace">Ethiopia</span></div><div dir="ltr" style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><font face="monospace">Mobile: +251902432925</font></div><div dir="ltr" style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><font face="monospace">Email: <a href="mailto:dr.sintayehu@hu.edu.et" target="_blank">dr.sintayehu@hu.edu.et</a> </font></div><div dir="ltr" style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><a shape="rect" href="mailto:Sintayehu.M.Shenkutie@bot3.bio.uni-giessen.de" rel="nofollow" style="color:purple" target="_blank">Sintayehu.M.Shenkutie@bot3.bio.uni-giessen.de</a></div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:16px"><div style="margin:0cm 0cm 0.0001pt"><i style="color:rgb(255,0,0);font-family:garamond,times,serif;font-size:x-large"><br></i></div><div style="margin:0cm 0cm 0.0001pt"><i style="color:rgb(255,0,0);font-family:garamond,times,serif;font-size:x-large">The bamboo that bends is stronger than the oak that resists </i></div></div></div></div>