<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:small">Dear RBVI,</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">I need to save around 340 market sets into individual .cmm files, 1 .cmm for each marker set I have in my Chimera session. I have been looking at UCSF Chimera documentation for some time (<a href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/volumepathtracer/volumepathtracer.html#activeset">https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/volumepathtracer/volumepathtracer.html#activeset</a>), and I wanted to ask if multiple marker sets (each with its own unique model ID) can be saved in single batch command line.</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Is there a possibility of specifying commands like <b><i>save</i></b> or <b><i>write</i></b> or <b><i>export</i></b> with atom specification of all the model that I want to save to make Chimera save all my 340 marker sets as their individual .cmm files? I was hoping that I could simply use something like</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><b><i>save #1-340 individual UseModelIDasFilename format .cmm directory E:\LBNL\Individual_Models</i></b></div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">to make it happen, but all the commands that I thought of as potential candidate for batch-save command doesn't mention whether it can work with volume tracer's "Save current marker set as...".</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">or, if I can use Volume Tracer's "Save current marker set as..." using a script, I could handle this by making myself very simple macro, but I don't know whether volume tracer's codes would allow some quick script to substitute its "Save current marker set as..." function.</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">So, in summary, I wanted to know if...</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Q1 : Is there a command in UCSF Chimera that allows batch saving multiple market sets as individual .cmm files?</div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Q2 : Can Volume Tracer's "Save current marker set as..." function be used by using some kind of script?</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Sincerely,</div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Junha Song.</div></div>