<div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;">Dear Chimera<span style="color: rgb(0, 0, 0); display: inline; float: none; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px;"> developers,</span></font></font></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><br style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;">I'm so sorry to interrupt you.</font></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;">I have to run Chimera in Linux,but there is no command line of  "joint modeles".I need to get 2 modified amino acids or peptides together and not creating crashes.In windows,"joint models" is my best choice,it's very convient and perfect.But in Linux,I tried some command line,such as "combine","bond",but it can't automatically <span style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); display: inline; float: none; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px;">repositioning the models and the structure was not right.</span></font></font></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;">So,could you please tell me how to use command lines to replace "joint models" function?</font></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;">Thanks in advance</font></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><br style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><br style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><br style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></font><br style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 14px; line-height: 16.8px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"><font size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"> <span style="background-color: transparent; color: rgb(51, 51, 51); display: inline; float: none; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: justify; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px;">Best Regards</span></font></font></div><div style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: &quot;宋体&quot;,arial,Verdana,sans-serif; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; line-height: 16.8px; orphans: 2; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; text-align: left; text-decoration: none; text-indent: 0px; text-transform: none; -webkit-text-stroke-width: 0px; white-space: normal; word-spacing: 0px; word-wrap: break-word;"><font face="
                Times New Roman
            " size="4" style="background-color: transparent; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 
                Times New Roman
            ; font-size: 18.06px; line-height: 21.67px; padding-bottom: 0px; padding-left: 0px; padding-right: 0px; padding-top: 0px; word-wrap: break-word;"> Daojiong Wang</font></div><br>