
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>

</head>

<body dir="ltr">

<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, Helvetica, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;" dir="ltr">

<p><br>

</p>

<div style="color: rgb(0, 0, 0);">

<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr">

<div> </div>

</div>

<div>

<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:rgb(0,0,0); font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">

<p>Dear all,</p>

<p><br>

</p>

<p>I want to select residues/atoms only those within my cryo-EM map region so that I can highlight/color them.</p>

<p><br>

</p>

<p>As I googled ("<span>select atoms only within a map chimera")</span>, I could find only how to select residues/atoms within certain radius from specific position/atoms.</p>

<p><br>

</p>

<p>I may use <span>phenix.map_model_cc to see which residues have higher cc to my cryo-EM map and manually select those using a script.</span></p>

<p><br>

</p>

<p>However, I'm just curious whether there is already a good automatic chimera function that I can use <span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">to

 select residues/atoms only those within my cryo-EM map region.</span></p>

<p><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px"><br>

</span></p>

<p><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">best,</span></p>

<p><span style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">Doonam</span></p>

<div style="color:rgb(0,0,0)">

<div>

<div dir="ltr">

<div></div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</body>

</html>