<div dir="ltr"><div>I have read the manual about shape sphere. What I would like to do is retaining all proteic, nucleosidic, organic ligands, ions and water molecules that exist within a sphere of, say, 25A centered at a certain atom of a ligand, while discarding everything outside the sphere.</div><div>Because of the content, are there special flags to be used?</div><div><br></div><div>thanks</div><div>francesco pietra</div><div>(actually I am already trying with general commands but python is already working from 1 and 1/2 hr without any outcome)<br></div></div>