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<p></p>

<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Cambria;">Hi,<o:p></o:p></p>

<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Cambria;"><br>

</p>

<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Cambria;">I would like to calculate the rotation axis between two domains of a protein (domains are highly similar in fold and sequence). Is there a way to calculate transformation matrix between

 two objects in chimera (two domains here) to obtain the direction of rotation axis and rotation angle values? Also is it possible to generate a translation vector along rotation axis in graphic screen?

<o:p></o:p></p>

<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Cambria;">Would be great if there is a script available for that and someone can share.<o:p></o:p></p>

<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Cambria;"><o:p> </o:p></p>

<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Cambria;">Have a lovely weekend,<o:p></o:p></p>

<p style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 12pt; font-family: Cambria;">arvind.</p>

<p></p>

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