<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<!--[if !mso]><style>v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style><![endif]--><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-AU" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hello!<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I have been using Chimera for analysis of H-Ras morphing from its GDP-bound inactive state to the GTP-bound active state. It works very nicely and a lovely movie is produced. What I am having difficulty with however, is saving the output
 of the morph as a series of PDB files that I can import to Autodesk Maya with the molecular Maya plugin. When I try to save from the movie window ie using file >save PDB, all I get is one PDB file containing a single structure. I also tried to save using the
 main window file > save PDB > save all frames and the same thing happens. I then tried selecting each frame individually and saving with unique numbered file names, but again, when trying to import into Maya, all I get is one structure, not a changing structure.
 Even the first and last frame PDBs are the same. Could you please advise as to how to save the morph output as a useful PDB series, I must be missing something?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thanks so much and best wishes,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Maja<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;color:#3C196E;mso-fareast-language:EN-AU">Dr Maja Divjak
<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;color:#3C196E;mso-fareast-language:EN-AU">BAppSc(Hons), PhD, Grad Cert 3D Animation (AFTRS)<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;color:#3C196E;mso-fareast-language:EN-AU">Biomedical Animator<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;color:#3C196E;mso-fareast-language:EN-AU">Office of Cancer Research<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="font-family:"Times New Roman",serif;mso-fareast-language:EN-AU"><img width="219" height="66" style="width:2.2812in;height:.6875in" id="Picture_x0020_1" src="cid:image001.jpg@01D4D396.5068FD40" alt="Description: cid:image001.jpg@01D35ECE.31407C60"></span><span style="font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman",serif;mso-fareast-language:EN-AU"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><b><span style="font-size:10.0pt;color:#411E75;mso-fareast-language:EN-AU">Phone</span></b><b><span style="font-size:10.0pt;color:#414042;mso-fareast-language:EN-AU"> 
</span></b><span style="font-size:10.0pt;color:#414042;mso-fareast-language:EN-AU">+61 3 8559 5961<br>
</span><b><span style="font-size:10.0pt;color:#411E75;mso-fareast-language:EN-AU">Email</span></b><b><span style="font-size:10.0pt;color:#414042;mso-fareast-language:EN-AU"> 
</span></b><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><a href="mailto:maja.divjak@petermac.org"><span style="font-size:10.0pt;color:blue">maja.divjak@petermac.org</span></a></span><span style="font-size:10.0pt;color:#414042;mso-fareast-language:EN-AU"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"><span style="font-size:10.0pt;mso-fareast-language:EN-AU">305 Grattan Street<br>
Melbourne Victoria 3000<br>
</span><span style="mso-fareast-language:EN-AU"><a href="http://www.petermac.org/"><span style="font-size:10.0pt;color:blue">www.petermac.org</span></a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<P style="FONT-SIZE: 11px"><font style="FONT-SIZE: 9px; FONT-FAMILY: ; COLOR: "><STRONG>Disclaimer:</STRONG> This email (including any attachments or links) may contain confidential and/or legally privileged information and is intended only to be read or used by the addressee.  If you are not the intended addressee, any use, distribution, disclosure or copying of this email is strictly prohibited.  Confidentiality and legal privilege attached to this email (including any attachments) are not waived or lost by reason of its mistaken delivery to you.  If you have received this email in error, please delete it and notify us immediately by telephone or email.  Peter MacCallum Cancer Centre provides no guarantee that this transmission is free of virus or that it has not been intercepted or altered and will not be liable for any delay in its receipt.</font></P></body>
</html>