
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none"><!-- P { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; } p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>

</head>

<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">

<p>I have an EM map for a virus that includes an antibody bound to the envelope proteins.  The envelope proteins <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">are trimers of dimers with

 C3 symmetry</span> that form spikes on the surface of the virus.   I fit an atomic model for the spikes to the map using icosahedral symmetry, following the very helpful

<a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/videodoc/SymFitDNAb/" target="_blank">symmetric fitting video tutorial</a>.  Now I am trying to fit a model for the antibody into the spike regions of the map.  I need to impose C3 symmetry for the antibody for the fit

 into each spike, in addition to imposing icosahedral symmetry to include all the spikes.  How can I impose both of these in the fit?  <br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>Thanks,<br>

</p>

<p><br>

</p>

<p>Mike Kent<br>

</p>

<p><br>

</p>

<p><br>

</p>

<p><br>

</p>

</body>

</html>