
<html><head></head><body><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;">Dear colleagues,</div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;"><br></div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;">I'd like to report a couple of issues which have cropped up.</div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;"><br></div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;">(1) On Windows, running Autodock Vina in Chimea using local executable fails due to spaces in file path (gives error something like "File "C:\Program" not found). The thing is, the university computer admins do not allow change paths or copy system files around. It should be possible to escape spaces in file names, wouldn't it?</div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;"><br></div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;">(2) The selection of submodels does not work if it is used as a part of the list. For example,</div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;"><br></div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;">"sel #1.1" selects just the submodel 1 (let's say I have a set of 20 molecules in sdf file), which is fine, while "sel #1.1,#0" selects ALL submodels in #1 in addition to #0, and that does not seem to be right.</div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;"><br></div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;">Best regards,</div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;"><br></div><div class="ydpa050439yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;">Visvaldas<br></div></body></html>