<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#000000">Dear Dr.</font><div><font face="arial, helvetica, sans-serif" color="#000000"><br></font></div><div><font color="#000000"><font face="arial, helvetica, sans-serif">I am using <span class="gmail-il">Chimera</span> software(windows platform). I tried to get rmsd graph(</font>using the plotting in the MD Movie trajectory viewer)<span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">. And I got the result. But, graph's x-axis "</span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">frame</span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">" and y-axis "</span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">rmsd</span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">" value. I want the x axis to be the "</span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">time</span><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">".  Briefly, I want to see how the value of rmsd changes with time.</span></font></div><div><font color="#000000"><font face="arial, helvetica, sans-serif"><b>I added files to the e-mail. Can you explain what "1001 frames" mean? And how do I convert "1001 frames" to time. I want to see the RMSD change by time.</b></font><br></font></div><div><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">Can you help with this? Could you explain in detail?<br></font></div><div><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif">Best regard</font></div><div><font color="#000000" face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font></div><h3 class="gmail-r" style="margin:0px;padding:0px;overflow:hidden;text-overflow:ellipsis"><font size="2" face="arial, helvetica, sans-serif" style="font-weight:normal" color="#000000"><span style="white-space:nowrap">Assoc Prof. Dr. </span>Sefa Celik</font></h3></div></div></div>