<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I am new to chimera. I want to superimpose a domain for the two protein molecules and get the rmsd for the non superimposed protein parts. How should i do it. Ihave superimposed domain of interest for my protein using match, but now i am not getting how to proceed further.</div><div><br></div><div>Thanks<br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Vani Pande<div>Int PhD Biological sciences</div><div>IISER Pune</div><div>20162013</div></div></div></div></div></div></div></div>