<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Hello again, <div><br></div><div>Following another old thread, </div><div><br></div><div><a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2016-September/012743.html">http://plato.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2016-September/012743.html</a><br></div><div><br></div><div>I could morph/play the coordinates and Volume at the same time. The script is given below. </div><div><br></div><div><div>----------------------------------------------------</div><div># Open maps and set threshold</div><div>open 1.mrc</div><div>open 2.mrc</div><div>open  start_full.pdb</div><div>open end_full.pdb</div><div><br></div><div>vol #0,1 level .025</div><div><br></div><div># Create a marker for coloring</div><div>measure center #2 mark true radius 20 color red</div><div>~display #4</div><div><br></div><div># Create morph volume</div><div>vop morph #0,1 frames 0 model #5</div><div><br></div><div># Create morph models  model #6</div><div>morph  start #2 frames 200</div><div>morph interpolate #3  frames 200</div><div>morph movie</div><div><br></div><div># marker on morph</div><div>measure center #6 mark true radius 20 color red</div><div><br></div><div># Color near marker</div><div>scolor #5 zone #6 range 50</div><div><br></div><div>coordset #6 1,100; vop morph #0,1 start 0 playstep 0.01 frames 100 model #6</div></div><div>----------------------------------------------------<br></div><div><br></div><div><br></div><div>Still the color is at centre of of the first Frame of morph.  If I understand correct I have to measure the centre for each Frame and  add marker and color it. But I still can't make it. Any help/directions in this regard would be very helpful.  </div><div><br></div><div>Thanks in advance for your time and help.</div><div><br></div><div>best regards</div><div>Rajan </div><div><br></div></div></div></div></div>