Hi all,<div id="yMail_cursorElementTracker_1527797969796">As mentioned you can use pdb Editor to change the residue numbers.<br id="yMail_cursorElementTracker_1527797961507"><br><div id="ymail_android_signature"><a href="https://overview.mail.yahoo.com/mobile/?.src=Android">Sent from Yahoo Mail on Android</a></div> <br> <blockquote style="margin: 0 0 20px 0;"> <header style="font-family:Roboto, sans-serif; color:#6D00F6;"> <div>On Thu, May 31, 2018 at 9:03 PM, Elaine Meng</div><div><meng@cgl.ucsf.edu> wrote:</div> </header> <div style="padding: 10px 0 0 20px; margin: 10px 0 0 0; border-left: 1px solid #6D00F6;"> Hi Divita,<br clear="none">I believe you just have to text-edit the PDB file to change the residue number if other atoms already have that same residue number.  As you said, “bond” only adds the bond without changing any numbering.<br clear="none">Best,<br clear="none">Elaine<br clear="none">-----<br clear="none">Elaine C. Meng, Ph.D.<br clear="none">UCSF Chimera(X) team<br clear="none">Department of Pharmaceutical Chemistry<br clear="none">University of California, San Francisco<br clear="none"><div class="yQTDBase yqt3369200834" id="yqtfd96616"><br clear="none">> On May 31, 2018, at 8:42 AM, Divita Mathur, Contractor Code 6910, FN <<a shape="rect" ymailto="mailto:divita.mathur.ctr.in@nrl.navy.mil" href="mailto:divita.mathur.ctr.in@nrl.navy.mil">divita.mathur.ctr.in@nrl.navy.mil</a>> wrote:<br clear="none">> <br clear="none">> Hi Elaine<br clear="none">> <br clear="none">> Thank you for your response. I am using the bond function to bind a molecule to DNA. But the bond function is not changing the residue number of the new molecule (which has a residue number 1), which is causing issues (as there is base #1 in the DNA). So far I am editing the pdb file as a text document like you said, but I was just wondering if there was another way.<br clear="none">> <br clear="none">> Thank you, again! The Split function is working for me!<br clear="none"><br clear="none"><br clear="none">_______________________________________________<br clear="none">Chimera-users mailing list: <a shape="rect" ymailto="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br clear="none">Manage subscription: <a shape="rect" href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" target="_blank">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a><br clear="none"></div> </div> </blockquote></div>