<div dir="ltr"><div><div><div><div>Hello!<br></div>Yes, after the error I was trying several times to repeat the experiment, which could have made the problem worse.<br></div>As you said, today I tried again (after one day) and the docking completed succesfully!<br></div>Thank you very much for your help.<br></div>Arturo Estolano Cobián<br></div><div id="DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2"><br> <table style="border-top:1px solid #d3d4de">
        <tr>
      <td style="width:55px;padding-top:18px"><a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=webmail" target="_blank"><img src="https://ipmcdn.avast.com/images/icons/icon-envelope-tick-round-orange-animated-no-repeat-v1.gif" alt="" width="46" height="29" style="width: 46px; height: 29px;"></a></td>
                <td style="width:470px;padding-top:17px;color:#41424e;font-size:13px;font-family:Arial,Helvetica,sans-serif;line-height:18px">Libre de virus. <a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=webmail" target="_blank" style="color:#4453ea">www.avast.com</a>               </td>
        </tr>
</table>
<a href="#DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2" width="1" height="1"></a></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2018-03-26 9:43 GMT-07:00 Elaine Meng <span dir="ltr"><<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Arturo, Simon, and Sofia,<br>
The message in Arturo’s question below says it is not a Chimera error, but a limit of the Autodock Vina web service, which is run by a different group (as mentioned in the help page, <<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/vina/vina.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.rbvi.ucsf.edu/<wbr>chimera/docs/<wbr>ContributedSoftware/vina/vina.<wbr>html</a>>).<br>
<br>
We do not have direct control over this web service.  My guess from reading the message is that there are too many job attempts (>99) causing the error, so I would wait a while and then try again.  Trying again immediately or lots of times may make the problem worse.  However, this is just a guess, so if you ALWAYS get the same message, maybe there is some other problem.<br>
<br>
Just now I tried running an Autodock Vina job on the web service and it completed successfully.<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Chimera(X) team<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
> On Mar 25, 2018, at 8:01 PM, Arturo Estolano Cobián <<a href="mailto:estolano.arturo@uabc.edu.mx">estolano.arturo@uabc.edu.mx</a>> wrote:<br>
><br>
> Dear Chimera Help Desk,<br>
> I have a problem while running molecular docking on Chimera.<br>
> After running Tools --> Surface/Binding Analysis --> AutoDock Vina, I do not get the results from the docking analysis.<br>
> I get the regular name.receptor.pdb , name.receptor.pdbqt , name.ligand.pdb , name.ligand.pdbqt and name.conf  files, but the name file (the docking results) does not generate.<br>
><br>
> In the Reply Log I found this, which I assume is involved in the problem:<br>
><br>
> standard error<br>
> -----<br>
><br>
> Unable to initialize environment because of error: cannot register event client. Only 99 event clients are allowed in the system<br>
> Exiting.<br>
> -----<br>
> Traceback (most recent call last):<br>
>   File "C:\Program Files (x86)\Chimera 1.11.2\share\chimera\tasks.py"<wbr>, line 179, in runStatusCB<br>
>     task.statusCBList[0]()<br>
>   File "C:\Program Files (x86)\Chimera 1.11.2\share\WebServices\<wbr>appWebService.py", line 171, in statusCB<br>
>     self.finishCB(self.backend, fileMap)<br>
>   File "C:\Program Files (x86)\Chimera 1.11.2\share\vina\ws.py", line 179, in _wsFinish<br>
>     raise NonChimeraError("No data file returned from "<br>
> NonChimeraError: No data file returned from AutoDock Vina web service<br>
><br>
><br>
> And I can't find how to solve this and get the results from the docking experiments I'm doing.<br>
> Can you please help me solve this problem?<br>
> Thank you in advance for your attention.<br>
> Arturo Estolano Cobián<br>
<br>
</blockquote></div><br></div>