<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">Ok, I confess, there is no way of knowing whether sequential stereo, row interleaved, top/bottom, left/right or some other format for presenting the two eye images is needed without knowing what the display hardware requires.  Display hardware can potentially use any of those formats.  Chimera allows the sequential and row interleaved options but not top/bottom or left/right which stack the two eye images vertically or horizontally into a single image.<div class=""><br class=""></div><div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">       </span>Tom</div><div class=""><br class=""><div><br class=""><blockquote type="cite" class=""><div class="">On Mar 21, 2018, at 11:34 AM, David Bhella  wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class="">

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252" class="">

<div dir="auto" class="">
Should that be row-interleaved for polarised glasses, and sequential stereo for shutter glasses?
<div class="">D<br class="">
<br class="">
<div class="">Sent from my iPhone</div>
<div class=""><br class="">
On 21 Mar 2018, at 18:14, Tom Goddard <<a href="mailto:goddard@sonic.net" class="">goddard@sonic.net</a>> wrote:<br class="">
<br class="">
</div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">Hi Cenk,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">  Chimera can display 3D stereo using polarized glasses.  You use the “sequential stereo” option for “Camera Mode” in the Tools / Viewing Controls / Camera.  You will of course need the hardware to be able to enable that mode — a workstation graphics
 card that can do quad-buffered stereo and a polarized display — but if you have all that working for other 3D applications then Chimera should work too.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"></span>Tom</div>
<div class=""><br class="">
<div class=""><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Mar 20, 2018, at 8:42 AM, Williams, Joanne  wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(181, 196, 223); padding: 3pt 0in 0in;" class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">From:<span class="Apple-converted-space"> </span></span></b><span style="font-size: 12pt;" class="">"Ahmet Cenk ANDAC, ISU" <br class="">
<b class="">Date:<span class="Apple-converted-space"> </span></b>Monday, March 19, 2018 at 5:28 PM<br class="">
<b class="">To:<span class="Apple-converted-space"> </span></b>"<a href="mailto:chimera@cgl.ucsf.edu" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">chimera@cgl.ucsf.edu</a>" <<a href="mailto:chimera@cgl.ucsf.edu" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">chimera@cgl.ucsf.edu</a>><br class="">
<b class="">Subject:<span class="Apple-converted-space"> </span></b>Question about 3D visualization by chimera<o:p class=""></o:p></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div id="divtagdefaultwrapper" class="">
<div class=""><a name="_MailOriginalBody" class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">Hi! <o:p class=""></o:p></span></a></div>
<div class=""><span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">I was wondering if it would be possible to view 3D projections of molecules in chimera using polarized glasses?<o:p class=""></o:p></span></span></div>
<div class=""><span class=""><span style="font-size: 12pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></span></div>
<div class=""><span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">If not, would the Chimera team consider adding such feature in the next release of chimera?<o:p class=""></o:p></span></span></div>
<div class=""><span class=""><span style="font-size: 12pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></span></div>
<div class=""><span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">Thanks,,<o:p class=""></o:p></span></span></div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">Cenk Andac, M.S., M.S., Ph.D., Head, Chair<o:p class=""></o:p></span></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">Asst. Professor of Medicinal Chemistry<o:p class=""></o:p></span></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">Head of Pharmaceutical Sciences Division<o:p class=""></o:p></span></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">Chair of Medicinal Chemistry Department<o:p class=""></o:p></span></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class="">School of Pharmacy, Istinye University, Zeytinburnu-Istanbul, TURKIYE<o:p class=""></o:p></span></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class=""><a href="http://eczacilik.istinye.edu.tr/akademik-kadro/ahmet-cenk-andac.shtml" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">http://eczacilik.istinye.edu.tr/akademik-kadro/ahmet-cenk-andac.shtml</a></span></span></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span class=""><span style="font-size: 12pt;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></span></div>
</div>
</div>
</div>
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">Chimera-users
 mailing list:<span class="Apple-converted-space"> </span></span><a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">Manage
 subscription:<span class="Apple-converted-space"> </span></span><a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a></div>
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<br class="">
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<blockquote type="cite" class="">
<div class=""><span class="">_______________________________________________</span><br class="">
<span class="">Chimera-users mailing list: <a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" class="">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a></span><br class="">
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