<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">

</head>

<body>

<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt;">

<div class="PlainText">Hello,<br>

<br>

I’m Liyana, a PhD student from University of Glasgow. I’m using Chimera to dock my low resolution cryo-EM map to my pdb file, where the EM map represents a helical oligomeric form of the pdb file.

<br>

So far, I’ve made multiple copies of my pdb and fitted it against my EM map and now I’m trying to save my multiple files as one file.

<br>

<br>

I’ve referred to this message on the Chimera mailing list (<a href="http://www.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2014-May/009926.html">www.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2014-May/009926.html</a>) and tried saving my files via ‘Save PDB’ and combining

 my files to one file. However, I couldn’t upload this on PyMOL or any other programs for subsequent analysis. Is there something wrong with my file? Attached is my file after using instruction A.<br>

</div>

</span></font></div>

<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt;">

<div class="PlainText"><br>

<br>

I’ve also tried combining my files using the ‘combined’ feature but still get the same problem. Attached is my file after using instruction B.

<br>

</div>

</span></font></div>

<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt;">

<div class="PlainText"><br>

<br>

Could you have a look at these files, please? Thank you for your time.<br>

<br>

Best wishes,<br>

Liyana<br>

<br>

 </div>

</span></font></div>

</body>

</html>