<div dir="ltr">Thank you very much!<div><br></div><div>regards,</div><div>Jianhao</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2017-12-01 17:28 GMT+08:00 Gabor PAPAI <span dir="ltr"><<a href="mailto:papai@igbmc.fr" target="_blank">papai@igbmc.fr</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div style="word-wrap:break-word">
Hi Jianhao,
<div><br>
</div>
<div>You have to untick the “cap high values at box faces” to see surfaces bellow 0 threshold. You can find this option in Volume Viewer -> Features -> Surface and Mesh options at the bottom of the panel.</div>
<div><br>
</div>
<div>Best regards,</div>
<div>Gabor<br>
<div><span class="m_5173381442748823255Apple-style-span" style="border-collapse:separate;color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica;font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:-webkit-auto;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px"><span class="m_5173381442748823255Apple-style-span" style="border-collapse:separate;color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica;font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:-webkit-auto;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px">
<div style="word-wrap:break-word">
---<br>
Gabor Papai<br>
IGBMC<br>
Integrated Structural Biology<br>
<a href="https://maps.google.com/?q=1,+rue+Laurent+Fries&entry=gmail&source=g">1, rue Laurent Fries</a>, Bp 10142<br>
67404 Illkirch, France<br>
Tel: <a href="tel:+33%203%2069%2048%2052%2088" value="+33369485288" target="_blank">+33-3-69485288</a></div>
</span></span></div>
<br>
<div>
<blockquote type="cite"><div><div class="h5">
<div>On 1 Dec 2017, at 4:43 , C.J. <<a href="mailto:biocjh@gmail.com" target="_blank">biocjh@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="m_5173381442748823255Apple-interchange-newline">
</div></div><div><div><div class="h5">
<div dir="ltr">Hi specialists,
<div><br>
</div>
<div>I have a problem when adjusting the level of a map. If the level > 0, it seemed OK, but when it is less than 0, it showed a solid box. This is different from EMAN2. In EMAN2, the threshold less than 0 also works. I'm not sure whether the defining
 of level is the same as the threshold in EMAN2. Or is there any other way to show the density of a map as in EMAN2 with threshold less than 0? </div>
<div>Some snapshots of the visualization in both programs are attached to the post.</div>
<div>Thank you!</div>
<div><br>
</div>
<div><br clear="all">
<div>regards,<br>
</div>
<div>Jianhao</div>
</div>
</div>
</div></div><span id="m_5173381442748823255cid:2D563FC3-8A49-4199-B881-4B43CC935C20@igbmc.u-strasbg.fr"><7a.png></span><span id="m_5173381442748823255cid:A14DBC1B-0B00-47C5-B7A0-4C4258F99495@igbmc.u-strasbg.fr"><7b.png></span><span id="m_5173381442748823255cid:13C9256D-008E-4598-88B7-08F8F9530E3E@igbmc.u-strasbg.fr"><10a.png></span><span id="m_5173381442748823255cid:59F6F255-D465-4A6E-A477-8E275A645D11@igbmc.u-strasbg.fr"><10b.<wbr>png></span>__________________________<wbr>_____________________<br>
Chimera-users mailing list: <a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">
Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
Manage subscription: <a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" target="_blank">
http://plato.cgl.ucsf.edu/<wbr>mailman/listinfo/chimera-users</a><br>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div>Best regards!</div><div>C.J.</div></div></div></div>
</div>