<div dir="ltr"><img width="0" height="0" class="mailtrack-img" alt="" style="display:flex" src="https://mailtrack.io/trace/mail/48e83897ede6640ade45690300da8eec39864daa.png?u=1287386"><span style="font-size:12.8px">Hello,</span><div style="font-size:12.8px">I have installed chimera in ubuntu 14.04..</div><div style="font-size:12.8px">I am finding difficult to get the .pdb format for diglyicne peptide (and further to create the topology and run the simulation in gromacs)... </div><div style="font-size:12.8px">1] If in Build Structure i select PubChem CID and type 11163 (Diglycine PubChem CID) i am getting error as:-</div><div style="font-size:12.8px">Error fetching 11163:[Errno socket error] [SSL: CERTIFICATE_VERIFY_FAILED] certificate verify failed (_ssi.c:590)<br clear="all"><div>2] I even tried through File - Fetch by ID - Pubchem and typed 1163 (Diglycine PubChem CID).. but in vain..i am getting the same error..</div><div><br></div><div>So can anybody kindly help....i am a novice here..</div><div>Any suggestions are highly appreciated..</div><div><br></div><div>Thank you... </div></div><br><br><br><div style="display:inline">
            <div class="mt-signature" style="padding-right:5px;color:initial">
                <a href="https://mailtrack.io/" class="mt-signature-logo" style="text-decoration:none">
                    <img src="https://s3-eu-west-1.amazonaws.com/mailtrack-crx/icon-signature.png" height="14">
                </a>
                <span style="color:rgb(153,153,153)">Sent with </span>
                <a href="https://mailtrack.io/install?source=signature&lang=en&referral=cy16f01.dilip@nitk.edu.in&idSignature=22" class="mt-install">Mailtrack</a>
                
            </div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Aug 20, 2017 at 11:15 PM, Dilip H N <span dir="ltr"><<a href="mailto:cy16f01.dilip@nitk.edu.in" target="_blank">cy16f01.dilip@nitk.edu.in</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><img width="0" height="0" class="m_-7742111250559486655mailtrack-img" alt="" style="display:flex" src="data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7">Hello,<div>I have install chimers in ubuntu 14.04..</div><div>I am finding difficult to get the .pdb format for diglyicne peptide... </div><div>1] If in Build Structure i select PubChem CID and type 11163 (Diglycine PubChem CID) i am getting error as:-</div><div>Error fetching 11163:[Errno socket error] [SSL: CERTIFICATE_VERIFY_FAILED] certificate verify failed (_ssi.c:590)<br clear="all"><div>2] I even tried through File - Fetch by ID - Pubchem and typed 1163 (Diglycine PubChem CID).. but in vain..i am getting the same error..</div><div><br></div><div>So can anybody kindly help....i am a novice here..</div><div><br></div><div>Thank you...</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">-- <br><div class="m_-7742111250559486655gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">With Best Regards,<div><br></div><div>DILIP.H.N<div>Ph.D Student</div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><br><br><div style="display:inline">
            <div class="m_-7742111250559486655mt-signature" style="padding-right:5px;color:initial">
                <a href="https://mailtrack.io/" class="m_-7742111250559486655mt-signature-logo" style="text-decoration:none" target="_blank">
                    <img src="https://s3-eu-west-1.amazonaws.com/mailtrack-crx/icon-signature.png" height="14">
                </a>
                <span style="color:rgb(153,153,153)">Sent with </span>
                <a href="https://mailtrack.io/install?source=signature&lang=en&referral=cy16f01.dilip@nitk.edu.in&idSignature=22" class="m_-7742111250559486655mt-install" target="_blank">Mailtrack</a>
                
            </div></div></font></span></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">With Best Regards,<div><br></div><div>DILIP.H.N<div>Ph.D Student</div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>