<div dir="ltr">sir/mam,<div>i want to use chimera Match->Align feature using the commandline or nogui script (python) to align multiple protein sequences (pdb files) to generate the alignment on MultiAlignViewer and save it as clustal (.aln) file.¬†</div><div>I tried out the python codes posted on the portals but non of them are giving proper alignment.</div><div>kindly advice as to what i can do? Is there any commandline available for it?</div><div>Thanking You</div><div>Sincere User¬†</div></div>