<div dir="ltr">Hello Elaine, and thanks as always for your reply. I will give it a try tomorrow. I hope I will get a good animation and I will also post the making of. Giorgio</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Il giorno gio 9 mar 2017 alle ore 21:53 Elaine Meng <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>> ha scritto:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Giorgio,<br class="gmail_msg">
You would still have to use the “export” command that exports one file at a time, but it can be run at every frame by combining it with the “perframe” command.<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
For example, in Chimera the following (should be all one line even though the Mail app may break it up):<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
perframe "export ~/temp/$1.x3d" zero 2; play wiggle #0 24-67,68-119,123-244,267-286,290-355,356-387 50; wait 50; ~perframe<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
…where ~/temp is a directory that already exists, will make files 01.x3d …. 50.x3d in that directory.<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
In ChimeraX, there is a “perframe” command and “save” to export X3D, but no “play wiggle” command.<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
<<a href="http://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/index.html#commands" rel="noreferrer" class="gmail_msg" target="_blank">http://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/index.html#commands</a>><br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
I hope this helps,<br class="gmail_msg">
Elaine<br class="gmail_msg">
----------<br class="gmail_msg">
Elaine C. Meng, Ph.D.<br class="gmail_msg">
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br class="gmail_msg">
Department of Pharmaceutical Chemistry<br class="gmail_msg">
University of California, San Francisco<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
> On Mar 9, 2017, at 11:44 AM, Giorgio Luciano <<a href="mailto:giorgio.luciano@gmail.com" class="gmail_msg" target="_blank">giorgio.luciano@gmail.com</a>> wrote:<br class="gmail_msg">
><br class="gmail_msg">
> Thanks for the info and sorry for my late reply. I generally export using x3d what I was thinking about is, how can someone export the single model for an animation ? As an example if I make wiggle a molecule play (wiggle #0 24-67,68-119,123-244,267-286,290-355,356-387 200 ) may I export in batch the molecules for the single frame ?<br class="gmail_msg">
> Any help will be greatly appreciated :)<br class="gmail_msg">
><br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
</blockquote></div>