<div dir="ltr"><div><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-6269092486983609051gmail-m_-1822924610079179137gmail-m_-9155431133632323754gmail-m_4443893304216409364gmail-m_3464627811716747873gmail-m_5245889333276729367gmail-m_-3748480531675352771gmail-m_-4863798370699034306gmail-authors__name">hi everyone</span><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-6269092486983609051gmail-m_-1822924610079179137gmail-m_-9155431133632323754gmail-m_4443893304216409364gmail-m_3464627811716747873gmail-m_5245889333276729367gmail-m_-3748480531675352771gmail-m_-4863798370699034306gmail-authors__name">,<br></span><br><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-">I work on the 
modeling of the effect of phosphorylation on segment peptide.<br><br></span></span></span></span></span></span></div><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-"><span id="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-">I had a problem when i use this interface</span></span></span></span></span></span></span></span></span></span><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-"><span id="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span lang="EN">
MMTK/Chimera interface</span> because</span></span></span></span></span></span></span></span></span></span><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-"><span id="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_5169742303401097098gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-"> when i use a doubly phosphorylated peptide i have this message:</span></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br><br></span></span></span></span></span></span><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-"><span id="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-result_box" class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-1031702903281365464gmail-m_-3156434528442845077gmail-m_-2574659677157112582gmail-"></span></span></span></span></span></span>KeyError: 'No parameters for bond Atom 0.ARG_12__0_0_1_286__B.<wbr>peptide.C (atom type C) - Atom 0.TPO_13__0_0_1_287__B.N (atom type n)'<br><br><span id="gmail-result_box" class="gmail-" lang="en"><span class="gmail-">You will find attached a sample problem source file.</span></span><br><span id="gmail-result_box" class="gmail-short_text" lang="en"><span class="gmail-"><br>Is there anyone who can help me solve this problem please.<br></span></span><br><span id="gmail-m_-3310940489909920383gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-m_4443893304216409364gmail-m_3464627811716747873gmail-m_5245889333276729367gmail-m_-3748480531675352771gmail-result_box" class="gmail-m_-3310940489909920383gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-m_4443893304216409364gmail-m_3464627811716747873gmail-m_5245889333276729367gmail-m_-3748480531675352771gmail-" lang="en"><span class="gmail-m_-3310940489909920383gmail-m_-2592002649855893468gmail-m_-9155431133632323754gmail-m_4443893304216409364gmail-m_3464627811716747873gmail-m_5245889333276729367gmail-m_-3748480531675352771gmail-">Codially</span></span></div>