<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=utf-8" http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <p>Dear Elaine, <br>
    </p>
    <p>thanks a lot for your promptest response!<br>
    </p>
    I followed your advice and managed to get the problem solved by
    installing the last overnight upgrade.<br>
    <br>
    Best regards,<br>
    Xavier<br>
    <br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 5/2/17 18:26, Elaine Meng wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
      cite="mid:832FF4F6-FF08-467C-BAA4-5638D650F360@cgl.ucsf.edu"
      type="cite">
      <blockquote type="cite">
        <pre wrap="">-------- Forwarded Message --------
Subject:        Upgrade to Sierra
Date:   Sun, 5 Feb 2017 17:58:53 +0100
From:   F.Xavier Gomis-Rüth <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:fxgr@ibmb.csic.es"><fxgr@ibmb.csic.es></a>

Dear Elaine,
I recently had to upgrade to Sierra from Mountain Lion and now I find that ions are displayed as black spheres only
in Chimera v. 1.9. Any ideas on what I should change?
Kind regards,
Xavier
</pre>
      </blockquote>
      <pre wrap="">
</pre>
      <blockquote type="cite">
        <pre wrap="">On Feb 5, 2017, at 9:11 AM, F.Xavier Gomis-Rüth <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:fxgr@ibmb.csic.es"><fxgr@ibmb.csic.es></a> wrote:

Elaine, it's not only the ions, its all the atoms and bonds.
Ribbon appear fine though....

</pre>
      </blockquote>
      <pre wrap="">
Dear Xavier,
I’m not an expert on this kind of thing, so I’m forwarding to the chimera-users list.

(Sending to the list is always recommended… I will still answer it if I can, just as fast!)

Although I don’t know if it’s related, maybe you should get a newer version of Chimera. Using Chimera versions 1.11.2 and 1.12 daily build on both a laptop and a desktop running Sierra, I do not have this problem. 

Best,
Elaine
-----
Elaine C. Meng, Ph.D.                       
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab
Department of Pharmaceutical Chemistry
University of California, San Francisco



</pre>
    </blockquote>
    <br>
    <div class="moz-signature">-- <br>
      <img src="cid:part1.1B7DFF71.B0ADD11F@ibmb.csic.es" border="0"></div>
  </body>
</html>