<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Dear Elaine<br><br>Thanks again for prompt reply.<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Here you talking about RAM or system home memory where chimera install. <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Regards<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif">Rahman <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif"><br> <br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''<br><font size="1"><span style="font-family:verdana,sans-serif"><b>M</b><font size="1" style="font-weight:bold">d</font><b> H</b><font size="1" style="font-weight:bold">omaidur</font><b> R</b><font size="1"><b>ahman  </b>( </font>Research Scholar )<br>Lab No. 510, Computational Biophysics Lab. <br>Department of Biotechnology </span></font></div><div dir="ltr"><font size="1"><span style="font-family:verdana,sans-serif">Indian Institute of Technology-Madras<br>Chennai-600 036, India<br><b style="color:rgb(0,0,153)">Mobile No  = +91- 7845991785</b></span></font></div><div>'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''<br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Fri, Jan 13, 2017 at 10:31 PM, Elaine Meng <span dir="ltr"><<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Rahman,<br>
Unfortunately as far as I know you cannot do much, other than to use the best system (newer computer with more memory) that is available to you.  We realize that Chimera is slow on very large structures and datasets, and we are developing the new program ChimeraX for high-performance rendering of large structures.  However, ChimeraX is still in early development and does not have a tool like MD Movie or support for reading the gromacs files.<br>
Regards,<br>
Elaine<br>
<span class="im HOEnZb">-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
</span><div class="HOEnZb"><div class="h5">On Jan 12, 2017, at 10:57 PM, MOHD HOMAIDUR RAHMAN <<a href="mailto:rahmanhpu@gmail.com">rahmanhpu@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
> Dear Elaine<br>
><br>
> Thank you very much this is working for me.<br>
> I am always facing problem, when I am using chimera for bigger system like virus or large no of proteins in my systems.<br>
> Is there any special taking care needed during installation?<br>
> ​What we will do to improve speed, for example I am able to load gromacs TPR and XTC file but unable to rotate or zoom in/out of my system.<br>
> Thanks & regards<br>
> Rahman​<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>